More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1666 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1666  lipid kinase  100 
 
 		 295 aa  577  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.912909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2125  lipid kinase  94.58 
 
 		 295 aa  550  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.382632  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3616  lipid kinase  93.9 
 
 		 295 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1642  lipid kinase  84.88 
 
 		 293 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.142658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3300  lipid kinase  74.92 
 
 		 305 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336089  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3527  hypothetical protein  73.68 
 
 		 305 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105382  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3958  lipid kinase  71.62 
 
 		 317 aa  419  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1562  lipid kinase  64.53 
 
 		 300 aa  378  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.264045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14140  lipid kinase  62.13 
 
 		 314 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2135  lipid kinase  66.44 
 
 		 302 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24970  lipid kinase  65.77 
 
 		 302 aa  363  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04196  lipid kinase  51.66 
 
 		 309 aa  278  5e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3723  lipid kinase  49.84 
 
 		 317 aa  269  4e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2977  lipid kinase  45.73 
 
 		 299 aa  261  8.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1207  lipid kinase  46.08 
 
 		 296 aa  255  6e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1324  lipid kinase  46.08 
 
 		 296 aa  255  6e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3095  lipid kinase  46.08 
 
 		 296 aa  255  6e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00318455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3562  lipid kinase  48.47 
 
 		 305 aa  255  7e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1303  lipid kinase  44.86 
 
 		 299 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2701  lipid kinase  45.92 
 
 		 299 aa  247  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2377  lipid kinase  45.73 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2327  lipid kinase  46.08 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.317751  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1571  diacylglycerol kinase catalytic region  45.39 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2225  lipid kinase  45.39 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1558  lipid kinase  45.39 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.870714 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02015  hypothetical protein  45.39 
 
 		 299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1149  lipid kinase  45.39 
 
 		 299 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.942599  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01980  hypothetical protein  45.39 
 
 		 299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3068  lipid kinase  45.39 
 
 		 299 aa  239  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  hitchhiker  0.00000297552 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0975  lipid kinase  45.39 
 
 		 299 aa  239  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.435416 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2376  lipid kinase  45.73 
 
 		 299 aa  238  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.367743 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2283  lipid kinase  45.73 
 
 		 299 aa  238  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2484  lipid kinase  45.73 
 
 		 299 aa  238  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2372  lipid kinase  45.73 
 
 		 299 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.132584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2507  lipid kinase  43.05 
 
 		 311 aa  206  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.594101  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000301  methylglyoxal synthase  40.14 
 
 		 300 aa  195  7e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.235944  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2079  lipid kinase  41.42 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2152  lipid kinase  37.5 
 
 		 309 aa  193  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.052393  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3345  lipid kinase  39.8 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.056852 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  33.57 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  35.1 
 
 		 364 aa  129  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1713  hypothetical protein  34.87 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0604892  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0352  putative lipid kinase  28.67 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0300  putative lipid kinase  28.67 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0396  putative lipid kinase  28.67 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0294  putative lipid kinase  28.67 
 
 		 301 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0303  putative lipid kinase  29.02 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1632  diacylglycerol kinase, catalytic region  34.78 
 
 		 367 aa  122  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4951  putative lipid kinase  28.67 
 
 		 301 aa  122  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0369  putative lipid kinase  28.67 
 
 		 301 aa  122  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0308  putative lipid kinase  28.67 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0291  putative lipid kinase  28.67 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0355  putative lipid kinase  28.67 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0323  putative lipid kinase  28.67 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1140  diacylglycerol kinase catalytic region  33.33 
 
 		 303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0335  putative lipid kinase  26.89 
 
 		 308 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000603525  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0172  diacylglycerol kinase catalytic region  28.83 
 
 		 297 aa  112  9e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1510  putative lipid kinase  28.42 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1436  putative lipid kinase  26.92 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1224  putative lipid kinase  26.89 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1986  putative lipid kinase  26.54 
 
 		 315 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.520999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1952  putative lipid kinase  26.54 
 
 		 315 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.669604  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0050  diacylglycerol kinase catalytic region  28.03 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0775  diacylglycerol kinase catalytic region  30.24 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1512  putative lipid kinase  27.21 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4941  putative lipid kinase  28.97 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454886  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1672  putative lipid kinase  28.62 
 
 		 308 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2178  diacylglycerol kinase, catalytic region  30 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1023  putative lipid kinase  30.04 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2179  putative lipid kinase  30.89 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0510  hypothetical protein  31.32 
 
 		 303 aa  97.4  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3759  putative lipid kinase  31.05 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0851  putative lipid kinase  26.78 
 
 		 339 aa  96.7  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1846  putative lipid kinase  27.24 
 
 		 309 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1943  putative lipid kinase  31.78 
 
 		 313 aa  97.1  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282737  normal  0.0158542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1567  putative lipid kinase  27.24 
 
 		 309 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01350  conserved protein of unknown function BmrU  30.58 
 
 		 323 aa  95.9  8e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.956318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1328  putative lipid kinase  27.2 
 
 		 298 aa  95.5  9e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0123469  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1535  putative lipid kinase  27.2 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0290428  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1439  putative lipid kinase  25.85 
 
 		 337 aa  95.1  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0128  diacylglycerol kinase catalytic region  31.13 
 
 		 314 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2552  putative lipid kinase  29.43 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4943  bmrU protein  27.62 
 
 		 300 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0473  putative lipid kinase  26.96 
 
 		 342 aa  94  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3421  diacylglycerol kinase catalytic region  25.09 
 
 		 311 aa  93.6  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.561701  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3480  diacylglycerol kinase catalytic region  27.5 
 
 		 301 aa  93.2  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4959  bmrU protein  27.08 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4570  diacylglycerol kinase  27.08 
 
 		 300 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0296  bmrU protein  27.08 
 
 		 300 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2074  putative lipid kinase  32.07 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4652  diacylglycerol kinase catalytic region  27.5 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1562  diacylglycerol kinase catalytic region  30.33 
 
 		 297 aa  93.2  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0967  hypothetical protein  34.76 
 
 		 321 aa  92.8  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.273578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4976  bmrU protein  27.08 
 
 		 300 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3254  diacylglycerol kinase catalytic region  29.96 
 
 		 300 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4938  bmrU protein  27.08 
 
 		 300 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4713  bmrU protein  27.08 
 
 		 300 aa  92.4  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4552  diacylglycerol kinase  27.08 
 
 		 300 aa  92.4  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4772  putative lipid kinase  27.82 
 
 		 323 aa  92.4  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5075  diacylglycerol kinase family protein  27.08 
 
 		 300 aa  92.4  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>