124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0624 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0624  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 
276 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0561  protein tyrosine/serine phosphatase  68.46 
 
 
279 aa  318  6e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0804  protein tyrosine/serine phosphatase  34.82 
 
 
275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal  0.36802 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4857  protein tyrosine/serine phosphatase  36.6 
 
 
266 aa  125  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0885  protein tyrosine/serine phosphatase  39.36 
 
 
275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772986 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3362  protein tyrosine/serine phosphatase  37.31 
 
 
265 aa  116  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4624  protein tyrosine/serine phosphatase  33.73 
 
 
292 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.81745  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0719  protein tyrosine/serine phosphatase  31.48 
 
 
270 aa  115  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1779  protein tyrosine/serine phosphatase  29.66 
 
 
260 aa  112  6e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02130  protein tyrosine/serine phosphatase  31.62 
 
 
256 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.393393  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0127  protein tyrosine/serine phosphatase  30.89 
 
 
267 aa  106  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000401238  hitchhiker  0.000000000048511 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0646  protein tyrosine/serine phosphatase  29.27 
 
 
316 aa  105  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3316  protein tyrosine/serine phosphatase  33.2 
 
 
265 aa  105  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.367248  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0718  protein tyrosine/serine phosphatase  30.45 
 
 
269 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2360  protein tyrosine/serine phosphatase  33.47 
 
 
250 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4313  protein tyrosine/serine phosphatase  32.55 
 
 
247 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2126  protein tyrosine/serine phosphatase  31.56 
 
 
339 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0332  protein tyrosine/serine phosphatase  30.8 
 
 
263 aa  103  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43096  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3159  protein tyrosine/serine phosphatase  32.44 
 
 
302 aa  102  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0124414 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4351  protein tyrosine/serine phosphatase  31.91 
 
 
260 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3082  protein tyrosine/serine phosphatase  31.64 
 
 
295 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3073  protein tyrosine/serine phosphatase  31.15 
 
 
342 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.810774  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1747  protein tyrosine/serine phosphatase  28.96 
 
 
267 aa  99.8  5e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000126573  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1731  protein tyrosine phosphatase  28.4 
 
 
264 aa  99.4  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0175  protein tyrosine/serine phosphatase  33.33 
 
 
255 aa  99  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4066  protein tyrosine/serine phosphatase  31.4 
 
 
260 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3041  protein-tyrosine-phosphatase  31.02 
 
 
340 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1877  protein tyrosine/serine phosphatase  32.93 
 
 
637 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.880378 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0188  protein tyrosine/serine phosphatase  30.2 
 
 
260 aa  96.3  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3147  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.74 
 
 
340 aa  95.9  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.761513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3394  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.74 
 
 
340 aa  95.9  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4624  protein tyrosine/serine phosphatase  34.82 
 
 
349 aa  95.9  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713169  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0548  protein tyrosine/serine phosphatase  32.23 
 
 
344 aa  95.5  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27240  protein tyrosine/serine phosphatase  30.3 
 
 
269 aa  95.5  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3931  protein tyrosine/serine phosphatase  32.55 
 
 
260 aa  95.1  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3369  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.2 
 
 
340 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4511  protein tyrosine/serine phosphatase  34.31 
 
 
250 aa  93.6  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3371  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.04 
 
 
340 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.004022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3134  protein-tyrosine-phosphatase  30.2 
 
 
340 aa  93.6  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.809037  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3348  protein-tyrosine phosphatase-like protein  31.03 
 
 
339 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0410  protein tyrosine/serine phosphatase  31.54 
 
 
256 aa  92.8  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.93291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4145  protein tyrosine/serine phosphatase  28.23 
 
 
269 aa  92.8  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377709  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1882  protein-tyrosine phosphatase-like protein  31.06 
 
 
339 aa  92  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2344  protein tyrosine/serine phosphatase  32.94 
 
 
262 aa  92  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1578  protein tyrosine/serine phosphatase  30.35 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1050  protein tyrosine/serine phosphatase  29.48 
 
 
262 aa  91.3  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542198  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0245  protein tyrosine/serine phosphatase  31.17 
 
 
260 aa  91.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3163  protein tyrosine/serine phosphatase  33.9 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3365  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.96 
 
