126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1050 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1050  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 
262 aa  537  9.999999999999999e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542198  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1747  protein tyrosine/serine phosphatase  43.41 
 
 
267 aa  224  1e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000126573  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1779  protein tyrosine/serine phosphatase  31.13 
 
 
260 aa  140  3e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0804  protein tyrosine/serine phosphatase  30.35 
 
 
275 aa  119  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal  0.36802 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1731  protein tyrosine phosphatase  27.97 
 
 
264 aa  119  6e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0718  protein tyrosine/serine phosphatase  30.86 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0127  protein tyrosine/serine phosphatase  30.65 
 
 
267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000401238  hitchhiker  0.000000000048511 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0136  protein tyrosine/serine phosphatase  33.07 
 
 
295 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2360  protein tyrosine/serine phosphatase  31.27 
 
 
250 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4511  protein tyrosine/serine phosphatase  29.81 
 
 
250 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3362  protein tyrosine/serine phosphatase  29.55 
 
 
265 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3931  protein tyrosine/serine phosphatase  27.1 
 
 
260 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0719  protein tyrosine/serine phosphatase  26.67 
 
 
270 aa  102  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3163  protein tyrosine/serine phosphatase  28.84 
 
 
264 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3890  protein tyrosine/serine phosphatase  28.84 
 
 
250 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0188  protein tyrosine/serine phosphatase  26.39 
 
 
260 aa  99.4  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1578  protein tyrosine/serine phosphatase  28.12 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0245  protein tyrosine/serine phosphatase  28.62 
 
 
260 aa  96.7  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0332  protein tyrosine/serine phosphatase  26.17 
 
 
263 aa  95.5  8e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43096  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  30.53 
 
 
243 aa  94  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3550  protein tyrosine/serine phosphatase  29.96 
 
 
243 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2126  protein tyrosine/serine phosphatase  27.64 
 
 
339 aa  92.4  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4857  protein tyrosine/serine phosphatase  29.23 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3997  protein tyrosine/serine phosphatase  32.71 
 
 
277 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0144957 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02130  protein tyrosine/serine phosphatase  27.27 
 
 
256 aa  90.5  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.393393  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3645  hypothetical protein  28.42 
 
 
274 aa  89.7  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0885  protein tyrosine/serine phosphatase  28.52 
 
 
275 aa  88.6  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772986 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1781  protein tyrosine/serine phosphatase  24.33 
 
 
258 aa  88.6  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000745544 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3949  protein tyrosine/serine phosphatase  27.92 
 
 
281 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4066  protein tyrosine/serine phosphatase  26.01 
 
 
260 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4351  protein tyrosine/serine phosphatase  26.22 
 
 
260 aa  87  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3073  protein tyrosine/serine phosphatase  27.59 
 
 
342 aa  87  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.810774  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4145  protein tyrosine/serine phosphatase  28.75 
 
 
269 aa  86.7  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377709  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3041  protein-tyrosine-phosphatase  27.2 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4313  protein tyrosine/serine phosphatase  25.97 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3371  protein-tyrosine phosphatase-like protein  26.82 
 
 
340 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.004022  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27240  protein tyrosine/serine phosphatase  27.51 
 
 
269 aa  84  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0267  hypothetical protein  26.96 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3369  protein-tyrosine phosphatase-like protein  26.82 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3147  protein-tyrosine phosphatase-like protein  27.86 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.761513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3394  protein-tyrosine phosphatase-like protein  27.86 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3348  protein-tyrosine phosphatase-like protein  27.02 
 
 
339 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3134  hypothetical protein  28.41 
 
 
265 aa  82  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.93159  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0097  protein tyrosine/serine phosphatase  30.68 
 
 
266 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0106  protein tyrosine/serine phosphatase  30.68 
 
 
266 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.32864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  30.68 
 
 
266 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3134  protein-tyrosine-phosphatase  26.44 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.809037  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0735  protein tyrosine/serine phosphatase  30.92 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385908  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0646  protein tyrosine/serine phosphatase  25.57 
 
