127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4923 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4923  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 		 345 aa  680    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3082  protein tyrosine/serine phosphatase  38.93 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2183  Protein tyrosine/serine phosphatase-like protein  39.33 
 
 		 280 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663845  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0718  protein tyrosine/serine phosphatase  35.69 
 
 		 269 aa  129  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3147  protein-tyrosine phosphatase-like protein  31.88 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.761513  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3041  protein-tyrosine-phosphatase  31.59 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3394  protein-tyrosine phosphatase-like protein  31.88 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3371  protein-tyrosine phosphatase-like protein  31.88 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.004022  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3073  protein tyrosine/serine phosphatase  32.45 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.810774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3369  protein-tyrosine phosphatase-like protein  31.88 
 
 		 340 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3316  protein tyrosine/serine phosphatase  37.65 
 
 		 265 aa  126  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.367248  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3134  protein-tyrosine-phosphatase  31.59 
 
 		 340 aa  123  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.809037  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3348  protein-tyrosine phosphatase-like protein  33.13 
 
 		 339 aa  123  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3365  protein-tyrosine phosphatase-like protein  32.53 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.788719  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1877  protein tyrosine/serine phosphatase  34.12 
 
 		 637 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.880378 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1882  protein-tyrosine phosphatase-like protein  32.83 
 
 		 339 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0646  protein tyrosine/serine phosphatase  28.62 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2785  protein tyrosine/serine phosphatase  33.98 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0543  protein tyrosine/serine phosphatase  31.15 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3362  protein tyrosine/serine phosphatase  34.81 
 
 		 265 aa  112  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3587  protein tyrosine/serine phosphatase  31.3 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000929077 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3383  protein tyrosine/serine phosphatase  36.59 
 
 		 250 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000524951  hitchhiker  0.000566628 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2126  protein tyrosine/serine phosphatase  29.62 
 
 		 339 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0719  protein tyrosine/serine phosphatase  34.9 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2377  protein tyrosine/serine phosphatase  32.4 
 
 		 636 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188756 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0371  protein tyrosine/serine phosphatase  32.57 
 
 		 299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3159  protein tyrosine/serine phosphatase  36.27 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0124414 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3997  protein tyrosine/serine phosphatase  35.57 
 
 		 277 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0144957 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4624  protein tyrosine/serine phosphatase  32.21 
 
 		 292 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.81745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4313  protein tyrosine/serine phosphatase  33.99 
 
 		 247 aa  108  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1747  protein tyrosine/serine phosphatase  30.04 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000126573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0553  protein tyrosine/serine phosphatase  33.47 
 
 		 254 aa  106  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371687  normal  0.150838 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4542  putative tyrosine protein phosphatase  33.97 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2360  protein tyrosine/serine phosphatase  30.56 
 
 		 250 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27240  protein tyrosine/serine phosphatase  28.52 
 
 		 269 aa  103  6e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  33.59 
 
 		 243 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0698  protein tyrosine/serine phosphatase  29.71 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.456776  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1528  protein tyrosine/serine phosphatase  36.33 
 
 		 273 aa  99.4  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2208  hypothetical protein  27.93 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.797475  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2362  protein tyrosine/serine phosphatase  33.33 
 
 		 244 aa  99  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1731  protein tyrosine phosphatase  29.26 
 
 		 264 aa  97.8  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0027  protein tyrosine/serine phosphatase  33.33 
 
 		 246 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2040  protein tyrosine/serine phosphatase  36.75 
 
 		 270 aa  97.4  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376683  hitchhiker  0.00700023 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0804  protein tyrosine/serine phosphatase  32.45 
 
 		 275 aa  96.3  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal  0.36802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0548  protein tyrosine/serine phosphatase  31.16 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4203  protein tyrosine/serine phosphatase  31.2 
 
 		 257 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3134  hypothetical protein  33.81 
 
 		 265 aa  94.4  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.93159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4857  protein tyrosine/serine phosphatase  28.1 
 
