128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2202 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2202  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 		 243 aa  477  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.534636  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3760  protein tyrosine/serine phosphatase  38.34 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.068638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2401  protein tyrosine/serine phosphatase  33.46 
 
 		 262 aa  92.4  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000223295  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6870  protein tyrosine/serine phosphatase  34.03 
 
 		 265 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2349  protein tyrosine/serine phosphatase  34.98 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14410  protein tyrosine/serine phosphatase  33.2 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0513449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0718  protein tyrosine/serine phosphatase  29.82 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4923  protein tyrosine/serine phosphatase  36.21 
 
 		 345 aa  78.6  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3678  protein tyrosine/serine phosphatase  30.06 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1268  protein tyrosine/serine phosphatase  33.06 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.321151 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2661  protein tyrosine/serine phosphatase  30.24 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000022841  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1689  protein tyrosine/serine phosphatase  31.78 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  31.84 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3082  protein tyrosine/serine phosphatase  31.79 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1241  hypothetical protein  36.26 
 
 		 252 aa  72  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1720  protein tyrosine/serine phosphatase  30.42 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088444  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2835  protein tyrosine/serine phosphatase  38.41 
 
 		 283 aa  72  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.324515  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1131  protein tyrosine/serine phosphatase  36.9 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2291  protein tyrosine/serine phosphatase  30.2 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0719  protein tyrosine/serine phosphatase  34.78 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0646  protein tyrosine/serine phosphatase  25.93 
 
 		 316 aa  68.6  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0027  protein tyrosine/serine phosphatase  33.33 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3550  protein tyrosine/serine phosphatase  33.74 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2109  protein tyrosine/serine phosphatase  23.75 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.636738  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4163  protein tyrosine/serine phosphatase  29.94 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  0.316724 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2327  protein tyrosine/serine phosphatase  31.62 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.385338  normal  0.942935 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0548  protein tyrosine/serine phosphatase  29.28 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3159  protein tyrosine/serine phosphatase  35.08 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0124414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1877  protein tyrosine/serine phosphatase  29.84 
 
 		 637 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.880378 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0673  protein tyrosine/serine phosphatase  27.47 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00206907  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27240  protein tyrosine/serine phosphatase  26.09 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2377  protein tyrosine/serine phosphatase  31.87 
 
 		 636 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2407  protein tyrosine/serine phosphatase  35.66 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2362  protein tyrosine/serine phosphatase  32.2 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4313  protein tyrosine/serine phosphatase  33.91 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0661  protein tyrosine/serine phosphatase  33.71 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0804  protein tyrosine/serine phosphatase  31.03 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal  0.36802 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02130  protein tyrosine/serine phosphatase  30.11 
 
 		 256 aa  62  0.000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.393393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0245  protein tyrosine/serine phosphatase  32.75 
 
 		 260 aa  62  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4351  protein tyrosine/serine phosphatase  32.97 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5073  protein tyrosine/serine phosphatase  28.8 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293049  normal  0.751452 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2344  protein tyrosine/serine phosphatase  31.01 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0332  protein tyrosine/serine phosphatase  27.49 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43096  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4066  protein tyrosine/serine phosphatase  32.97 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2208  hypothetical protein  25.74 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.797475  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4857  protein tyrosine/serine phosphatase  27.24 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2017  protein tyrosine/serine phosphatase  31.9 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.166797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4145  protein tyrosine/serine phosphatase  30.41 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377709  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3316  protein tyrosine/serine phosphatase  31.98 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.367248  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3362  protein tyrosine/serine phosphatase  29.9 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1239  protein tyrosine/serine phosphatase  34.48 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.030043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1919  hypothetical protein  27.35 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2040  protein tyrosine/serine phosphatase  31.55 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376683  hitchhiker  0.00700023 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1451  protein tyrosine/serine phosphatase  36.47 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10864  conserved hypothetical protein  29.76 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1781  protein tyrosine/serine phosphatase  24.81 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000745544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1687  protein tyrosine/serine phosphatase  31.28 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0561  protein tyrosine/serine phosphatase  30.86 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1578  protein tyrosine/serine phosphatase  26.59 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1731  protein tyrosine phosphatase  27.32 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3997  protein tyrosine/serine phosphatase  53.85 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0144957 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10154  phosphotyrosine protein phosphatase ptpb  31.19 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3477  protein tyrosine/serine phosphatase  37.5 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0698  protein tyrosine/serine phosphatase  26.4 
 
 		 306 aa  55.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.456776  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4624  protein tyrosine/serine phosphatase  30.23 
 
 		 292 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.81745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1747  protein tyrosine/serine phosphatase  23.5 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000126573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4203  protein tyrosine/serine phosphatase  52.94 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1765  protein tyrosine/serine phosphatase  31.51 
 
 		 221 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3383  protein tyrosine/serine phosphatase  30.98 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000524951  hitchhiker  0.000566628 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3617  autotransporter beta-domain-containing protein  28.16 
 
 		 671 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0188  protein tyrosine/serine phosphatase  30.34 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2360  protein tyrosine/serine phosphatase  28.82 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4542  putative tyrosine protein phosphatase  34.32 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2183  Protein tyrosine/serine phosphatase-like protein  31.95 
 
 		 280 aa  53.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663845  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4624  protein tyrosine/serine phosphatase  29.27 
 
 		 349 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3371  protein-tyrosine phosphatase-like protein  27.23 
 
 		 340 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.004022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3348  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.73 
 
 		 339 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3134  protein-tyrosine-phosphatase  27.12 
 
 		 340 aa  53.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.809037  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1050  protein tyrosine/serine phosphatase  28.81 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0553  protein tyrosine/serine phosphatase  32.98 
 
 		 254 aa  52.8  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371687  normal  0.150838 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3073  protein tyrosine/serine phosphatase  27.5 
 
 		 342 aa  53.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.810774  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0410  protein tyrosine/serine phosphatase  31.18 
 
 		 256 aa  52.8  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.93291 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3163  protein tyrosine/serine phosphatase  27.38 
 
 		 264 aa  52.8  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3569  protein tyrosine/serine phosphatase  32.98 
 
 		 250 aa  52.4  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3147  protein-tyrosine phosphatase-like protein  26.97 
 
 		 340 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.761513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3394  protein-tyrosine phosphatase-like protein  26.97 
 
 		 340 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0714  protein tyrosine/serine phosphatase  33.33 
 
 		 253 aa  52.4  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.291676 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3369  protein-tyrosine phosphatase-like protein  26.25 
 
 		 340 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0178  protein tyrosine/serine phosphatase  41.94 
 
 		 395 aa  52.4  0.000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3931  protein tyrosine/serine phosphatase  31.28 
 
 		 260 aa  52  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3041  protein-tyrosine-phosphatase  30.34 
 
 		 340 aa  52  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3890  protein tyrosine/serine phosphatase  27.38 
 
 		 250 aa  52  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0175  protein tyrosine/serine phosphatase  31.98 
 
 		 255 aa  52  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2785  protein tyrosine/serine phosphatase  29.89 
 
 		 321 aa  52  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24750  protein tyrosine/serine phosphatase  60.98 
 
 		 315 aa  51.6  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0606708  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1779  protein tyrosine/serine phosphatase  26.24 
 
 		 260 aa  51.2  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3587  protein tyrosine/serine phosphatase  29.81 
 
 		 316 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000929077 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1882  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.34 
 
 		 339 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4846  protein tyrosine/serine phosphatase  37.84 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2126  protein tyrosine/serine phosphatase  27.68 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>