More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2152 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2152  lipid kinase  100 
 
 		 309 aa  637    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.052393  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000301  methylglyoxal synthase  53.04 
 
 		 300 aa  347  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.235944  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2079  lipid kinase  47.74 
 
 		 313 aa  277  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3345  lipid kinase  47.64 
 
 		 307 aa  260  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.056852 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1207  lipid kinase  42.47 
 
 		 296 aa  228  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3095  lipid kinase  42.47 
 
 		 296 aa  228  7e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00318455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1324  lipid kinase  42.47 
 
 		 296 aa  228  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2507  lipid kinase  39.93 
 
 		 311 aa  223  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.594101  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1149  lipid kinase  41.16 
 
 		 299 aa  219  5e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.942599  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3562  lipid kinase  42.86 
 
 		 305 aa  218  8.999999999999998e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3068  lipid kinase  40.82 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  hitchhiker  0.00000297552 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0975  lipid kinase  40.82 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.435416 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02015  hypothetical protein  40.82 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2377  lipid kinase  40.82 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01980  hypothetical protein  40.82 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1571  diacylglycerol kinase catalytic region  40.82 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1558  lipid kinase  40.82 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2225  lipid kinase  40.82 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2701  lipid kinase  40.82 
 
 		 299 aa  215  8e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2977  lipid kinase  40.48 
 
 		 299 aa  215  9e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1642  lipid kinase  40.96 
 
 		 293 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.142658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1303  lipid kinase  40.14 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2283  lipid kinase  40.48 
 
 		 299 aa  208  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2376  lipid kinase  40.48 
 
 		 299 aa  208  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.367743 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2372  lipid kinase  40.48 
 
 		 299 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.132584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2484  lipid kinase  40.14 
 
 		 299 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2327  lipid kinase  40.14 
 
 		 299 aa  205  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.317751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04196  lipid kinase  36.69 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3723  lipid kinase  36.93 
 
 		 317 aa  199  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1562  lipid kinase  36.61 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.264045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24970  lipid kinase  37.25 
 
 		 302 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1666  lipid kinase  37.5 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.912909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2125  lipid kinase  37.84 
 
 		 295 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.382632  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14140  lipid kinase  35.67 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2135  lipid kinase  37.46 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3616  lipid kinase  37.16 
 
 		 295 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3527  hypothetical protein  36.95 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105382  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3300  lipid kinase  36.61 
 
 		 305 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3958  lipid kinase  36.07 
 
 		 317 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0300  putative lipid kinase  30.3 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0294  putative lipid kinase  29.97 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0303  putative lipid kinase  34.6 
 
 		 301 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0308  putative lipid kinase  34.6 
 
 		 301 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0291  putative lipid kinase  34.6 
 
 		 301 aa  133  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0323  putative lipid kinase  34.6 
 
 		 301 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0355  putative lipid kinase  34.6 
 
 		 301 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0396  putative lipid kinase  29.63 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0352  putative lipid kinase  29.63 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4951  putative lipid kinase  29.63 
 
 		 301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0369  putative lipid kinase  29.63 
 
 		 301 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3848  diacylglycerol kinase catalytic region  31.25 
 
 		 291 aa  123  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000041794  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  30.54 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0335  putative lipid kinase  30.08 
 
 		 308 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000603525  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1224  putative lipid kinase  28.42 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1952  putative lipid kinase  28.68 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.669604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1986  putative lipid kinase  28.68 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.520999  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1632  diacylglycerol kinase, catalytic region  29.19 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1023  putative lipid kinase  29.28 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2179  putative lipid kinase  29.96 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3759  putative lipid kinase  29.28 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0050  diacylglycerol kinase catalytic region  28.9 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1713  hypothetical protein  27.14 
 
 		 312 aa  105  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0604892  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1436  putative lipid kinase  26.01 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1672  putative lipid kinase  28.17 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2392  diacylglycerol kinase catalytic region  24.74 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  27.84 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1486  putative lipid kinase  28.96 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1811  diacylglycerol kinase catalytic region  30.3 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3476  putative lipid kinase  31.36 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1846  putative lipid kinase  27.68 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1567  putative lipid kinase  27.68 
 
 		 309 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1439  putative lipid kinase  28.51 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1328  putative lipid kinase  26.71 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0123469  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1510  putative lipid kinase  29.96 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1512  putative lipid kinase  31.28 
 
 		 337 aa  97.8  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1535  putative lipid kinase  26.37 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0290428  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5358  putative lipid kinase  28.74 
 
 		 317 aa  96.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593577  hitchhiker  0.00311469 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0081  putative lipid kinase  26.21 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3421  diacylglycerol kinase catalytic region  27.78 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.561701  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1607  diacylglycerol kinase catalytic region  26.67 
 
 		 302 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1582  diacylglycerol kinase catalytic region  26.67 
 
 		 302 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1562  diacylglycerol kinase catalytic region  27.7 
 
 		 297 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0967  hypothetical protein  30.84 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.273578  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2227  diacylglycerol kinase catalytic region  29.3 
 
 		 312 aa  93.6  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2682  diacylglycerol kinase catalytic region  27.02 
 
 		 287 aa  93.6  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3700  diacylglycerol kinase catalytic region  27.27 
 
 		 304 aa  92.8  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4941  putative lipid kinase  28.06 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454886  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0851  putative lipid kinase  32.89 
 
 		 339 aa  90.9  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0252  putative lipid kinase  26.35 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3254  diacylglycerol kinase catalytic region  28.63 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3480  diacylglycerol kinase catalytic region  25.76 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2518  diacylglycerol kinase, catalytic region  26.33 
 
 		 304 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2943  putative lipid kinase  26.36 
 
 		 319 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4111  putative lipid kinase  27.12 
 
 		 317 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.135746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2791  putative lipid kinase  27.94 
 
 		 326 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0686435  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0172  diacylglycerol kinase catalytic region  28.5 
 
 		 297 aa  89  8e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0717  diacylglycerol kinase catalytic region  29.25 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.478099  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2760  diacylglycerol kinase catalytic region  25.96 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0246521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3168  putative lipid kinase  29.61 
 
 		 292 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1140  diacylglycerol kinase catalytic region  26.97 
 
 		 303 aa  87  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>