 
340 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.788719  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2377  protein tyrosine/serine phosphatase  31.4 
 
 
636 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188756 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0543  protein tyrosine/serine phosphatase  27.61 
 
 
306 aa  91.3  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4542  putative tyrosine protein phosphatase  34.27 
 
 
265 aa  90.5  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4203  protein tyrosine/serine phosphatase  29.62 
 
 
257 aa  90.5  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537851  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2785  protein tyrosine/serine phosphatase  33.62 
 
 
321 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3890  protein tyrosine/serine phosphatase  33.47 
 
 
250 aa  89.7  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3134  hypothetical protein  34.8 
 
 
265 aa  89.4  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.93159  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0136  protein tyrosine/serine phosphatase  30.74 
 
 
295 aa  89.7  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3997  protein tyrosine/serine phosphatase  30.65 
 
 
277 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0144957 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1239  protein tyrosine/serine phosphatase  30.8 
 
 
261 aa  89.4  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.030043  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0553  protein tyrosine/serine phosphatase  27.69 
 
 
254 aa  88.6  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371687  normal  0.150838 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3617  autotransporter beta-domain-containing protein  31 
 
 
671 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0698  protein tyrosine/serine phosphatase  29.5 
 
 
306 aa  87  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.456776  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1131  protein tyrosine/serine phosphatase  30.71 
 
 
260 aa  85.9  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10154  phosphotyrosine protein phosphatase ptpb  32.02 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1241  hypothetical protein  30.71 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2362  protein tyrosine/serine phosphatase  31.8 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3645  hypothetical protein  26.39 
 
 
274 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3949  protein tyrosine/serine phosphatase  26.01 
 
 
281 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4163  protein tyrosine/serine phosphatase  31.85 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  0.316724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1528  protein tyrosine/serine phosphatase  32.69 
 
 
273 aa  78.6  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3587  protein tyrosine/serine phosphatase  32.92 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000929077 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2017  protein tyrosine/serine phosphatase  32.2 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.166797  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2291  protein tyrosine/serine phosphatase  31.4 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4923  protein tyrosine/serine phosphatase  29.8 
 
 
345 aa  77  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14410  protein tyrosine/serine phosphatase  29.79 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0513449  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0735  protein tyrosine/serine phosphatase  38.98 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385908  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0267  hypothetical protein  25.09 
 
 
289 aa  75.5  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0027  protein tyrosine/serine phosphatase  29.22 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0115  protein tyrosine/serine phosphatase  30.77 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3760  protein tyrosine/serine phosphatase  34.39 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.068638  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0371  protein tyrosine/serine phosphatase  33.2 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2208  hypothetical protein  29.64 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.797475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1919  hypothetical protein  29.06 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1781  protein tyrosine/serine phosphatase  24.24 
 
 
258 aa  72  0.000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000745544 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2330  protein tyrosine/serine phosphatase  37.5 
 
 
233 aa  72  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0950011  normal  0.396609 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3678  protein tyrosine/serine phosphatase  27.13 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0097  protein tyrosine/serine phosphatase  38.46 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0106  protein tyrosine/serine phosphatase  38.46 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.32864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  38.46 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0673  protein tyrosine/serine phosphatase  30.46 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00206907  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3861  protein tyrosine/serine phosphatase  32.68 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464823  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23060  protein tyrosine/serine phosphatase  25.33 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.463058  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6870  protein tyrosine/serine phosphatase  34.52 
 
 
265 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226052  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2109  protein tyrosine/serine phosphatase  28.4 
 
 
298 aa  67  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.636738  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2040  protein tyrosine/serine phosphatase  28.52 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376683  hitchhiker  0.00700023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1268  protein tyrosine/serine phosphatase  30.22 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.321151 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3383  protein tyrosine/serine phosphatase  30.42 
 
 
250 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000524951  hitchhiker  0.000566628 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1720  protein tyrosine/serine phosphatase  27.4 
 
 
239 aa  63.5  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5073  protein tyrosine/serine phosphatase  29.89 
 
 
228 aa  63.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293049  normal  0.751452 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0660  protein tyrosine/serine phosphatase  33.33 
 
 
253 aa  62.8  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107087  hitchhiker  0.00669457 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>