122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23060 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_23060  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 
354 aa  724    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.463058  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0660  protein tyrosine/serine phosphatase  54.36 
 
 
253 aa  253  3e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107087  hitchhiker  0.00669457 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2126  protein tyrosine/serine phosphatase  30.77 
 
 
339 aa  94.7  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3073  protein tyrosine/serine phosphatase  29.67 
 
 
342 aa  89.7  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.810774  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3134  protein-tyrosine-phosphatase  29.96 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.809037  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3371  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.96 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.004022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3041  protein-tyrosine-phosphatase  29.55 
 
 
340 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3369  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.55 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1877  protein tyrosine/serine phosphatase  29.63 
 
 
637 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.880378 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3997  protein tyrosine/serine phosphatase  29.06 
 
 
277 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0144957 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3147  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.55 
 
 
340 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.761513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3394  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.55 
 
 
340 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3365  protein-tyrosine phosphatase-like protein  30.93 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.788719  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4624  protein tyrosine/serine phosphatase  31.08 
 
 
292 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.81745  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0719  protein tyrosine/serine phosphatase  30.13 
 
 
270 aa  82  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02130  protein tyrosine/serine phosphatase  27.2 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.393393  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0553  protein tyrosine/serine phosphatase  32.87 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371687  normal  0.150838 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2377  protein tyrosine/serine phosphatase  30 
 
 
636 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4857  protein tyrosine/serine phosphatase  29.36 
 
 
266 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3348  protein-tyrosine phosphatase-like protein  28.69 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1882  protein-tyrosine phosphatase-like protein  29.24 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3082  protein tyrosine/serine phosphatase  28.74 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0804  protein tyrosine/serine phosphatase  27.92 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal  0.36802 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0371  protein tyrosine/serine phosphatase  28.44 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0175  protein tyrosine/serine phosphatase  30.93 
 
 
255 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2344  protein tyrosine/serine phosphatase  26.91 
 
 
262 aa  74.3  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1239  protein tyrosine/serine phosphatase  31.2 
 
 
261 aa  74.3  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.030043  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0718  protein tyrosine/serine phosphatase  29.25 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0885  protein tyrosine/serine phosphatase  30.77 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.772986 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4313  protein tyrosine/serine phosphatase  30.38 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3760  protein tyrosine/serine phosphatase  31.84 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.068638  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16770  hypothetical protein  48.57 
 
 
92 aa  73.2  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.711837  normal  0.749784 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0543  protein tyrosine/serine phosphatase  37.76 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2360  protein tyrosine/serine phosphatase  30.84 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2362  protein tyrosine/serine phosphatase  29 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0548  protein tyrosine/serine phosphatase  27.39 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3362  protein tyrosine/serine phosphatase  37.93 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3383  protein tyrosine/serine phosphatase  26.59 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000524951  hitchhiker  0.000566628 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0410  protein tyrosine/serine phosphatase  30.38 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.93291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3134  hypothetical protein  37.86 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.93159  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0300  oxidoreductase, molybdopterin binding  41.1 
 
 
92 aa  68.9  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3316  protein tyrosine/serine phosphatase  31.65 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.367248  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3861  protein tyrosine/serine phosphatase  27.65 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464823  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3587  protein tyrosine/serine phosphatase  29.21 
 
 
316 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000929077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3617  autotransporter beta-domain-containing protein  30.99 
 
 
671 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0561  protein tyrosine/serine phosphatase  25.69 
 
 
279 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3931  protein tyrosine/serine phosphatase  28.38 
 
 
260 aa  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16790  sulfite oxidase-like oxidoreductase  40.96 
 
 
529 aa  65.5  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.707001 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2785  protein tyrosine/serine phosphatase  26.79 
 
 
321 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4511  protein tyrosine/serine phosphatase  28.57 
 
 
250 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3159  protein tyrosine/serine phosphatase  28.7 
 
 
302 aa  64.3  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0124414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4145  protein tyrosine/serine phosphatase  26.98 
 
 
269 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377709  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4203  protein tyrosine/serine phosphatase  29.41 
 
 
257 aa  63.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537851  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0624  protein tyrosine/serine phosphatase  24.55 
 
