121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2330 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2330  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 		 233 aa  462  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0950011  normal  0.396609 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0698  protein tyrosine/serine phosphatase  40.68 
 
 		 306 aa  150  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.456776  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0804  protein tyrosine/serine phosphatase  41.18 
 
 		 275 aa  142  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal  0.36802 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0175  protein tyrosine/serine phosphatase  40 
 
 		 255 aa  126  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0553  protein tyrosine/serine phosphatase  40.5 
 
 		 254 aa  121  9e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371687  normal  0.150838 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3082  protein tyrosine/serine phosphatase  37.72 
 
 		 295 aa  119  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4203  protein tyrosine/serine phosphatase  34.82 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0410  protein tyrosine/serine phosphatase  35.95 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.93291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4313  protein tyrosine/serine phosphatase  36.29 
 
 		 247 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4624  protein tyrosine/serine phosphatase  35.9 
 
 		 349 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0718  protein tyrosine/serine phosphatase  37.35 
 
 		 269 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4511  protein tyrosine/serine phosphatase  38.4 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2360  protein tyrosine/serine phosphatase  35.22 
 
 		 250 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0332  protein tyrosine/serine phosphatase  32.03 
 
 		 263 aa  108  8.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43096  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1779  protein tyrosine/serine phosphatase  33.2 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4624  protein tyrosine/serine phosphatase  34.36 
 
 		 292 aa  104  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.81745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4857  protein tyrosine/serine phosphatase  34.55 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3041  protein-tyrosine-phosphatase  31.25 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3316  protein tyrosine/serine phosphatase  36.89 
 
 		 265 aa  102  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.367248  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2126  protein tyrosine/serine phosphatase  28.98 
 
 		 339 aa  102  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0885  protein tyrosine/serine phosphatase  36.07 
 
 		 275 aa  102  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772986 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0548  protein tyrosine/serine phosphatase  35.66 
 
 		 344 aa  102  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3163  protein tyrosine/serine phosphatase  36.6 
 
 		 264 aa  101  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0646  protein tyrosine/serine phosphatase  30.2 
 
 		 316 aa  101  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3073  protein tyrosine/serine phosphatase  31.56 
 
 		 342 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.810774  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2017  protein tyrosine/serine phosphatase  35.83 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.166797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3890  protein tyrosine/serine phosphatase  35.74 
 
 		 250 aa  99.4  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1528  protein tyrosine/serine phosphatase  36.4 
 
 		 273 aa  99.4  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3147  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.8 
 
 		 340 aa  99  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.761513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3394  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.8 
 
 		 340 aa  99  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3371  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.8 
 
 		 340 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.004022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3369  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.8 
 
 		 340 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4923  protein tyrosine/serine phosphatase  32.38 
 
 		 345 aa  98.6  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3365  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.8 
 
 		 340 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.788719  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3134  protein-tyrosine-phosphatase  30.8 
 
 		 340 aa  97.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.809037  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3348  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.8 
 
 		 339 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27240  protein tyrosine/serine phosphatase  36.57 
 
 		 269 aa  97.8  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3931  protein tyrosine/serine phosphatase  35.48 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4066  protein tyrosine/serine phosphatase  30.38 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1731  protein tyrosine phosphatase  30.57 
 
 		 264 aa  96.3  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0245  protein tyrosine/serine phosphatase  31.38 
 
 		 260 aa  95.9  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4351  protein tyrosine/serine phosphatase  29.11 
 
 		 260 aa  95.5  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1882  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.36 
 
 		 339 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0188  protein tyrosine/serine phosphatase  32.66 
 
 		 260 aa  94.4  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1578  protein tyrosine/serine phosphatase  29.82 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4542  putative tyrosine protein phosphatase  36.44 
 
 		 265 aa  92.8  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0127  protein tyrosine/serine phosphatase  31.3 
 
 		 267 aa  91.7  9e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000401238  hitchhiker  0.000000000048511 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1747  protein tyrosine/serine phosphatase  27.82 
 
