116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1687 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1687  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 
234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0661  protein tyrosine/serine phosphatase  65.5 
 
 
244 aa  291  7e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0714  protein tyrosine/serine phosphatase  66.81 
 
 
253 aa  261  8.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.291676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5073  protein tyrosine/serine phosphatase  39.06 
 
 
228 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293049  normal  0.751452 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1917  protein tyrosine/serine phosphatase  35.14 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.465769  normal  0.598754 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2661  protein tyrosine/serine phosphatase  35.12 
 
 
249 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000022841  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2291  protein tyrosine/serine phosphatase  35.98 
 
 
247 aa  99.4  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3057  protein tyrosine/serine phosphatase  34.45 
 
 
239 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3569  protein tyrosine/serine phosphatase  37.5 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1050  protein tyrosine/serine phosphatase  28 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542198  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3262  protein tyrosine/serine phosphatase  31.78 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1584  protein tyrosine/serine phosphatase  34.18 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14410  protein tyrosine/serine phosphatase  34.78 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0513449  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1268  protein tyrosine/serine phosphatase  32.98 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.321151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4203  protein tyrosine/serine phosphatase  31.28 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537851  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3383  protein tyrosine/serine phosphatase  33.51 
 
 
250 aa  69.7  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000524951  hitchhiker  0.000566628 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1747  protein tyrosine/serine phosphatase  27.55 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000126573  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2109  protein tyrosine/serine phosphatase  27.82 
 
 
298 aa  68.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.636738  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24750  protein tyrosine/serine phosphatase  31.96 
 
 
315 aa  67  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0606708  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1241  hypothetical protein  33.85 
 
 
252 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1731  protein tyrosine phosphatase  27.51 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3678  protein tyrosine/serine phosphatase  27.12 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4163  protein tyrosine/serine phosphatase  31.05 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  0.316724 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2349  protein tyrosine/serine phosphatase  31.25 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3760  protein tyrosine/serine phosphatase  31.05 
 
 
257 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.068638  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6870  protein tyrosine/serine phosphatase  31.37 
 
 
265 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226052  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1131  protein tyrosine/serine phosphatase  30.28 
 
 
260 aa  63.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2202  protein tyrosine/serine phosphatase  31.28 
 
 
243 aa  62  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.534636  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3477  protein tyrosine/serine phosphatase  33.85 
 
 
245 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0698  protein tyrosine/serine phosphatase  32.29 
 
 
306 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.456776  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0646  protein tyrosine/serine phosphatase  25.97 
 
 
316 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2835  protein tyrosine/serine phosphatase  31.84 
 
 
283 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.324515  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1781  protein tyrosine/serine phosphatase  26.98 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000745544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1689  protein tyrosine/serine phosphatase  30.28 
 
 
279 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0548  protein tyrosine/serine phosphatase  28.35 
 
 
344 aa  59.7  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1578  protein tyrosine/serine phosphatase  24.21 
 
 
260 aa  58.9  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0027  protein tyrosine/serine phosphatase  30.06 
 
 
246 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10864  conserved hypothetical protein  27.02 
 
 
289 aa  58.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2126  protein tyrosine/serine phosphatase  27.93 
 
 
339 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0245  protein tyrosine/serine phosphatase  31.47 
 
 
260 aa  57.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0332  protein tyrosine/serine phosphatase  25.82 
 
 
263 aa  57  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43096  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2407  protein tyrosine/serine phosphatase  31.29 
 
 
228 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0718  protein tyrosine/serine phosphatase  31.09 
 
 
269 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3861  protein tyrosine/serine phosphatase  31.2 
 
 
274 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464823  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3997  protein tyrosine/serine phosphatase  27.78 
 
 
277 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0144957 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1285  protein tyrosine/serine phosphatase  29.65 
 
 
289 aa  57  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00000171283  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1239  protein tyrosine/serine phosphatase  30.65 
 
 
261 aa  56.2  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.030043  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02130  protein tyrosine/serine phosphatase  27.33 
 
 
256 aa  56.2  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.393393  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0673  protein tyrosine/serine phosphatase  28.31 
 
 
240 aa  56.2  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00206907  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2401  protein tyrosine/serine phosphatase  30.61 
 
 
262 aa  55.5  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000223295  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2344  protein tyrosine/serine phosphatase  30.43 
 
