More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0079 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0079  oxidoreductase molybdopterin binding protein  100 
 
 		 511 aa  1008    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.256372  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4544  oxidoreductase molybdopterin binding protein  59.6 
 
 		 512 aa  560  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0327  oxidoreductase molybdopterin binding  47.25 
 
 		 554 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0160  oxidoreductase molybdopterin binding  49.49 
 
 		 531 aa  444  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3188  oxidoreductase molybdopterin binding  49.69 
 
 		 528 aa  444  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3407  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.88 
 
 		 525 aa  442  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5364  oxidoreductase molybdopterin binding protein  49.71 
 
 		 545 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2026  oxidoreductase, molybdopterin binding  50.85 
 
 		 505 aa  430  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3840  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.21 
 
 		 531 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0738  Sulfite oxidase-like protein  48.77 
 
 		 488 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.247764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1801  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  48.51 
 
 		 512 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1848  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.51 
 
 		 512 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.45213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1782  oxidoreductase, molybdopterin binding  48.51 
 
 		 512 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.133498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3761  oxidoreductase molybdopterin binding  50.1 
 
 		 523 aa  420  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4320  oxidoreductase, molybdopterin binding  49.48 
 
 		 505 aa  421  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2651  oxidoreductase molybdopterin binding protein  47.13 
 
 		 509 aa  415  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4230  oxidoreductase molybdopterin binding  50.2 
 
 		 531 aa  411  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.14088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5905  oxidoreductase molybdopterin binding protein  46.05 
 
 		 508 aa  401  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1388  oxidoreductase molybdopterin binding protein  48.27 
 
 		 515 aa  401  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5094  oxidoreductase molybdopterin binding  45.26 
 
 		 570 aa  396  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1664  oxidoreductase molybdopterin binding  49.19 
 
 		 524 aa  394  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.545601  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3527  oxidoreductase molybdopterin binding  44.85 
 
 		 534 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.80252  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1739  Sulfite oxidase-like protein  45.97 
 
 		 546 aa  388  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.316961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4265  oxidoreductase molybdopterin binding  42.52 
 
 		 542 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0266604  normal  0.460277 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1443  oxidoreductase, molybdopterin binding  47.73 
 
 		 520 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.63286  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4533  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.6 
 
 		 508 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.484625  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1445  oxidoreductase molybdopterin binding  48.55 
 
 		 538 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000237131 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4023  oxidoreductase, molybdopterin binding  44.84 
 
 		 521 aa  361  1e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.351273  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1771  oxidoreductase molybdopterin binding protein  58.14 
 
 		 532 aa  350  3e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0572452  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6733  oxidoreductase molybdopterin binding  55.7 
 
 		 608 aa  343  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4789  oxidoreductase molybdopterin binding protein  52.23 
 
 		 552 aa  309  6.999999999999999e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0102171  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2426  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  47.04 
 
 		 501 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.11 
 
 		 501 aa  204  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2513  oxidoreductase molybdopterin binding  37.11 
 
 		 528 aa  182  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1764  oxidoreductase molybdopterin binding  33.65 
 
 		 505 aa  181  4e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.79 
 
 		 465 aa  179  9e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2329  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.73 
 
 		 512 aa  176  9e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1532  oxidoreductase molybdopterin binding  32.08 
 
 		 489 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.235509  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2351  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  31.88 
 
 		 376 aa  127  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2981  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.06 
 
 		 415 aa  124  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000198483  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2626  Sulfite oxidase  32.69 
 
 		 370 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3748  oxidoreductase molybdopterin binding  30.49 
 
 		 372 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6301  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.74 
 
 		 400 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.386808  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6453  oxidoreductase molybdopterin binding  31.27 
 
 		 401 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.662727 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5388  oxidoreductase molybdopterin binding  28.35 
 
 		 403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  0.947595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2704  oxidoreductase molybdopterin binding  30.11 
 
 		 402 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3951  nitrate reductase (NADH)  31.27 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8369  oxidoreductase molybdopterin binding  29.79 
 
 		 403 aa  111  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0255  oxidoreductase molybdopterin binding  29.63 
 
 		 405 aa  111  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.0149347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2672  oxidoreductase molybdopterin binding  29.63 
 
 		 405 aa  111  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125752 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0460  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.11 
 
