106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2407 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2407  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 
228 aa  454  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2291  protein tyrosine/serine phosphatase  33.49 
 
 
247 aa  98.2  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2661  protein tyrosine/serine phosphatase  29.11 
 
 
249 aa  90.5  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000022841  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3678  protein tyrosine/serine phosphatase  27.27 
 
 
238 aa  81.3  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  35.97 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3550  protein tyrosine/serine phosphatase  35.25 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1131  protein tyrosine/serine phosphatase  30.41 
 
 
260 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5073  protein tyrosine/serine phosphatase  33.01 
 
 
228 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293049  normal  0.751452 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1241  hypothetical protein  29.49 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1584  protein tyrosine/serine phosphatase  31.37 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1731  protein tyrosine phosphatase  26.67 
 
 
264 aa  67  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2109  protein tyrosine/serine phosphatase  27.88 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.636738  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1779  protein tyrosine/serine phosphatase  24.45 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1747  protein tyrosine/serine phosphatase  24.03 
 
 
267 aa  63.9  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000126573  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14410  protein tyrosine/serine phosphatase  29.13 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0513449  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1285  protein tyrosine/serine phosphatase  30.3 
 
 
289 aa  63.2  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00000171283  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0548  protein tyrosine/serine phosphatase  28.24 
 
 
344 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2202  protein tyrosine/serine phosphatase  35.66 
 
 
243 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.534636  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2835  protein tyrosine/serine phosphatase  33.1 
 
 
283 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.324515  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1268  protein tyrosine/serine phosphatase  28.86 
 
 
251 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.321151 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4624  protein tyrosine/serine phosphatase  25.36 
 
 
292 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.81745  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0646  protein tyrosine/serine phosphatase  28.57 
 
 
316 aa  59.7  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1720  protein tyrosine/serine phosphatase  29.58 
 
 
239 aa  58.9  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088444  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1050  protein tyrosine/serine phosphatase  26.78 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542198  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0553  protein tyrosine/serine phosphatase  27.43 
 
 
254 aa  57.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371687  normal  0.150838 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3861  protein tyrosine/serine phosphatase  32 
 
 
274 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464823  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4511  protein tyrosine/serine phosphatase  29.33 
 
 
250 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3997  protein tyrosine/serine phosphatase  27.66 
 
 
277 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0144957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0027  protein tyrosine/serine phosphatase  25.24 
 
 
246 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0735  protein tyrosine/serine phosphatase  28.89 
 
 
266 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385908  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4542  putative tyrosine protein phosphatase  27.78 
 
 
265 aa  55.5  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10154  phosphotyrosine protein phosphatase ptpb  47.83 
 
 
276 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1917  protein tyrosine/serine phosphatase  34.25 
 
 
258 aa  55.5  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.465769  normal  0.598754 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0175  protein tyrosine/serine phosphatase  28.06 
 
 
255 aa  54.3  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4923  protein tyrosine/serine phosphatase  36.73 
 
 
345 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3569  protein tyrosine/serine phosphatase  29.13 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2360  protein tyrosine/serine phosphatase  30.81 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0661  protein tyrosine/serine phosphatase  28.78 
 
 
244 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1877  protein tyrosine/serine phosphatase  25.84 
 
 
637 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.880378 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1781  protein tyrosine/serine phosphatase  24.19 
 
 
258 aa  53.5  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000745544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2377  protein tyrosine/serine phosphatase  25 
 
 
636 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1765  protein tyrosine/serine phosphatase  31.79 
 
 
221 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1689  protein tyrosine/serine phosphatase  28.17 
 
 
279 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2349  protein tyrosine/serine phosphatase  32.39 
 
 
246 aa  52.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0115  protein tyrosine/serine phosphatase  29.56 
 
 
266 aa  52  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0804  protein tyrosine/serine phosphatase  24.77 
 
 
275 aa  52  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal  0.36802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3316  protein tyrosine/serine phosphatase  27.51 
 
 
265 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.367248  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1451  protein tyrosine/serine phosphatase  29 
 
 
302 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0097  protein tyrosine/serine phosphatase  28.57 
 
 
266 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0106  protein tyrosine/serine phosphatase  28.57 
 
 
266 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.32864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  28.57 
 
 
266 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4624  protein tyrosine/serine phosphatase  28.75 
 