 
262 aa  55.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1779  protein tyrosine/serine phosphatase  26.32 
 
 
260 aa  55.1  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2327  protein tyrosine/serine phosphatase  32.45 
 
 
263 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.385338  normal  0.942935 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1720  protein tyrosine/serine phosphatase  29.05 
 
 
239 aa  55.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088444  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1451  protein tyrosine/serine phosphatase  30.34 
 
 
302 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3362  protein tyrosine/serine phosphatase  31.25 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4923  protein tyrosine/serine phosphatase  32.97 
 
 
345 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0178  protein tyrosine/serine phosphatase  30.6 
 
 
395 aa  53.5  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0804  protein tyrosine/serine phosphatase  27.19 
 
 
275 aa  53.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal  0.36802 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27240  protein tyrosine/serine phosphatase  26.94 
 
 
269 aa  52.4  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4857  protein tyrosine/serine phosphatase  28.09 
 
 
266 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3617  autotransporter beta-domain-containing protein  25.54 
 
 
671 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0410  protein tyrosine/serine phosphatase  27.35 
 
 
256 aa  51.2  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.93291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3550  protein tyrosine/serine phosphatase  33.15 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0371  protein tyrosine/serine phosphatase  34.17 
 
 
299 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2017  protein tyrosine/serine phosphatase  28.95 
 
 
280 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.166797  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4624  protein tyrosine/serine phosphatase  33.33 
 
 
292 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.81745  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0175  protein tyrosine/serine phosphatase  31.07 
 
 
255 aa  49.7  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3645  hypothetical protein  26.98 
 
 
274 aa  49.7  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  28.65 
 
 
243 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4145  protein tyrosine/serine phosphatase  26.06 
 
 
269 aa  48.9  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377709  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2360  protein tyrosine/serine phosphatase  29.38 
 
 
250 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0127  protein tyrosine/serine phosphatase  24.16 
 
 
267 aa  48.5  0.00009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000401238  hitchhiker  0.000000000048511 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0561  protein tyrosine/serine phosphatase  28.22 
 
 
279 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0097  protein tyrosine/serine phosphatase  26.92 
 
 
266 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0106  protein tyrosine/serine phosphatase  26.92 
 
 
266 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.32864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  26.92 
 
 
266 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0136  protein tyrosine/serine phosphatase  32.61 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4313  protein tyrosine/serine phosphatase  28.97 
 
 
247 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3949  protein tyrosine/serine phosphatase  24.55 
 
 
281 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1877  protein tyrosine/serine phosphatase  29.71 
 
 
637 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.880378 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0188  protein tyrosine/serine phosphatase  29.89 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1765  protein tyrosine/serine phosphatase  31.51 
 
 
221 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3316  protein tyrosine/serine phosphatase  31.52 
 
 
265 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.367248  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3931  protein tyrosine/serine phosphatase  30.39 
 
 
260 aa  46.6  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2377  protein tyrosine/serine phosphatase  45.65 
 
 
636 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188756 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45376  predicted protein  45.95 
 
 
490 aa  45.4  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.88052  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4846  protein tyrosine/serine phosphatase  33.33 
 
 
283 aa  45.4  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2040  protein tyrosine/serine phosphatase  29.23 
 
 
270 aa  45.4  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376683  hitchhiker  0.00700023 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4511  protein tyrosine/serine phosphatase  29.38 
 
 
250 aa  45.4  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3134  protein-tyrosine-phosphatase  25.41 
 
 
340 aa  45.1  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.809037  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3073  protein tyrosine/serine phosphatase  23.46 
 
 
342 aa  45.1  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.810774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3371  protein-tyrosine phosphatase-like protein  25.41 
 
 
340 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.004022  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3365  protein-tyrosine phosphatase-like protein  24.58 
 
 
340 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.788719  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3147  protein-tyrosine phosphatase-like protein  24.58 
 
 
340 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.761513  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3041  protein-tyrosine-phosphatase  24.58 
 
 
340 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3394  protein-tyrosine phosphatase-like protein  24.58 
 
 
340 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10154  phosphotyrosine protein phosphatase ptpb  27.31 
 
 
276 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4542  putative tyrosine protein phosphatase  30.51 
 
 
265 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0267  hypothetical protein  26.09 
 
 
289 aa  43.9  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>