 		 266 aa  94  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3617  autotransporter beta-domain-containing protein  29.39 
 
 		 671 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1578  protein tyrosine/serine phosphatase  25.38 
 
 		 260 aa  91.7  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0127  protein tyrosine/serine phosphatase  28.08 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000401238  hitchhiker  0.000000000048511 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4624  protein tyrosine/serine phosphatase  30.04 
 
 		 349 aa  90.1  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3163  protein tyrosine/serine phosphatase  31.84 
 
 		 264 aa  90.1  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4511  protein tyrosine/serine phosphatase  33.6 
 
 		 250 aa  90.1  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1781  protein tyrosine/serine phosphatase  28.52 
 
 		 258 aa  89.4  9e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000745544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4145  protein tyrosine/serine phosphatase  29.74 
 
 		 269 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377709  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0332  protein tyrosine/serine phosphatase  27.09 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43096  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3890  protein tyrosine/serine phosphatase  30.98 
 
 		 250 aa  88.2  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3550  protein tyrosine/serine phosphatase  30.27 
 
 		 243 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0885  protein tyrosine/serine phosphatase  32.02 
 
 		 275 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1689  protein tyrosine/serine phosphatase  34.53 
 
 		 279 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1779  protein tyrosine/serine phosphatase  26.44 
 
 		 260 aa  87.4  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1919  hypothetical protein  26.62 
 
 		 319 aa  86.7  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0175  protein tyrosine/serine phosphatase  32.5 
 
 		 255 aa  85.5  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3931  protein tyrosine/serine phosphatase  30.98 
 
 		 260 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0410  protein tyrosine/serine phosphatase  32.3 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.93291 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0188  protein tyrosine/serine phosphatase  33.2 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1239  protein tyrosine/serine phosphatase  32.28 
 
 		 261 aa  82  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.030043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4351  protein tyrosine/serine phosphatase  28.8 
 
 		 260 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0136  protein tyrosine/serine phosphatase  32.57 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2835  protein tyrosine/serine phosphatase  34.98 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.324515  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4066  protein tyrosine/serine phosphatase  28.8 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2344  protein tyrosine/serine phosphatase  34.74 
 
 		 262 aa  79  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0097  protein tyrosine/serine phosphatase  36.02 
 
 		 266 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0106  protein tyrosine/serine phosphatase  36.02 
 
 		 266 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  36.02 
 
 		 266 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2330  protein tyrosine/serine phosphatase  33.88 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0950011  normal  0.396609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2202  protein tyrosine/serine phosphatase  36.21 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.534636  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02130  protein tyrosine/serine phosphatase  28.68 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.393393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2291  protein tyrosine/serine phosphatase  28.68 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1050  protein tyrosine/serine phosphatase  25.82 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10154  phosphotyrosine protein phosphatase ptpb  29.67 
 
 		 276 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0245  protein tyrosine/serine phosphatase  27.2 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2661  protein tyrosine/serine phosphatase  29.18 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000022841  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2349  protein tyrosine/serine phosphatase  35.12 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1285  protein tyrosine/serine phosphatase  34.43 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00000171283  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3678  protein tyrosine/serine phosphatase  27.45 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14410  protein tyrosine/serine phosphatase  30.71 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0513449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24750  protein tyrosine/serine phosphatase  34.08 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0606708  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0115  protein tyrosine/serine phosphatase  34.2 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0735  protein tyrosine/serine phosphatase  34.33 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2017  protein tyrosine/serine phosphatase  34.41 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.166797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1451  protein tyrosine/serine phosphatase  38.06 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3861  protein tyrosine/serine phosphatase  34.74 
 
 		 274 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1268  protein tyrosine/serine phosphatase  28.68 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.321151 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0660  protein tyrosine/serine phosphatase  29.8 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107087  hitchhiker  0.00669457 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1241  hypothetical protein  30.08 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4163  protein tyrosine/serine phosphatase  32.81 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  0.316724 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3645  hypothetical protein  25.86 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1131  protein tyrosine/serine phosphatase  28.06 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>