More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4544 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4544  oxidoreductase molybdopterin binding protein  100 
 
 		 512 aa  1014    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0079  oxidoreductase molybdopterin binding protein  59.6 
 
 		 511 aa  543  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3761  oxidoreductase molybdopterin binding  50.69 
 
 		 523 aa  432  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1443  oxidoreductase, molybdopterin binding  50.42 
 
 		 520 aa  426  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.63286  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  45.42 
 
 		 554 aa  424  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  50.1 
 
 		 505 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0160  oxidoreductase molybdopterin binding  48.27 
 
 		 531 aa  422  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.48 
 
 		 505 aa  420  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3188  oxidoreductase molybdopterin binding  48.27 
 
 		 528 aa  418  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.56 
 
 		 525 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  47.34 
 
 		 570 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  47.84 
 
 		 512 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.84 
 
 		 512 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.84 
 
 		 512 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3527  oxidoreductase molybdopterin binding  45.34 
 
 		 534 aa  404  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.80252  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  50.1 
 
 		 515 aa  403  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1739  Sulfite oxidase-like protein  47.74 
 
 		 546 aa  405  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.316961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2651  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.53 
 
 		 509 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5905  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.79 
 
 		 508 aa  397  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0738  Sulfite oxidase-like protein  50.31 
 
 		 488 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5364  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.35 
 
 		 545 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3840  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.59 
 
 		 531 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4230  oxidoreductase molybdopterin binding  48.9 
 
 		 531 aa  384  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1664  oxidoreductase molybdopterin binding  48.04 
 
 		 524 aa  373  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.545601  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4265  oxidoreductase molybdopterin binding  43.5 
 
 		 542 aa  372  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0266604  normal  0.460277 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1445  oxidoreductase molybdopterin binding  59.72 
 
 		 538 aa  350  3e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000237131 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4023  oxidoreductase, molybdopterin binding  43 
 
 		 521 aa  346  6e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.351273  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4533  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.01 
 
 		 508 aa  342  9e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484625  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6733  oxidoreductase molybdopterin binding  50.61 
 
 		 608 aa  327  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1771  oxidoreductase molybdopterin binding protein  54.02 
 
 		 532 aa  318  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4789  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.92 
 
 		 552 aa  283  5.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0102171  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  46.03 
 
 		 501 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.29 
 
 		 501 aa  179  9e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.55 
 
 		 465 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2329  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.33 
 
 		 512 aa  172  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  28.87 
 
 		 489 aa  170  5e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  31.22 
 
 		 505 aa  168  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2513  oxidoreductase molybdopterin binding  35.89 
 
 		 528 aa  167  5.9999999999999996e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  29.24 
 
 		 376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  31.79 
 
 		 372 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  26.55 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  29.34 
 
 		 402 aa  104  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  30.64 
 
 		 369 aa  104  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  31.72 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  26.49 
 
 		 414 aa  100  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  29.82 
 
 		 405 aa  100  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  29.82 
 
 		 405 aa  100  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.86 
 
 		 400 aa  99.8  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  29.69 
 
 		 402 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  30.5 
 
 		 401 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  27.31 
 
 		 420 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  29.69 
 
 		 403 aa  99  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  27.84 
 
 		 437 aa  98.6  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.18 
 
 		 415 aa  98.2  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  28.33 
 
 		 431 aa  97.8  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  29.16 
 
 		 410 aa  97.1  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  31.29 
 
 		 370 aa  96.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.57 
 
 		 400 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0340  oxidoreductase molybdopterin binding  26.92 
 
 		 405 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  28.75 
 
 		 403 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1615  oxidoreductase molybdopterin binding  29.15 
 
 		 414 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  26.74 
 
 		 429 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  25.15 
 
 		 369 aa  93.6  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  30.45 
 
 		 361 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  28.67 
 
 		 409 aa  92.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2060  twin-arginine translocation pathway signal  27.01 
 
 		 445 aa  91.3  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000389133  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  27.05 
 
 		 409 aa  90.9  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  28.57 
 
 		 414 aa  90.5  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  29.17 
 
 		 423 aa  90.5  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  28.33 
 
 		 431 aa  90.5  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.06 
 
 		 199 aa  90.5  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  27.59 
 
 		 419 aa  90.1  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  34.84 
 
 		 270 aa  90.5  7e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  35.26 
 
 		 227 aa  90.5  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.81 
 
 		 200 aa  90.1  8e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  29.27 
 
 		 417 aa  89.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  23.96 
 
 		 369 aa  89.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  26.92 
 
 		 407 aa  89.4  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0643  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.56 
 
 		 209 aa  88.6  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0778  oxidoreductase molybdopterin binding  30.3 
 
 		 229 aa  88.6  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00214347  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  26.71 
 
 		 414 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2988  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.6 
 
 		 425 aa  88.6  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  27.48 
 
 		 401 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  28.2 
 
 		 437 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  26.96 
 
 		 440 aa  87.4  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 425 aa  87.4  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.48 
 
 		 416 aa  87  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  28.27 
 
 		 451 aa  87  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1107  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.77 
 
 		 207 aa  87  8e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.266904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  27.63 
 
 		 461 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.58 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  27.44 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3171  oxidoreductase molybdopterin binding  34.57 
 
 		 220 aa  85.9  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0537179  normal  0.5179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.21 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  0.0000568946 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  27.44 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  28.04 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  27.63 
 
 		 461 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.8 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5892  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.93 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  27.37 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.207777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>