More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4789 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4789  oxidoreductase molybdopterin binding protein  100 
 
 		 552 aa  1065    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0102171  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3840  oxidoreductase, molybdopterin binding  50.87 
 
 		 531 aa  405  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5905  oxidoreductase molybdopterin binding protein  48.22 
 
 		 508 aa  398  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4265  oxidoreductase molybdopterin binding  45.83 
 
 		 542 aa  398  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0266604  normal  0.460277 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5364  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.89 
 
 		 545 aa  391  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0738  Sulfite oxidase-like protein  48.14 
 
 		 488 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2651  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.47 
 
 		 509 aa  386  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1739  Sulfite oxidase-like protein  46.8 
 
 		 546 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.316961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3527  oxidoreductase molybdopterin binding  44.04 
 
 		 534 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.80252  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3761  oxidoreductase molybdopterin binding  47.27 
 
 		 523 aa  382  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.12 
 
 		 525 aa  382  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0160  oxidoreductase molybdopterin binding  43.91 
 
 		 531 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  43.55 
 
 		 554 aa  378  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3188  oxidoreductase molybdopterin binding  43.51 
 
 		 528 aa  371  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4230  oxidoreductase molybdopterin binding  49.22 
 
 		 531 aa  366  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0079  oxidoreductase molybdopterin binding protein  44.34 
 
 		 511 aa  366  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4544  oxidoreductase molybdopterin binding protein  43.7 
 
 		 512 aa  363  5.0000000000000005e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1443  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.55 
 
 		 520 aa  348  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.63286  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1445  oxidoreductase molybdopterin binding  44.57 
 
 		 538 aa  336  7e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000237131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  42.72 
 
 		 505 aa  336  7.999999999999999e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  41.8 
 
 		 505 aa  333  5e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.97 
 
 		 512 aa  323  6e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  40.97 
 
 		 512 aa  323  6e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.97 
 
 		 512 aa  323  6e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  39.96 
 
 		 570 aa  316  8e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  43.13 
 
 		 515 aa  310  5.9999999999999995e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4533  oxidoreductase, molybdopterin binding  51.9 
 
 		 508 aa  310  5.9999999999999995e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484625  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6733  oxidoreductase molybdopterin binding  47.43 
 
 		 608 aa  295  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1664  oxidoreductase molybdopterin binding  39.85 
 
 		 524 aa  290  5.0000000000000004e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.545601  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4023  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.32 
 
 		 521 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.351273  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  45.45 
 
 		 501 aa  259  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1771  oxidoreductase molybdopterin binding protein  45.08 
 
 		 532 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  38.44 
 
 		 501 aa  193  8e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  33.27 
 
 		 489 aa  189  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  37.05 
 
 		 465 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2513  oxidoreductase molybdopterin binding  36.88 
 
 		 528 aa  172  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2329  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.16 
 
 		 512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  35.44 
 
 		 505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  30.7 
 
 		 403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  33.11 
 
 		 370 aa  114  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  33.99 
 
 		 414 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  29.9 
 
 		 406 aa  108  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  29.17 
 
 		 405 aa  108  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  34.74 
 
 		 376 aa  108  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  29.17 
 
 		 405 aa  108  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.67 
 
 		 400 aa  107  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  30.96 
 
 		 372 aa  107  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  29.58 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  29.58 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  29.73 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  30.55 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  29.74 
 
 		 431 aa  100  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.9 
 
 		 416 aa  100  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  30.08 
 
 		 419 aa  100  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0561  sulfite dehydrogenase  32.65 
 
 		 414 aa  99.4  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  29.77 
 
 		 428 aa  99  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  29.77 
 
 		 428 aa  99  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  28.18 
 
 		 402 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3931  Sulfite oxidase  27.72 
 
 		 407 aa  95.9  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.53 
 
 		 408 aa  94.7  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.85 
 
 		 199 aa  94.4  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0778  oxidoreductase molybdopterin binding  30.48 
 
 		 229 aa  92.8  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00214347  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  28.27 
 
 		 363 aa  93.6  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1175  oxidoreductase molybdopterin binding  26.57 
 
 		 408 aa  92.8  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000118836 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4252  twin-arginine translocation pathway signal  29.93 
 
 		 425 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.22 
 
 		 415 aa  90.9  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  30.07 
 
 		 409 aa  90.9  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0981  oxidoreductase molybdopterin binding  25.67 
 
 		 408 aa  90.9  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.036164  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  28.08 
 
 		 369 aa  90.1  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0035  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  28.84 
 
 		 406 aa  89.4  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.7902  normal  0.133868 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1452  oxidoreductase molybdopterin binding  27.14 
 
 		 309 aa  89.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.952926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5264  sulfite oxidase  29.71 
 
 		 361 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1622  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  29.62 
 
 		 446 aa  87.4  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8530  oxidoreductase molybdopterin binding  31.67 
 
 		 349 aa  87.4  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  28.52 
 
 		 431 aa  87  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1093  twin-arginine translocation pathway signal  27.8 
 
 		 425 aa  87  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3083  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  28.21 
 
 		 417 aa  87  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741387  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  31.55 
 
 		 270 aa  86.7  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  29.08 
 
 		 440 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0715  oxidoreductase, molybdopterin-binding  27.03 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0055  oxidoreductase molybdopterin binding  29.15 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  28.85 
 
 		 367 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000878626  hitchhiker  0.00000000000608481 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.78 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  28.25 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0007  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.57 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000559992 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2981  putative molydopterin binding oxidoreductase  27.23 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4368  twin-arginine translocation pathway signal  29.23 
 
 		 425 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.21 
 
 		 200 aa  84.7  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.37 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  29.21 
 
 		 429 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0007  oxidoreductase, molybdopterin binding  26.26 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  28.52 
 
 		 437 aa  84  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0007  oxidoreductase molybdopterin binding  27 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.01327 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  26.43 
 
 		 451 aa  83.6  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  27.22 
 
 		 401 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3664  oxidoreductase molybdopterin binding  29.51 
 
 		 402 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.185653  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  26.52 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3339  oxidoreductase molybdopterin binding  29.51 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.617225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5280  sulfite oxidase  30.82 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2735  oxidoreductase molybdopterin binding protein  28.21 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.313353  hitchhiker  0.0000568946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>