 		 415 aa  111  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8664  oxidoreductase molybdopterin binding  29.49 
 
 		 401 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3913  hypothetical protein  30.82 
 
 		 420 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3022  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.18 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4894  oxidoreductase molybdopterin binding  29.62 
 
 		 369 aa  107  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344343 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.65 
 
 		 199 aa  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8677  oxidoreductase molybdopterin binding  30.14 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.12671  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1894  twin-arginine translocation pathway signal precursor  28.72 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2867  Nitrate reductase (NADH)  30.43 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1504  sulfite oxidase SoxC, putative  29.84 
 
 		 419 aa  103  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545192  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2692  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.37 
 
 		 408 aa  103  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.339066  normal  0.961864 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5008  oxidoreductase molybdopterin binding  30.33 
 
 		 338 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4929  oxidoreductase, molybdopterin-binding  26.28 
 
 		 414 aa  101  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0949  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorA apoprotein  30.41 
 
 		 412 aa  101  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3202  LigA protein  30.25 
 
 		 428 aa  100  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152966  unclonable  0.00000538057 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3445  cytochrome c class I  30.25 
 
 		 428 aa  100  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.456547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3394  twin-arginine translocation pathway signal  28.27 
 
 		 402 aa  100  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0686  oxidoreductase molybdopterin binding  27.68 
 
 		 369 aa  100  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.300119 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.98 
 
 		 200 aa  99.4  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0911  putative sulfite oxidase  27.86 
 
 		 437 aa  99.8  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.911487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11777  hypothetical protein  30.34 
 
 		 367 aa  99  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000878626  hitchhiker  0.00000000000608481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4886  putative sulfite oxidase (soxC)  30.14 
 
 		 409 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.592405 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0778  oxidoreductase molybdopterin binding  30.77 
 
 		 229 aa  98.2  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00214347  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5873  oxidoreductase molybdopterin binding  28.77 
 
 		 414 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342004  normal  0.20315 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3212  oxidoreductase molybdopterin binding  31.39 
 
 		 423 aa  97.1  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2802  oxidoreductase  29 
 
 		 425 aa  97.1  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4215  oxidoreductase molybdopterin binding  30.42 
 
 		 402 aa  96.7  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.223271 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6027  oxidoreductase molybdopterin binding  27.43 
 
 		 369 aa  96.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0144452 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0432  Sulfite oxidase  28.54 
 
 		 409 aa  96.3  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203271 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1480  oxidoreductase molybdopterin binding  35.22 
 
 		 270 aa  94.7  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.68285  normal  0.18047 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4891  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit A  27.84 
 
 		 410 aa  94.4  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.935481  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1978  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.16 
 
 		 416 aa  94  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.956228  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1455  oxidoreductase molybdopterin binding  27.44 
 
 		 406 aa  93.6  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431852  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0643  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.39 
 
 		 209 aa  93.2  9e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2864  sulfite oxidase  26.97 
 
 		 363 aa  93.6  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0156  Mo-Co oxidoreductase dimerisation subunit  28.42 
 
 		 453 aa  92.8  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000433271  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4055  Nitrate reductase (NADH)  28.21 
 
 		 414 aa  93.2  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4957  oxidoreductase molybdopterin binding  26.58 
 
 		 431 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2086  sulfite oxidase SoxC, putative  27.65 
 
 		 431 aa  92.8  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29998  normal  0.615224 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1238  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.79 
 
 		 418 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6198  oxidoreductase molybdopterin binding  29.79 
 
 		 418 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6594  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.79 
 
 		 418 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0853456 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0686  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.91 
 
 		 453 aa  91.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.51607  normal  0.0249066 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4161  oxidoreductase molybdopterin binding  28.96 
 
 		 430 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3041  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.96 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0084  oxidoreductase molybdopterin binding  27.36 
 
 		 412 aa  90.9  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000111038  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0148  oxidoreductase molybdopterin binding  28.52 
 
 		 437 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1107  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.71 
 
 		 207 aa  90.5  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.266904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1518  oxidoreductase molybdopterin binding  30.28 
 
 		 440 aa  90.1  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.883795  normal  0.831721 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3098  sulfite oxidase and related enzyme  27.82 
 
 		 451 aa  90.1  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.57715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>