 
276 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4542  putative tyrosine protein phosphatase  26.32 
 
 
265 aa  63.2  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1050  protein tyrosine/serine phosphatase  24.02 
 
 
262 aa  63.2  0.000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542198  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0188  protein tyrosine/serine phosphatase  29.39 
 
 
260 aa  62.4  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14410  protein tyrosine/serine phosphatase  29.61 
 
 
253 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0513449  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27240  protein tyrosine/serine phosphatase  25.71 
 
 
269 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1091  oxidoreductase molybdopterin binding  36.9 
 
 
359 aa  60.8  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000278852 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1528  protein tyrosine/serine phosphatase  28.39 
 
 
273 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0656  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
343 aa  61.2  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  0.0126108 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1092  oxidoreductase molybdopterin binding  36.71 
 
 
599 aa  60.5  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000472494 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0698  protein tyrosine/serine phosphatase  28.05 
 
 
306 aa  60.5  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.456776  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0245  protein tyrosine/serine phosphatase  26.42 
 
 
260 aa  60.5  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0136  protein tyrosine/serine phosphatase  27.87 
 
 
295 aa  60.5  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1578  protein tyrosine/serine phosphatase  25.55 
 
 
260 aa  60.1  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  29.61 
 
 
243 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2183  Protein tyrosine/serine phosphatase-like protein  29.24 
 
 
280 aa  60.1  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663845  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1014  oxidoreductase molybdopterin binding  39.51 
 
 
357 aa  60.1  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0972537  normal  0.212982 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10864  conserved hypothetical protein  27.69 
 
 
289 aa  59.3  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0394  oxidoreductase molybdopterin binding  37.04 
 
 
360 aa  59.3  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0127  protein tyrosine/serine phosphatase  25.4 
 
 
267 aa  58.5  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000401238  hitchhiker  0.000000000048511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0097  protein tyrosine/serine phosphatase  31.85 
 
 
266 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0106  protein tyrosine/serine phosphatase  31.85 
 
 
266 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.32864 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3890  protein tyrosine/serine phosphatase  27.59 
 
 
250 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  31.85 
 
 
266 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6870  protein tyrosine/serine phosphatase  28.99 
 
 
265 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226052  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3163  protein tyrosine/serine phosphatase  27.59 
 
 
264 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4351  protein tyrosine/serine phosphatase  26.18 
 
 
260 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1779  protein tyrosine/serine phosphatase  25.98 
 
 
260 aa  56.2  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0393  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
560 aa  55.8  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24750  protein tyrosine/serine phosphatase  28.87 
 
 
315 aa  55.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0606708  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2040  protein tyrosine/serine phosphatase  33.64 
 
 
270 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376683  hitchhiker  0.00700023 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4066  protein tyrosine/serine phosphatase  26.18 
 
 
260 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0646  protein tyrosine/serine phosphatase  23.21 
 
 
316 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3550  protein tyrosine/serine phosphatase  28.15 
 
 
243 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1285  protein tyrosine/serine phosphatase  27.71 
 
 
289 aa  54.3  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00000171283  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2835  protein tyrosine/serine phosphatase  22.48 
 
 
283 aa  53.1  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.324515  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1689  protein tyrosine/serine phosphatase  25.76 
 
 
279 aa  53.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10154  phosphotyrosine protein phosphatase ptpb  25.77 
 
 
276 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0298  oxidoreductase molybdopterin binding  34.94 
 
 
552 aa  52.8  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03080  sulfite oxidase-like oxidoreductase  34.33 
 
 
535 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0476411  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0267  hypothetical protein  31.03 
 
 
289 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3949  protein tyrosine/serine phosphatase  31.03 
 
 
281 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0332  protein tyrosine/serine phosphatase  21.72 
 
 
263 aa  50.8  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43096  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2401  protein tyrosine/serine phosphatase  26.35 
 
 
262 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000223295  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4163  protein tyrosine/serine phosphatase  24.38 
 
 
248 aa  50.4  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  0.316724 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0115  protein tyrosine/serine phosphatase  55.26 
 
 
266 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1781  protein tyrosine/serine phosphatase  25.44 
 
 
258 aa  48.9  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000745544 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>