More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3840 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4230  oxidoreductase molybdopterin binding  90.75 
 
 		 531 aa  785    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3840  oxidoreductase, molybdopterin binding  100 
 
 		 531 aa  1026    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2651  oxidoreductase molybdopterin binding protein  53.45 
 
 		 509 aa  481  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1739  Sulfite oxidase-like protein  53.33 
 
 		 546 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.316961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5905  oxidoreductase molybdopterin binding protein  51.79 
 
 		 508 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5364  oxidoreductase molybdopterin binding protein  49.81 
 
 		 545 aa  438  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0079  oxidoreductase molybdopterin binding protein  48.75 
 
 		 511 aa  430  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3527  oxidoreductase molybdopterin binding  48.63 
 
 		 534 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.80252  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.34 
 
 		 525 aa  430  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3188  oxidoreductase molybdopterin binding  49 
 
 		 528 aa  426  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0160  oxidoreductase molybdopterin binding  48.19 
 
 		 531 aa  427  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1443  oxidoreductase, molybdopterin binding  52.76 
 
 		 520 aa  428  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.63286  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  53.31 
 
 		 515 aa  419  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4265  oxidoreductase molybdopterin binding  47.98 
 
 		 542 aa  418  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0266604  normal  0.460277 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3761  oxidoreductase molybdopterin binding  50.67 
 
 		 523 aa  415  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  46.79 
 
 		 554 aa  414  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4544  oxidoreductase molybdopterin binding protein  48.05 
 
 		 512 aa  413  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0738  Sulfite oxidase-like protein  50.98 
 
 		 488 aa  415  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1445  oxidoreductase molybdopterin binding  49.21 
 
 		 538 aa  409  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000237131 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1664  oxidoreductase molybdopterin binding  49.22 
 
 		 524 aa  399  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.545601  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  48.5 
 
 		 570 aa  399  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  47.23 
 
 		 512 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.23 
 
 		 512 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.23 
 
 		 512 aa  386  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4023  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.39 
 
 		 521 aa  383  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.351273  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.05 
 
 		 505 aa  378  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  45.87 
 
 		 505 aa  378  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4789  oxidoreductase molybdopterin binding protein  48.66 
 
 		 552 aa  363  4e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0102171  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1771  oxidoreductase molybdopterin binding protein  54.97 
 
 		 532 aa  360  4e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  56.35 
 
 		 501 aa  330  4e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4533  oxidoreductase, molybdopterin binding  53.61 
 
 		 508 aa  330  4e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484625  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6733  oxidoreductase molybdopterin binding  50.28 
 
 		 608 aa  322  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.22 
 
 		 501 aa  217  4e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2513  oxidoreductase molybdopterin binding  42.71 
 
 		 528 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  37.12 
 
 		 489 aa  194  4e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  40.2 
 
 		 465 aa  190  7e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2329  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.51 
 
 		 512 aa  176  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  33.51 
 
 		 505 aa  167  5e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  39.19 
 
 		 370 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  31.69 
 
 		 376 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  33.12 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  33.12 
 
 		 402 aa  126  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  29.05 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  32.47 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  29.05 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  34.65 
 
 		 372 aa  121  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  32.79 
 
 		 403 aa  120  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.63 
 
 		 415 aa  120  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  31.29 
 
 		 431 aa  117  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  33.02 
 
 		 414 aa  116  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.52 
 
 		 400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  33.76 
 
 		 369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.69 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  30 
 
 		 402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  32.91 
 
 		 428 aa  113  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  32.91 
 
 		 428 aa  113  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  31.41 
 
 		 426 aa  113  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  29.27 
 
 		 363 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  28.48 
 
 		 437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  30.03 
 
 		 419 aa  110  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.65 
 
 		 408 aa  110  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  30.52 
 
 		 431 aa  110  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  33.11 
 
 		 423 aa  107  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  33.14 
 
 		 359 aa  107  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  31.28 
 
 		 361 aa  107  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  32.59 
 
 		 412 aa  106  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0778  oxidoreductase molybdopterin binding  31.32 
 
 		 229 aa  106  9e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00214347  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.92 
 
 		 199 aa  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  29.68 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.14 
 
 		 415 aa  104  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  29.52 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  31.73 
 
 		 402 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  30.96 
 
 		 414 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  30.17 
 
 		 429 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1107  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.04 
 
 		 207 aa  100  6e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.266904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  31.58 
 
 		 409 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  28.1 
 
 		 427 aa  100  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0643  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.14 
 
 		 209 aa  100  8e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  28.82 
 
 		 369 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5892  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.7 
 
 		 335 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  31.15 
 
 		 338 aa  99  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  30.33 
 
 		 409 aa  98.6  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  30.12 
 
 		 406 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  31.8 
 
 		 401 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1672  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.02 
 
 		 221 aa  98.2  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.476748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  30.12 
 
 		 402 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  28.36 
 
 		 407 aa  98.2  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  29.41 
 
 		 414 aa  97.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4627  oxidoreductase molybdopterin binding  30.42 
 
 		 414 aa  97.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1487  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.16 
 
 		 406 aa  97.1  8e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2781  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  30.28 
 
 		 434 aa  96.7  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.446362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7230  oxidoreductase molybdopterin binding  30.31 
 
 		 406 aa  96.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  27.36 
 
 		 420 aa  96.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0389  oxidoreductase molybdopterin binding  40 
 
 		 231 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  27.88 
 
 		 405 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  31.09 
 
 		 417 aa  95.1  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0151  putative sulfite oxidase  29.91 
 
 		 419 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  29.77 
 
 		 437 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  30.14 
 
 		 424 aa  94.7  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.3 
 
 		 200 aa  94.4  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>