 
349 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713169  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4203  protein tyrosine/serine phosphatase  29.94 
 
 
257 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537851  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3057  protein tyrosine/serine phosphatase  31.48 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3890  protein tyrosine/serine phosphatase  26.43 
 
 
250 aa  50.1  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3163  protein tyrosine/serine phosphatase  27.33 
 
 
264 aa  50.1  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1578  protein tyrosine/serine phosphatase  24.57 
 
 
260 aa  49.7  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45376  predicted protein  27.97 
 
 
490 aa  49.7  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.88052  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0673  protein tyrosine/serine phosphatase  23.08 
 
 
240 aa  49.7  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00206907  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0718  protein tyrosine/serine phosphatase  49.02 
 
 
269 aa  49.7  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3082  protein tyrosine/serine phosphatase  26.32 
 
 
295 aa  48.9  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1687  protein tyrosine/serine phosphatase  28.29 
 
 
234 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0719  protein tyrosine/serine phosphatase  28.92 
 
 
270 aa  48.9  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3760  protein tyrosine/serine phosphatase  29.53 
 
 
257 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.068638  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3073  protein tyrosine/serine phosphatase  22.27 
 
 
342 aa  48.5  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.810774  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2126  protein tyrosine/serine phosphatase  24.84 
 
 
339 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3383  protein tyrosine/serine phosphatase  50.98 
 
 
250 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000524951  hitchhiker  0.000566628 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10864  conserved hypothetical protein  24 
 
 
289 aa  47.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3365  protein-tyrosine phosphatase-like protein  24.18 
 
 
340 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.788719  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3134  protein-tyrosine-phosphatase  24.18 
 
 
340 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.809037  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3041  protein-tyrosine-phosphatase  24.18 
 
 
340 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0410  protein tyrosine/serine phosphatase  32.81 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.93291 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3371  protein-tyrosine phosphatase-like protein  22.27 
 
 
340 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.004022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3369  protein-tyrosine phosphatase-like protein  22.27 
 
 
340 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2040  protein tyrosine/serine phosphatase  33.94 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376683  hitchhiker  0.00700023 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2183  Protein tyrosine/serine phosphatase-like protein  35.92 
 
 
280 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663845  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2401  protein tyrosine/serine phosphatase  30.25 
 
 
262 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000223295  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6870  protein tyrosine/serine phosphatase  27.11 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226052  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0371  protein tyrosine/serine phosphatase  28.09 
 
 
299 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3587  protein tyrosine/serine phosphatase  27.59 
 
 
316 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000929077 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3348  protein-tyrosine phosphatase-like protein  24.18 
 
 
339 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3147  protein-tyrosine phosphatase-like protein  22.27 
 
 
340 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.761513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3394  protein-tyrosine phosphatase-like protein  22.27 
 
 
340 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1882  protein-tyrosine phosphatase-like protein  24.18 
 
 
339 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0245  protein tyrosine/serine phosphatase  24.34 
 
 
260 aa  45.8  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0698  protein tyrosine/serine phosphatase  47.92 
 
 
306 aa  45.8  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.456776  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4145  protein tyrosine/serine phosphatase  27.52 
 
 
269 aa  45.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377709  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2362  protein tyrosine/serine phosphatase  25.62 
 
 
244 aa  45.4  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27240  protein tyrosine/serine phosphatase  28.77 
 
 
269 aa  45.1  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3477  protein tyrosine/serine phosphatase  29.51 
 
 
245 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1239  protein tyrosine/serine phosphatase  27.62 
 
 
261 aa  44.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.030043  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3134  hypothetical protein  34.82 
 
 
265 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.93159  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0885  protein tyrosine/serine phosphatase  29.87 
 
 
275 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772986 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4313  protein tyrosine/serine phosphatase  27.37 
 
 
247 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3362  protein tyrosine/serine phosphatase  27.66 
 
 
265 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2785  protein tyrosine/serine phosphatase  33.04 
 
 
321 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34732  predicted protein  48.65 
 
 
309 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0245742  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4857  protein tyrosine/serine phosphatase  25.32 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09355  conserved hypothetical protein  28.23 
 
 
278 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.543229  normal  0.0103312 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3159  protein tyrosine/serine phosphatase  29.58 
 
 
302 aa  43.5  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0124414 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>