More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0738 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0738  Sulfite oxidase-like protein  100 
 
 
488 aa  930    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247764  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5364  oxidoreductase molybdopterin binding protein  52.51 
 
 
545 aa  442  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4265  oxidoreductase molybdopterin binding  50.68 
 
 
542 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0266604  normal  0.460277 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0079  oxidoreductase molybdopterin binding protein  50.1 
 
 
511 aa  422  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3527  oxidoreductase molybdopterin binding  51.9 
 
 
534 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.80252  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3761  oxidoreductase molybdopterin binding  54.02 
 
 
523 aa  411  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1739  Sulfite oxidase-like protein  51.49 
 
 
546 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.316961 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3840  oxidoreductase, molybdopterin binding  50.98 
 
 
531 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4544  oxidoreductase molybdopterin binding protein  49.6 
 
 
512 aa  396  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.39 
 
 
525 aa  390  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5905  oxidoreductase molybdopterin binding protein  50.4 
 
 
508 aa  391  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2651  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.19 
 
 
509 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  47.5 
 
 
554 aa  385  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0160  oxidoreductase molybdopterin binding  46.26 
 
 
531 aa  381  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3188  oxidoreductase molybdopterin binding  46.06 
 
 
528 aa  378  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.58 
 
 
505 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  49.3 
 
 
515 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  46.64 
 
 
512 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.64 
 
 
512 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4230  oxidoreductase molybdopterin binding  50.1 
 
 
531 aa  368  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.64 
 
 
512 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1445  oxidoreductase molybdopterin binding  49.69 
 
 
538 aa  361  1e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000237131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.57 
 
 
505 aa  359  5e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1443  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.07 
 
 
520 aa  359  7e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.63286  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1664  oxidoreductase molybdopterin binding  47.19 
 
 
524 aa  350  3e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.545601  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4023  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.44 
 
 
521 aa  350  4e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.351273  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4533  oxidoreductase, molybdopterin binding  56.17 
 
 
508 aa  344  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484625  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6733  oxidoreductase molybdopterin binding  55.34 
 
 
608 aa  341  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  56.1 
 
 
570 aa  317  3e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1771  oxidoreductase molybdopterin binding protein  55.15 
 
 
532 aa  307  3e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4789  oxidoreductase molybdopterin binding protein  52.88 
 
 
552 aa  300  6e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0102171  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  51.13 
 
 
501 aa  298  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.9 
 
 
501 aa  188  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2513  oxidoreductase molybdopterin binding  31.6 
 
 
528 aa  187  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  37.46 
 
 
465 aa  180  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  34.99 
 
 
505 aa  171  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  31.33 
 
 
489 aa  170  5e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2329  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.76 
 
 
512 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  30.9 
 
 
376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  36.93 
 
 
372 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  34.91 
 
 
370 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  34.43 
 
 
369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  35.67 
 
 
414 aa  109  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.11 
 
 
415 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.84 
 
 
415 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  31.99 
 
 
409 aa  103  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  29.68 
 
 
405 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  29.68 
 
 
405 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  28.18 
 
 
405 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  33.22 
 
 
406 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  33.22 
 
 
402 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  28.57 
 
 
431 aa  95.9  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  30.1 
 
 
403 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0778  oxidoreductase molybdopterin binding  29.23 
 
 
229 aa  93.6  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00214347  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  31.27 
 
 
361 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  30.77 
 
 
419 aa  92.4  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  29.58 
 
 
445 aa  92.8  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.83 
 
 
400 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  30.72 
 
 
437 aa  92  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  30.32 
 
 
406 aa  90.9  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  32.6 
 
 
402 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  28.85 
 
 
402 aa  89.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  27.73 
 
 
412 aa  89.7  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.19 
 
 
400 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  30.46 
 
 
429 aa  89  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  27.24 
 
 
437 aa  88.2  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  31.19 
 
 
418 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2728  oxidoreductase molybdopterin binding  28.36 
 
 
409 aa  87.4  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  29.9 
 
 
431 aa  87.4  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  30.82 
 
 
426 aa  87  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  26.7 
 
 
407 aa  86.3  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  29.15 
 
 
406 aa  86.7  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  27.08 
 
 
363 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1599  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.61 
 
 
409 aa  85.5  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  30.14 
 
 
423 aa  85.5  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  29.04 
 
 
417 aa  85.1  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  28.95 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  26.79 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.93 
 
 
418 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.93 
 
 
418 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  29.55 
 
 
402 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  34.8 
 
 
401 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  31.88 
 
 
403 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  30.06 
 
 
359 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  31.02 
 
 
424 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  26.54 
 
 
451 aa  83.2  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  30.04 
 
 
453 aa  82.8  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  28.88 
 
 
428 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  28.88 
 
 
428 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  29.64 
 
 
427 aa  82.8  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0643  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.61 
 
 
209 aa  82  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.7 
 
 
237 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  33.14 
 
 
270 aa  82.4  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.98 
 
 
425 aa  81.6  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  28.88 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1452  oxidoreductase molybdopterin binding  31.2 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.952926  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.84 
 
 
453 aa  80.1  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  31.29 
 
 
406 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  30.18 
 
 
430 aa  80.1  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1107  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.28 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.266904  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>