More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4230 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4230  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 
531 aa  1025    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3840  oxidoreductase, molybdopterin binding  90.75 
 
 
531 aa  832    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2651  oxidoreductase molybdopterin binding protein  53.54 
 
 
509 aa  485  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1739  Sulfite oxidase-like protein  53.41 
 
 
546 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.316961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5905  oxidoreductase molybdopterin binding protein  51.42 
 
 
508 aa  453  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0079  oxidoreductase molybdopterin binding protein  49.9 
 
 
511 aa  439  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5364  oxidoreductase molybdopterin binding protein  51.35 
 
 
545 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0160  oxidoreductase molybdopterin binding  49.6 
 
 
531 aa  437  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.21 
 
 
525 aa  437  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3188  oxidoreductase molybdopterin binding  49.6 
 
 
528 aa  434  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1443  oxidoreductase, molybdopterin binding  52.95 
 
 
520 aa  430  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.63286  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  48.21 
 
 
554 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  54.86 
 
 
515 aa  423  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3527  oxidoreductase molybdopterin binding  48.15 
 
 
534 aa  425  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.80252  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4544  oxidoreductase molybdopterin binding protein  48.94 
 
 
512 aa  422  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4265  oxidoreductase molybdopterin binding  48.18 
 
 
542 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0266604  normal  0.460277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0738  Sulfite oxidase-like protein  51.08 
 
 
488 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247764  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3761  oxidoreductase molybdopterin binding  51.04 
 
 
523 aa  407  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1445  oxidoreductase molybdopterin binding  48.92 
 
 
538 aa  405  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000237131 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  48.2 
 
 
570 aa  396  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1664  oxidoreductase molybdopterin binding  48.44 
 
 
524 aa  389  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.545601  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  46.34 
 
 
512 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.75 
 
 
505 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4023  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.56 
 
 
521 aa  384  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.351273  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.34 
 
 
512 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.04 
 
 
505 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.34 
 
 
512 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1771  oxidoreductase molybdopterin binding protein  62.46 
 
 
532 aa  360  5e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  56.77 
 
 
501 aa  335  7.999999999999999e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4533  oxidoreductase, molybdopterin binding  54.68 
 
 
508 aa  335  1e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484625  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6733  oxidoreductase molybdopterin binding  52.74 
 
 
608 aa  327  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4789  oxidoreductase molybdopterin binding protein  53.22 
 
 
552 aa  312  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0102171  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.98 
 
 
501 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2513  oxidoreductase molybdopterin binding  40.88 
 
 
528 aa  198  3e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  36.67 
 
 
489 aa  194  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  37.35 
 
 
465 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2329  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.07 
 
 
512 aa  176  7e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  35.62 
 
 
505 aa  173  6.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  37.86 
 
 
370 aa  139  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  31.44 
 
 
376 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  31.82 
 
 
403 aa  127  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  31.82 
 
 
402 aa  127  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  32.79 
 
 
401 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  28.75 
 
 
405 aa  124  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  28.75 
 
 
405 aa  124  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  32.47 
 
 
403 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.63 
 
 
415 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.17 
 
 
400 aa  120  6e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  33.77 
 
 
372 aa  118  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  30.84 
 
 
402 aa  117  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  31.67 
 
 
431 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  33.11 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  29.75 
 
 
363 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  34.52 
 
 
414 aa  113  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  31.78 
 
 
426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.8 
 
 
400 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  30.52 
 
 
431 aa  111  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  31.95 
 
 
428 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.5 
 
 
199 aa  108  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  29.41 
 
 
419 aa  108  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  31.95 
 
 
428 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0778  oxidoreductase molybdopterin binding  31.32 
 
 
229 aa  107  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00214347  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  30 
 
 
406 aa  106  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  30.05 
 
 
410 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  28.81 
 
 
437 aa  106  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  32.65 
 
 
423 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  31.72 
 
 
402 aa  103  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  30 
 
 
408 aa  103  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  31.55 
 
 
412 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  27.2 
 
 
369 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  31.73 
 
 
417 aa  102  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  29.51 
 
 
429 aa  101  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  31.8 
 
 
401 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0643  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.56 
 
 
209 aa  100  6e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  31.49 
 
 
361 aa  100  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  31.76 
 
 
359 aa  100  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  31.23 
 
 
367 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000878626  hitchhiker  0.00000000000608481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  30.9 
 
 
409 aa  99  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1107  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.4 
 
 
207 aa  98.6  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.266904  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  29.97 
 
 
405 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  29.32 
 
 
414 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  31.07 
 
 
406 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  30.63 
 
 
409 aa  98.2  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  27.7 
 
 
420 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  31.07 
 
 
402 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  30.1 
 
 
437 aa  97.8  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.88 
 
 
200 aa  95.9  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.54 
 
 
415 aa  96.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  27.97 
 
 
427 aa  96.3  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  30.67 
 
 
414 aa  96.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  30.63 
 
 
338 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  30.67 
 
 
434 aa  95.9  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  28.4 
 
 
407 aa  94.7  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.16 
 
 
406 aa  95.1  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1672  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.8 
 
 
221 aa  94.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.476748  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0801  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.27 
 
 
451 aa  94  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.325021  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5892  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.97 
 
 
335 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  29.05 
 
 
414 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0389  oxidoreductase molybdopterin binding  38.79 
 
 
231 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  26.63 
 
 
369 aa  91.3  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.300119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>