127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3997 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3997  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0144957 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2377  protein tyrosine/serine phosphatase  49.4 
 
 		 636 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188756 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1877  protein tyrosine/serine phosphatase  49 
 
 		 637 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.880378 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2785  protein tyrosine/serine phosphatase  40.57 
 
 		 321 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3587  protein tyrosine/serine phosphatase  39.15 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000929077 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4624  protein tyrosine/serine phosphatase  38.27 
 
 		 292 aa  165  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.81745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0371  protein tyrosine/serine phosphatase  38.43 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4542  putative tyrosine protein phosphatase  42 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3082  protein tyrosine/serine phosphatase  35.71 
 
 		 295 aa  137  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2362  protein tyrosine/serine phosphatase  36.55 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3617  autotransporter beta-domain-containing protein  33.82 
 
 		 671 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0543  protein tyrosine/serine phosphatase  31 
 
 		 306 aa  116  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0718  protein tyrosine/serine phosphatase  32.95 
 
 		 269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3362  protein tyrosine/serine phosphatase  34.38 
 
 		 265 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3159  protein tyrosine/serine phosphatase  35.74 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0124414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4923  protein tyrosine/serine phosphatase  35.57 
 
 		 345 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0646  protein tyrosine/serine phosphatase  30.28 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3316  protein tyrosine/serine phosphatase  37.01 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.367248  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3134  hypothetical protein  35.16 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.93159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2183  Protein tyrosine/serine phosphatase-like protein  35.19 
 
 		 280 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663845  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1779  protein tyrosine/serine phosphatase  30.74 
 
 		 260 aa  99.4  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4857  protein tyrosine/serine phosphatase  29.34 
 
 		 266 aa  99.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0719  protein tyrosine/serine phosphatase  32.59 
 
 		 270 aa  99  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0804  protein tyrosine/serine phosphatase  32.4 
 
 		 275 aa  99  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal  0.36802 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2360  protein tyrosine/serine phosphatase  31.64 
 
 		 250 aa  98.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0548  protein tyrosine/serine phosphatase  32.21 
 
 		 344 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0332  protein tyrosine/serine phosphatase  28.57 
 
 		 263 aa  94  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43096  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3073  protein tyrosine/serine phosphatase  29.34 
 
 		 342 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.810774  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1050  protein tyrosine/serine phosphatase  32.71 
 
 		 262 aa  91.3  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3383  protein tyrosine/serine phosphatase  31.37 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000524951  hitchhiker  0.000566628 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2126  protein tyrosine/serine phosphatase  29.07 
 
 		 339 aa  89.4  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4066  protein tyrosine/serine phosphatase  30.74 
 
 		 260 aa  89.4  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3147  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.12 
 
 		 340 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.761513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3394  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.12 
 
 		 340 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3134  protein-tyrosine-phosphatase  29.73 
 
 		 340 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.809037  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4351  protein tyrosine/serine phosphatase  31.13 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3371  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.73 
 
 		 340 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.004022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3369  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.73 
 
 		 340 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4313  protein tyrosine/serine phosphatase  30.65 
 
 		 247 aa  87  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1528  protein tyrosine/serine phosphatase  28.9 
 
 		 273 aa  85.9  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3041  protein-tyrosine-phosphatase  28.96 
 
 		 340 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0245  protein tyrosine/serine phosphatase  29.46 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0127  protein tyrosine/serine phosphatase  29.6 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000401238  hitchhiker  0.000000000048511 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23060  protein tyrosine/serine phosphatase  29.06 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.463058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27240  protein tyrosine/serine phosphatase  26.25 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0885  protein tyrosine/serine phosphatase  34.18 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772986 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1239  protein tyrosine/serine phosphatase  30.22 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.030043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10154  phosphotyrosine protein phosphatase ptpb  31.21 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4203  protein tyrosine/serine phosphatase  28.62 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1747  protein tyrosine/serine phosphatase  28.7 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000126573  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3365  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.44 
 
 		 340 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.788719  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3348  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.84 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3861  protein tyrosine/serine phosphatase  31.97 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1882  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.44 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0188  protein tyrosine/serine phosphatase  29.21 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0624  protein tyrosine/serine phosphatase  30.67 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3550  protein tyrosine/serine phosphatase  34.08 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3931  protein tyrosine/serine phosphatase  29.6 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2835  protein tyrosine/serine phosphatase  29.44 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.324515  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1781  protein tyrosine/serine phosphatase  26.64 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000745544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1689  protein tyrosine/serine phosphatase  27.27 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1578  protein tyrosine/serine phosphatase  27.57 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1731  protein tyrosine phosphatase  29.13 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2040  protein tyrosine/serine phosphatase  31.17 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376683  hitchhiker  0.00700023 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0660  protein tyrosine/serine phosphatase  27.51 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107087  hitchhiker  0.00669457 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0553  protein tyrosine/serine phosphatase  28.35 
 
 		 254 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371687  normal  0.150838 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1268  protein tyrosine/serine phosphatase  29.96 
 
 		 251 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.321151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0698  protein tyrosine/serine phosphatase  28.68 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.456776  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0267  hypothetical protein  25.43 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3645  hypothetical protein  25.44 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2208  hypothetical protein  26.27 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.797475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1919  hypothetical protein  27.12 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2661  protein tyrosine/serine phosphatase  28.4 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000022841  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2344  protein tyrosine/serine phosphatase  26.72 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10864  conserved hypothetical protein  29.34 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3949  protein tyrosine/serine phosphatase  26.06 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1131  protein tyrosine/serine phosphatase  26.92 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3678  protein tyrosine/serine phosphatase  25.83 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0561  protein tyrosine/serine phosphatase  29.8 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0410  protein tyrosine/serine phosphatase  27.69 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.93291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4511  protein tyrosine/serine phosphatase  30.04 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0136  protein tyrosine/serine phosphatase  28.09 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0175  protein tyrosine/serine phosphatase  31.17 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0097  protein tyrosine/serine phosphatase  27.44 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0106  protein tyrosine/serine phosphatase  27.44 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  27.44 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  31.67 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1241  hypothetical protein  27.89 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4145  protein tyrosine/serine phosphatase  24.57 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377709  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24750  protein tyrosine/serine phosphatase  30.43 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0606708  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3760  protein tyrosine/serine phosphatase  28.94 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.068638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2109  protein tyrosine/serine phosphatase  25.9 
 
 		 298 aa  62  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.636738  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02130  protein tyrosine/serine phosphatase  24.7 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.393393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3890  protein tyrosine/serine phosphatase  28.81 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3163  protein tyrosine/serine phosphatase  29.24 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4163  protein tyrosine/serine phosphatase  28.16 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  0.316724 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0178  protein tyrosine/serine phosphatase  30.56 
 
 		 395 aa  59.3  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0115  protein tyrosine/serine phosphatase  25.66 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0673  protein tyrosine/serine phosphatase  23.64 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00206907  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4624  protein tyrosine/serine phosphatase  25.71 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713169  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>