127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4542 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4542  putative tyrosine protein phosphatase  100 
 
 		 265 aa  523  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2377  protein tyrosine/serine phosphatase  42.34 
 
 		 636 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188756 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3587  protein tyrosine/serine phosphatase  41.39 
 
 		 316 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000929077 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1877  protein tyrosine/serine phosphatase  41.7 
 
 		 637 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.880378 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4624  protein tyrosine/serine phosphatase  37.84 
 
 		 292 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.81745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2785  protein tyrosine/serine phosphatase  40.94 
 
 		 321 aa  162  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0371  protein tyrosine/serine phosphatase  39.84 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3997  protein tyrosine/serine phosphatase  42 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0144957 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2362  protein tyrosine/serine phosphatase  39.67 
 
 		 244 aa  142  8e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0718  protein tyrosine/serine phosphatase  36.86 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4857  protein tyrosine/serine phosphatase  37.64 
 
 		 266 aa  129  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0719  protein tyrosine/serine phosphatase  37.04 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3316  protein tyrosine/serine phosphatase  38.35 
 
 		 265 aa  125  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.367248  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3159  protein tyrosine/serine phosphatase  39.71 
 
 		 302 aa  125  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0124414 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0804  protein tyrosine/serine phosphatase  36.55 
 
 		 275 aa  123  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal  0.36802 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3082  protein tyrosine/serine phosphatase  34.85 
 
 		 295 aa  122  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3617  autotransporter beta-domain-containing protein  38.04 
 
 		 671 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0245  protein tyrosine/serine phosphatase  31.69 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3362  protein tyrosine/serine phosphatase  37.55 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0548  protein tyrosine/serine phosphatase  35.66 
 
 		 344 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2183  Protein tyrosine/serine phosphatase-like protein  37.17 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663845  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0543  protein tyrosine/serine phosphatase  28.9 
 
 		 306 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4313  protein tyrosine/serine phosphatase  35.39 
 
 		 247 aa  108  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4923  protein tyrosine/serine phosphatase  33.97 
 
 		 345 aa  108  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0885  protein tyrosine/serine phosphatase  38.59 
 
 		 275 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772986 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0097  protein tyrosine/serine phosphatase  35.14 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0106  protein tyrosine/serine phosphatase  35.14 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32864 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3383  protein tyrosine/serine phosphatase  34.23 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000524951  hitchhiker  0.000566628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  35.14 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3134  hypothetical protein  36.4 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.93159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1779  protein tyrosine/serine phosphatase  32.57 
 
 		 260 aa  102  7e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4511  protein tyrosine/serine phosphatase  36.84 
 
 		 250 aa  99  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1731  protein tyrosine phosphatase  30.12 
 
 		 264 aa  99.4  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0115  protein tyrosine/serine phosphatase  34.43 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3890  protein tyrosine/serine phosphatase  34.47 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3163  protein tyrosine/serine phosphatase  35.55 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2360  protein tyrosine/serine phosphatase  34.8 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10154  phosphotyrosine protein phosphatase ptpb  34.4 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0646  protein tyrosine/serine phosphatase  28.91 
 
 		 316 aa  97.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3645  hypothetical protein  30.53 
 
 		 274 aa  96.7  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4351  protein tyrosine/serine phosphatase  30.99 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0735  protein tyrosine/serine phosphatase  34.5 
 
 		 266 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3949  protein tyrosine/serine phosphatase  29.96 
 
 		 281 aa  95.5  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1528  protein tyrosine/serine phosphatase  35.59 
 
 		 273 aa  95.5  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0175  protein tyrosine/serine phosphatase  34.96 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3861  protein tyrosine/serine phosphatase  37.98 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2208  hypothetical protein  28.02 
 
 		 332 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.797475  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1578  protein tyrosine/serine phosphatase  29.23 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0553  protein tyrosine/serine phosphatase  33.06 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371687  normal  0.150838 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0188  protein tyrosine/serine phosphatase  30.43 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3073  protein tyrosine/serine phosphatase  30.08 
 
 		 342 aa  93.6  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.810774  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1268  protein tyrosine/serine phosphatase  35.91 
 
 		 251 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.321151 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4066  protein tyrosine/serine phosphatase  30.58 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3931  protein tyrosine/serine phosphatase  29.8 
 
 		 260 aa  92.8  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3371  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.69 
 
 		 340 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.004022  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2344  protein tyrosine/serine phosphatase  32.32 
 
 		 262 aa  92.4  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3369  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.69 
 
 		 340 aa  92  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3134  protein-tyrosine-phosphatase  29.69 
 
 		 340 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.809037  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1747  protein tyrosine/serine phosphatase  29.28 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000126573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4203  protein tyrosine/serine phosphatase  33.72 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3348  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.77 
 
 		 339 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2126  protein tyrosine/serine phosphatase  29.62 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1882  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.36 
 
 		 339 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3147  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.3 
 
 		 340 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.761513  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3041  protein-tyrosine-phosphatase  29.3 
 
 		 340 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3394  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.3 
 
 		 340 aa  90.1  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1919  hypothetical protein  29.46 
 
 		 319 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0267  hypothetical protein  28.52 
 
 		 289 aa  90.1  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1239  protein tyrosine/serine phosphatase  32.17 
 
 		 261 aa  89.4  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.030043  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3365  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.36 
 
 		 340 aa  89  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.788719  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27240  protein tyrosine/serine phosphatase  31.68 
 
 		 269 aa  89  8e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1131  protein tyrosine/serine phosphatase  33.19 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0698  protein tyrosine/serine phosphatase  29.43 
 
 		 306 aa  86.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.456776  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0136  protein tyrosine/serine phosphatase  33.98 
 
 		 295 aa  85.5  8e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0410  protein tyrosine/serine phosphatase  30.8 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.93291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4145  protein tyrosine/serine phosphatase  27.45 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377709  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02130  protein tyrosine/serine phosphatase  28.74 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.393393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1241  hypothetical protein  32 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2661  protein tyrosine/serine phosphatase  34.26 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000022841  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0660  protein tyrosine/serine phosphatase  30.08 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107087  hitchhiker  0.00669457 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1781  protein tyrosine/serine phosphatase  27.59 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000745544 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1050  protein tyrosine/serine phosphatase  26.97 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542198  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10864  conserved hypothetical protein  29.55 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0624  protein tyrosine/serine phosphatase  33.78 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3760  protein tyrosine/serine phosphatase  37.17 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.068638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2330  protein tyrosine/serine phosphatase  39.53 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0950011  normal  0.396609 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24750  protein tyrosine/serine phosphatase  32.1 
 
 		 315 aa  75.5  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0606708  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3550  protein tyrosine/serine phosphatase  30.12 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6870  protein tyrosine/serine phosphatase  35.71 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2040  protein tyrosine/serine phosphatase  31.78 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376683  hitchhiker  0.00700023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0027  protein tyrosine/serine phosphatase  28.51 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0332  protein tyrosine/serine phosphatase  24.7 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43096  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3678  protein tyrosine/serine phosphatase  29.51 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3477  protein tyrosine/serine phosphatase  38.12 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2017  protein tyrosine/serine phosphatase  32.17 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.166797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2349  protein tyrosine/serine phosphatase  31.6 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2109  protein tyrosine/serine phosphatase  28.76 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.636738  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4624  protein tyrosine/serine phosphatase  28.8 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  29.46 
 
 		 243 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2835  protein tyrosine/serine phosphatase  32.95 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.324515  normal  0.701373 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>