More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6733 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6733  oxidoreductase molybdopterin binding  100 
 
 		 608 aa  1169    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0079  oxidoreductase molybdopterin binding protein  55.7 
 
 		 511 aa  346  7e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5364  oxidoreductase molybdopterin binding protein  49.75 
 
 		 545 aa  345  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0738  Sulfite oxidase-like protein  55.34 
 
 		 488 aa  341  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0160  oxidoreductase molybdopterin binding  51.06 
 
 		 531 aa  337  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3188  oxidoreductase molybdopterin binding  51.06 
 
 		 528 aa  335  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.2 
 
 		 525 aa  335  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1739  Sulfite oxidase-like protein  49.75 
 
 		 546 aa  333  4e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.316961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4265  oxidoreductase molybdopterin binding  51.99 
 
 		 542 aa  331  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0266604  normal  0.460277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  50.87 
 
 		 505 aa  328  3e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  50.28 
 
 		 505 aa  325  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4544  oxidoreductase molybdopterin binding protein  53 
 
 		 512 aa  324  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4023  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.32 
 
 		 521 aa  321  3e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.351273  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3527  oxidoreductase molybdopterin binding  50.27 
 
 		 534 aa  320  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.80252  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  52.29 
 
 		 512 aa  319  7e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  52.29 
 
 		 512 aa  319  7e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  52.29 
 
 		 512 aa  319  7e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  54.58 
 
 		 515 aa  318  2e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3761  oxidoreductase molybdopterin binding  54.3 
 
 		 523 aa  315  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3840  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.81 
 
 		 531 aa  311  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1445  oxidoreductase molybdopterin binding  49.44 
 
 		 538 aa  308  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000237131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5905  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.7 
 
 		 508 aa  307  5.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2651  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.41 
 
 		 509 aa  301  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  48.02 
 
 		 554 aa  300  3e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4230  oxidoreductase molybdopterin binding  54.67 
 
 		 531 aa  299  8e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  49.16 
 
 		 570 aa  299  9e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1443  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.83 
 
 		 520 aa  297  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.63286  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1664  oxidoreductase molybdopterin binding  47.46 
 
 		 524 aa  296  8e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.545601  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4533  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.68 
 
 		 508 aa  283  8.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484625  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4789  oxidoreductase molybdopterin binding protein  49.13 
 
 		 552 aa  279  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0102171  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1771  oxidoreductase molybdopterin binding protein  45.21 
 
 		 532 aa  273  5.000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  48.23 
 
 		 501 aa  270  4e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.83 
 
 		 501 aa  205  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2513  oxidoreductase molybdopterin binding  38.33 
 
 		 528 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  33.88 
 
 		 505 aa  171  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  37.25 
 
 		 465 aa  167  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  33.71 
 
 		 489 aa  167  5.9999999999999996e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2329  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.81 
 
 		 512 aa  144  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  32.11 
 
 		 376 aa  120  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  32.05 
 
 		 405 aa  114  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  32.05 
 
 		 405 aa  114  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.53 
 
 		 415 aa  110  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.68 
 
 		 400 aa  108  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  30.67 
 
 		 372 aa  104  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  28.34 
 
 		 402 aa  103  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.94 
 
 		 453 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  30.56 
 
 		 369 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  31.56 
 
 		 361 aa  101  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  31.49 
 
 		 402 aa  101  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  31.49 
 
 		 403 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  29.75 
 
 		 406 aa  100  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  32.69 
 
 		 401 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  29.92 
 
 		 401 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.31 
 
 		 200 aa  99.4  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  28.28 
 
 		 420 aa  99  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  36.72 
 
 		 270 aa  97.8  5e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  28.71 
 
 		 403 aa  97.8  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  32.58 
 
 		 359 aa  97.1  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  31.25 
 
 		 420 aa  96.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  30.48 
 
 		 417 aa  95.9  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  30.87 
 
 		 406 aa  95.5  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  29.87 
 
 		 370 aa  95.5  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  28.7 
 
 		 431 aa  94.7  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  31.95 
 
 		 428 aa  94.4  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  31.95 
 
 		 428 aa  94.4  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  27.5 
 
 		 363 aa  94.4  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0643  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.27 
 
 		 209 aa  94  8e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5267  oxidoreductase molybdopterin binding  31.21 
 
 		 407 aa  94  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.67 
 
 		 415 aa  93.2  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4155  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.32 
 
 		 430 aa  93.6  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  36.04 
 
 		 349 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.94 
 
 		 199 aa  90.9  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  27.93 
 
 		 407 aa  90.9  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  29.83 
 
 		 408 aa  90.1  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  30.35 
 
 		 417 aa  89.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.55 
 
 		 408 aa  89.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  36.18 
 
 		 227 aa  90.1  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  30.1 
 
 		 409 aa  89.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  28.53 
 
 		 412 aa  89  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5892  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.74 
 
 		 335 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  29.75 
 
 		 440 aa  88.6  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  31.6 
 
 		 414 aa  87.8  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  28.52 
 
 		 453 aa  87.8  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  30.51 
 
 		 430 aa  87  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4218  oxidoreductase molybdopterin binding  32.99 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  29.34 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2838  twin-arginine translocation pathway signal  30.41 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  27.02 
 
 		 451 aa  85.9  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  31.25 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  25.85 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344343 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  29.76 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118836 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  30.07 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  25.19 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0389  oxidoreductase molybdopterin binding  36.14 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  31.21 
 
 		 406 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2166  putative sulfite oxidase, dehydrogenase subunit(SoxC)  31.21 
 
 		 424 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  31.21 
 
 		 402 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0916  twin-arginine translocation pathway signal  26.86 
 
 		 461 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4081  twin-arginine translocation pathway signal  26.86 
 
 		 461 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.08 
 
 		 416 aa  82.8  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>