132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3383 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3383  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 		 250 aa  499  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000524951  hitchhiker  0.000566628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24750  protein tyrosine/serine phosphatase  38.43 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0606708  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0735  protein tyrosine/serine phosphatase  37.74 
 
 		 266 aa  129  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0097  protein tyrosine/serine phosphatase  35.23 
 
 		 266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0106  protein tyrosine/serine phosphatase  35.23 
 
 		 266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  35.23 
 
 		 266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3082  protein tyrosine/serine phosphatase  35.63 
 
 		 295 aa  126  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0115  protein tyrosine/serine phosphatase  36.23 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10154  phosphotyrosine protein phosphatase ptpb  33.09 
 
 		 276 aa  122  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4923  protein tyrosine/serine phosphatase  36.59 
 
 		 345 aa  116  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4542  putative tyrosine protein phosphatase  34.38 
 
 		 265 aa  108  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0804  protein tyrosine/serine phosphatase  32.13 
 
 		 275 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal  0.36802 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4857  protein tyrosine/serine phosphatase  32.83 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2040  protein tyrosine/serine phosphatase  33.72 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.376683  hitchhiker  0.00700023 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0646  protein tyrosine/serine phosphatase  29.84 
 
 		 316 aa  102  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2785  protein tyrosine/serine phosphatase  34.82 
 
 		 321 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1239  protein tyrosine/serine phosphatase  32 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.030043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0718  protein tyrosine/serine phosphatase  34.14 
 
 		 269 aa  99.8  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0371  protein tyrosine/serine phosphatase  35.22 
 
 		 299 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1877  protein tyrosine/serine phosphatase  32.53 
 
 		 637 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.880378 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3587  protein tyrosine/serine phosphatase  33.06 
 
 		 316 aa  95.1  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000929077 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1779  protein tyrosine/serine phosphatase  28.52 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3997  protein tyrosine/serine phosphatase  31.37 
 
 		 277 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0144957 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2377  protein tyrosine/serine phosphatase  28.29 
 
 		 636 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188756 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2344  protein tyrosine/serine phosphatase  30.59 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3362  protein tyrosine/serine phosphatase  33.97 
 
 		 265 aa  89.7  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0175  protein tyrosine/serine phosphatase  33.33 
 
 		 255 aa  89  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0719  protein tyrosine/serine phosphatase  29.66 
 
 		 270 aa  87.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2183  Protein tyrosine/serine phosphatase-like protein  30.49 
 
 		 280 aa  86.3  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663845  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14410  protein tyrosine/serine phosphatase  31.47 
 
 		 253 aa  86.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0513449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0543  protein tyrosine/serine phosphatase  28.94 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1241  hypothetical protein  32.52 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0548  protein tyrosine/serine phosphatase  32.69 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0188  protein tyrosine/serine phosphatase  27.6 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3073  protein tyrosine/serine phosphatase  27.27 
 
 		 342 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.810774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6870  protein tyrosine/serine phosphatase  34.36 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3159  protein tyrosine/serine phosphatase  31.82 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0124414 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2661  protein tyrosine/serine phosphatase  30.24 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000022841  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3617  autotransporter beta-domain-containing protein  31.2 
 
 		 671 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1268  protein tyrosine/serine phosphatase  35.16 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.321151 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1131  protein tyrosine/serine phosphatase  32.1 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3931  protein tyrosine/serine phosphatase  27.31 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4351  protein tyrosine/serine phosphatase  26.96 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0673  protein tyrosine/serine phosphatase  28.34 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00206907  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0136  protein tyrosine/serine phosphatase  31.87 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4511  protein tyrosine/serine phosphatase  31.98 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36571  predicted protein  32.52 
 
 		 653 aa  79  0.00000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.136589  normal  0.0275107 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1528  protein tyrosine/serine phosphatase  32.77 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2401  protein tyrosine/serine phosphatase  31.91 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000223295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3041  protein-tyrosine-phosphatase  26.48 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2291  protein tyrosine/serine phosphatase  28.06 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2360  protein tyrosine/serine phosphatase  28.96 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1747  protein tyrosine/serine phosphatase  25.21 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000126573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3369  protein-tyrosine phosphatase-like protein  26.48 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3147  protein-tyrosine phosphatase-like protein  26.48 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.761513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3394  protein-tyrosine phosphatase-like protein  26.48 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3316  protein tyrosine/serine phosphatase  29.43 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.367248  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3371  protein-tyrosine phosphatase-like protein  26.48 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.004022  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4624  protein tyrosine/serine phosphatase  27.38 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.81745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1050  protein tyrosine/serine phosphatase  24.22 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3134  hypothetical protein  42.48 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.93159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2362  protein tyrosine/serine phosphatase  29.03 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3134  protein-tyrosine-phosphatase  26.48 
 
 		 340 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.809037  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0553  protein tyrosine/serine phosphatase  31.71 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371687  normal  0.150838 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1689  protein tyrosine/serine phosphatase  27.34 
 
 		 279 aa  75.1  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0245  protein tyrosine/serine phosphatase  27.73 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3861  protein tyrosine/serine phosphatase  32.71 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3348  protein-tyrosine phosphatase-like protein  26.72 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4624  protein tyrosine/serine phosphatase  30.29 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1882  protein-tyrosine phosphatase-like protein  26.29 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4066  protein tyrosine/serine phosphatase  26.52 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2327  protein tyrosine/serine phosphatase  32.94 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.385338  normal  0.942935 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3550  protein tyrosine/serine phosphatase  27.94 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0890003 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2126  protein tyrosine/serine phosphatase  25.9 
 
 		 339 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0885  protein tyrosine/serine phosphatase  29.72 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772986 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2349  protein tyrosine/serine phosphatase  30.6 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3365  protein-tyrosine phosphatase-like protein  26.29 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.788719  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2208  hypothetical protein  25 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.797475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1919  hypothetical protein  25.33 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3760  protein tyrosine/serine phosphatase  31.28 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.068638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3645  hypothetical protein  24.53 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23060  protein tyrosine/serine phosphatase  27.45 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.463058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4313  protein tyrosine/serine phosphatase  30.04 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1731  protein tyrosine phosphatase  26.19 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3678  protein tyrosine/serine phosphatase  24.08 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3949  protein tyrosine/serine phosphatase  24.07 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0027  protein tyrosine/serine phosphatase  29.03 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4203  protein tyrosine/serine phosphatase  27.41 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537851  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10864  conserved hypothetical protein  26.77 
 
 		 289 aa  68.6  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1781  protein tyrosine/serine phosphatase  31.38 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000745544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2271  protein tyrosine/serine phosphatase  27.76 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0660  protein tyrosine/serine phosphatase  28.21 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107087  hitchhiker  0.00669457 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02130  protein tyrosine/serine phosphatase  26.34 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.393393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4145  protein tyrosine/serine phosphatase  25.64 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377709  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1687  protein tyrosine/serine phosphatase  34.59 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0410  protein tyrosine/serine phosphatase  30.65 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.93291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3890  protein tyrosine/serine phosphatase  28.95 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0332  protein tyrosine/serine phosphatase  28.57 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43096  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0267  hypothetical protein  23.21 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4163  protein tyrosine/serine phosphatase  29.88 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  0.316724 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>