249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_03080 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_03080  sulfite oxidase-like oxidoreductase  100 
 
 
535 aa  1104    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0476411  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0393  oxidoreductase molybdopterin binding  37.76 
 
 
560 aa  298  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1092  oxidoreductase molybdopterin binding  32.76 
 
 
599 aa  277  5e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000472494 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0655  hypothetical protein  33.81 
 
 
539 aa  269  1e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.507478  normal  0.0435014 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1013  oxidoreductase molybdopterin binding  33.93 
 
 
599 aa  260  4e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.14191  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0298  oxidoreductase molybdopterin binding  29.79 
 
 
552 aa  201  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16790  sulfite oxidase-like oxidoreductase  29.26 
 
 
529 aa  184  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.707001 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23090  sulfite oxidase-like oxidoreductase  26.08 
 
 
521 aa  107  6e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.334834  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1091  oxidoreductase molybdopterin binding  26.1 
 
 
359 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000278852 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0656  oxidoreductase molybdopterin binding  27.13 
 
 
343 aa  96.7  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  0.0126108 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0394  oxidoreductase molybdopterin binding  27.59 
 
 
360 aa  92.4  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1014  oxidoreductase molybdopterin binding  24.68 
 
 
357 aa  92  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0972537  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.35 
 
 
501 aa  90.1  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  27.97 
 
 
505 aa  85.5  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3761  oxidoreductase molybdopterin binding  29.75 
 
 
523 aa  84.3  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.77 
 
 
505 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.54 
 
 
465 aa  81.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  26.72 
 
 
489 aa  80.9  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5364  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.26 
 
 
545 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1443  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.15 
 
 
520 aa  78.6  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.63286  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.55 
 
 
505 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2513  oxidoreductase molybdopterin binding  26.76 
 
 
528 aa  78.2  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0300  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.14 
 
 
92 aa  76.6  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  23.97 
 
 
410 aa  76.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4789  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.14 
 
 
552 aa  76.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0102171  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  36.42 
 
 
570 aa  76.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3527  oxidoreductase molybdopterin binding  26.12 
 
 
534 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.80252  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  25.96 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.51 
 
 
515 aa  75.1  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4230  oxidoreductase molybdopterin binding  34.23 
 
 
531 aa  73.9  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1739  Sulfite oxidase-like protein  35 
 
 
546 aa  73.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.316961 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  27.37 
 
 
446 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3840  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.23 
 
 
531 aa  72.8  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.47 
 
 
525 aa  71.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.67 
 
 
416 aa  71.2  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1445  oxidoreductase molybdopterin binding  29.58 
 
 
538 aa  71.2  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000237131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4265  oxidoreductase molybdopterin binding  29.73 
 
 
542 aa  70.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0266604  normal  0.460277 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  25.36 
 
 
349 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4023  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.54 
 
 
521 aa  70.1  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.351273  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  25.17 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0160  oxidoreductase molybdopterin binding  27.94 
 
 
531 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3188  oxidoreductase molybdopterin binding  27.94 
 
 
528 aa  67.8  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  27.8 
 
 
512 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.8 
 
 
512 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.8 
 
 
512 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  24.55 
 
 
415 aa  66.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0079  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.86 
 
 
511 aa  66.2  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1664  oxidoreductase molybdopterin binding  28.3 
 
 
524 aa  65.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.545601  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  25.71 
 
 
412 aa  65.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  26.38 
 
 
461 aa  65.1  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6733  oxidoreductase molybdopterin binding  31.65 
 
 
608 aa  65.1  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  25.56 
 
 
361 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  26.38 
 
 
461 aa  64.7  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  25.09 
 
 
417 aa  64.3  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  32.68 
 
 
554 aa  64.3  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  23.73 
 
 
407 aa  64.3  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  26.02 
 
 
501 aa  64.3  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  26.14 
 
 
431 aa  63.5  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5892  oxidoreductase, molybdopterin binding  24.92 
 
 
335 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  22.73 
 
 
408 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  24.24 
 
 
367 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000878626  hitchhiker  0.00000000000608481 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1771  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.41 
 
 
532 aa  62.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  25.26 
 
 
405 aa  62.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  25.26 
 
 
405 aa  62.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  24.21 
 
 
359 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  23.23 
 
 
414 aa  62  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2651  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.87 
 
 
509 aa  62  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4544  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.16 
 
 
512 aa  61.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1452  oxidoreductase molybdopterin binding  26.8 
 
 
309 aa  61.6  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.952926  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16770  hypothetical protein  37.8 
 
 
92 aa  61.2  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.711837  normal  0.749784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0738  Sulfite oxidase-like protein  31.69 
 
 
488 aa  60.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247764  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  28.19 
 
 
270 aa  60.5  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  23.41 
 
 
425 aa  60.5  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.07 
 
 
453 aa  60.5  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2329  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.5 
 
 
512 aa  60.1  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  26.13 
 
 
420 aa  59.7  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3242  oxidoreductase molybdopterin binding  22.36 
 
 
410 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.842559 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  22.64 
 
 
406 aa  59.7  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  29.22 
 
 
420 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5905  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.53 
 
 
508 aa  60.1  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  29.87 
 
 
402 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  29.87 
 
 
406 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  23.55 
 
 
437 aa  59.3  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_3554  predicted protein  25 
 
 
375 aa  59.3  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.298587  normal  0.425378 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0833  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.82 
 
 
204 aa  59.3  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.358869 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.01 
 
 
199 aa  58.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  25.22 
 
 
400 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  27.33 
 
 
409 aa  58.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  24.75 
 
 
414 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  29.45 
 
 
231 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0604  oxidoreductase molybdopterin binding  30.77 
 
 
201 aa  57.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  25.31 
 
 
409 aa  57.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  21.21 
 
 
363 aa  57.4  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16780  sulfite oxidase-like oxidoreductase  27.19 
 
 
268 aa  57.4  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.610919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  24.65 
 
 
414 aa  57.4  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  26.49 
 
 
414 aa  57.8  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  24.7 
 
 
407 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  28.48 
 
 
445 aa  57.4  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  27.15 
 
 
429 aa  57  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4533  oxidoreductase, molybdopterin binding  30 
 
 
508 aa  57  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>