 		 267 aa  90.9  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000126573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1877  protein tyrosine/serine phosphatase  34.27 
 
 		 637 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.880378 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2785  protein tyrosine/serine phosphatase  33.64 
 
 		 321 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  31.8 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0719  protein tyrosine/serine phosphatase  33.07 
 
 		 270 aa  89.4  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3159  protein tyrosine/serine phosphatase  35.5 
 
 		 302 aa  87.8  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0124414 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2040  protein tyrosine/serine phosphatase  32.91 
 
 		 270 aa  87  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376683  hitchhiker  0.00700023 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3550  protein tyrosine/serine phosphatase  29.71 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3362  protein tyrosine/serine phosphatase  35.34 
 
 		 265 aa  86.3  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2344  protein tyrosine/serine phosphatase  32.74 
 
 		 262 aa  85.5  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0561  protein tyrosine/serine phosphatase  34.55 
 
 		 279 aa  85.5  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1239  protein tyrosine/serine phosphatase  32.79 
 
 		 261 aa  85.1  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.030043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1781  protein tyrosine/serine phosphatase  27.07 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000745544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2377  protein tyrosine/serine phosphatase  32.39 
 
 		 636 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188756 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10864  conserved hypothetical protein  30.66 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3383  protein tyrosine/serine phosphatase  31.36 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000524951  hitchhiker  0.000566628 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0624  protein tyrosine/serine phosphatase  34.45 
 
 		 276 aa  81.6  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1689  protein tyrosine/serine phosphatase  29.83 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3587  protein tyrosine/serine phosphatase  33.78 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000929077 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3645  hypothetical protein  27.34 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4145  protein tyrosine/serine phosphatase  29.03 
 
 		 269 aa  78.6  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377709  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3949  protein tyrosine/serine phosphatase  26.82 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3760  protein tyrosine/serine phosphatase  29.27 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.068638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2835  protein tyrosine/serine phosphatase  30.49 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.324515  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0371  protein tyrosine/serine phosphatase  33.63 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3861  protein tyrosine/serine phosphatase  34.73 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2291  protein tyrosine/serine phosphatase  30 
 
 		 247 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0543  protein tyrosine/serine phosphatase  27.2 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0267  hypothetical protein  26.2 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3678  protein tyrosine/serine phosphatase  24.47 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1268  protein tyrosine/serine phosphatase  34.36 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.321151 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2183  Protein tyrosine/serine phosphatase-like protein  29.72 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663845  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0136  protein tyrosine/serine phosphatase  30 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3997  protein tyrosine/serine phosphatase  33.19 
 
 		 277 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0144957 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1131  protein tyrosine/serine phosphatase  31.65 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2208  hypothetical protein  25.89 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.797475  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1241  hypothetical protein  33.05 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2362  protein tyrosine/serine phosphatase  31.15 
 
 		 244 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0097  protein tyrosine/serine phosphatase  28.35 
 
 		 266 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0106  protein tyrosine/serine phosphatase  28.35 
 
 		 266 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  28.35 
 
 		 266 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0027  protein tyrosine/serine phosphatase  29.96 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2349  protein tyrosine/serine phosphatase  30.87 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10154  phosphotyrosine protein phosphatase ptpb  30.12 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02130  protein tyrosine/serine phosphatase  29.18 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.393393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1050  protein tyrosine/serine phosphatase  23.29 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0673  protein tyrosine/serine phosphatase  24.89 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00206907  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1919  hypothetical protein  25.99 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0115  protein tyrosine/serine phosphatase  31.56 
 
 		 266 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2109  protein tyrosine/serine phosphatase  35.2 
 
 		 298 aa  65.1  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.636738  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3134  hypothetical protein  40.87 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.93159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2661  protein tyrosine/serine phosphatase  29.96 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000022841  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3617  autotransporter beta-domain-containing protein  28.95 
 
 		 671 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>