 
316 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3365  protein-tyrosine phosphatase-like protein  28.85 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.788719  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3159  protein tyrosine/serine phosphatase  25.78 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0124414 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1882  protein-tyrosine phosphatase-like protein  26.72 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0115  protein tyrosine/serine phosphatase  29.1 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10154  phosphotyrosine protein phosphatase ptpb  28.78 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2661  protein tyrosine/serine phosphatase  27.13 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000022841  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3082  protein tyrosine/serine phosphatase  23.46 
 
 
295 aa  79  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0027  protein tyrosine/serine phosphatase  26.51 
 
 
246 aa  79  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2401  protein tyrosine/serine phosphatase  28.71 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000223295  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0553  protein tyrosine/serine phosphatase  24.11 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371687  normal  0.150838 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0673  protein tyrosine/serine phosphatase  27.13 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00206907  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1239  protein tyrosine/serine phosphatase  26.89 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.030043  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2208  hypothetical protein  27.92 
 
 
332 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.797475  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4542  putative tyrosine protein phosphatase  26.59 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4923  protein tyrosine/serine phosphatase  25.82 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3861  protein tyrosine/serine phosphatase  25.9 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464823  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2362  protein tyrosine/serine phosphatase  26.42 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0543  protein tyrosine/serine phosphatase  24.62 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2109  protein tyrosine/serine phosphatase  27.42 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.636738  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3383  protein tyrosine/serine phosphatase  24.61 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000524951  hitchhiker  0.000566628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1241  hypothetical protein  25.2 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1919  hypothetical protein  27.64 
 
 
319 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0660  protein tyrosine/serine phosphatase  26.67 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107087  hitchhiker  0.00669457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2377  protein tyrosine/serine phosphatase  28.96 
 
 
636 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188756 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0698  protein tyrosine/serine phosphatase  23.47 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.456776  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1687  protein tyrosine/serine phosphatase  27.23 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2183  Protein tyrosine/serine phosphatase-like protein  28.85 
 
 
280 aa  68.9  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663845  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4163  protein tyrosine/serine phosphatase  26.45 
 
 
248 aa  68.6  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  0.316724 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10864  conserved hypothetical protein  26.84 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3316  protein tyrosine/serine phosphatase  24.71 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.367248  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14410  protein tyrosine/serine phosphatase  29.08 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0513449  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0624  protein tyrosine/serine phosphatase  27.31 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2835  protein tyrosine/serine phosphatase  25.94 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.324515  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1268  protein tyrosine/serine phosphatase  28.18 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.321151 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1877  protein tyrosine/serine phosphatase  29.17 
 
 
637 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.880378 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1131  protein tyrosine/serine phosphatase  23.44 
 
 
260 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2344  protein tyrosine/serine phosphatase  25.94 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1720  protein tyrosine/serine phosphatase  28.38 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6870  protein tyrosine/serine phosphatase  28 
 
 
265 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226052  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4624  protein tyrosine/serine phosphatase  23.44 
 
 
292 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.81745  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0410  protein tyrosine/serine phosphatase  23.77 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.93291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0548  protein tyrosine/serine phosphatase  25.1 
 
 
344 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2291  protein tyrosine/serine phosphatase  26.47 
 
 
247 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3678  protein tyrosine/serine phosphatase  24.06 
 
 
238 aa  63.9  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5073  protein tyrosine/serine phosphatase  26.01 
 
 
228 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293049  normal  0.751452 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0175  protein tyrosine/serine phosphatase  25.19 
 
 
255 aa  63.2  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1689  protein tyrosine/serine phosphatase  25.19 
 
 
279 aa  62.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23060  protein tyrosine/serine phosphatase  24.02 
 
 
354 aa  63.2  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.463058  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0561  protein tyrosine/serine phosphatase  27.91 
 
 
279 aa  62.4  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2040  protein tyrosine/serine phosphatase  27.04 
 
 
270 aa  62.4  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376683  hitchhiker  0.00700023 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2017  protein tyrosine/serine phosphatase  26.6 
 
 
280 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.166797  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>