More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1562 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1562  lipid kinase  100 
 
 		 300 aa  591  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.264045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14140  lipid kinase  71.67 
 
 		 314 aa  413  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3300  lipid kinase  66.56 
 
 		 305 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3958  lipid kinase  65.2 
 
 		 317 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3527  hypothetical protein  64.98 
 
 		 305 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105382  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1666  lipid kinase  64.53 
 
 		 295 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.912909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2125  lipid kinase  63 
 
 		 295 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.382632  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3616  lipid kinase  62.67 
 
 		 295 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1642  lipid kinase  63.51 
 
 		 293 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.142658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24970  lipid kinase  64.19 
 
 		 302 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2135  lipid kinase  64.19 
 
 		 302 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04196  lipid kinase  52.49 
 
 		 309 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3723  lipid kinase  49.83 
 
 		 317 aa  264  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1324  lipid kinase  46.1 
 
 		 296 aa  248  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3095  lipid kinase  46.1 
 
 		 296 aa  248  7e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00318455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1207  lipid kinase  46.1 
 
 		 296 aa  248  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3562  lipid kinase  46.62 
 
 		 305 aa  246  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2977  lipid kinase  44.22 
 
 		 299 aa  239  4e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1303  lipid kinase  42.52 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2701  lipid kinase  44.44 
 
 		 299 aa  226  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2484  lipid kinase  43.05 
 
 		 299 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2283  lipid kinase  43.05 
 
 		 299 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2376  lipid kinase  43.05 
 
 		 299 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.367743 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2372  lipid kinase  43.05 
 
 		 299 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.132584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2327  lipid kinase  43.05 
 
 		 299 aa  221  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.317751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2377  lipid kinase  42.37 
 
 		 299 aa  220  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02015  hypothetical protein  42.37 
 
 		 299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01980  hypothetical protein  42.37 
 
 		 299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1149  lipid kinase  42.37 
 
 		 299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.942599  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0975  lipid kinase  42.37 
 
 		 299 aa  219  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.435416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3068  lipid kinase  42.37 
 
 		 299 aa  219  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  hitchhiker  0.00000297552 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1571  diacylglycerol kinase catalytic region  42.03 
 
 		 299 aa  218  7e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1558  lipid kinase  42.03 
 
 		 299 aa  218  7e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2225  lipid kinase  42.03 
 
 		 299 aa  218  7e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2152  lipid kinase  36.61 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.052393  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000301  methylglyoxal synthase  38.57 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.235944  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2507  lipid kinase  41.2 
 
 		 311 aa  188  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.594101  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2079  lipid kinase  37.42 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3345  lipid kinase  39.19 
 
 		 307 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.056852 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  34.15 
 
 		 325 aa  143  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1713  hypothetical protein  36.63 
 
 		 312 aa  123  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0604892  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  33.33 
 
 		 364 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0300  putative lipid kinase  27.74 
 
 		 301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0303  putative lipid kinase  27.74 
 
 		 301 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0294  putative lipid kinase  27.4 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1986  putative lipid kinase  30.8 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.520999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1952  putative lipid kinase  30.8 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.669604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0352  putative lipid kinase  27.4 
 
 		 301 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0396  putative lipid kinase  27.4 
 
 		 301 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0308  putative lipid kinase  27.4 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0291  putative lipid kinase  27.4 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0323  putative lipid kinase  27.4 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4951  putative lipid kinase  27.4 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0369  putative lipid kinase  27.4 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0355  putative lipid kinase  27.4 
 
 		 301 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0335  putative lipid kinase  27.74 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000603525  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1632  diacylglycerol kinase, catalytic region  31.65 
 
 		 367 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1436  putative lipid kinase  29.71 
 
 		 316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1023  putative lipid kinase  32.2 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1562  diacylglycerol kinase catalytic region  32.46 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0128  diacylglycerol kinase catalytic region  33.46 
 
 		 314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0172  diacylglycerol kinase catalytic region  28.05 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1224  putative lipid kinase  27.37 
 
 		 307 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2552  putative lipid kinase  30.03 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4941  putative lipid kinase  27.93 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454886  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3848  diacylglycerol kinase catalytic region  32.38 
 
 		 291 aa  105  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000041794  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1672  putative lipid kinase  31.43 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01350  conserved protein of unknown function BmrU  29.67 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.956318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0050  diacylglycerol kinase catalytic region  29 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3476  putative lipid kinase  30.29 
 
 		 300 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0081  putative lipid kinase  27.39 
 
 		 310 aa  102  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2178  diacylglycerol kinase, catalytic region  30.83 
 
 		 297 aa  102  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3759  putative lipid kinase  32.78 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0473  putative lipid kinase  28.1 
 
 		 342 aa  102  7e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1140  diacylglycerol kinase catalytic region  30.97 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2227  diacylglycerol kinase catalytic region  33.33 
 
 		 312 aa  99.8  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4111  putative lipid kinase  34.66 
 
 		 317 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.135746 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1846  putative lipid kinase  31.06 
 
 		 309 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0717  diacylglycerol kinase catalytic region  27.8 
 
 		 314 aa  99.8  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.478099  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0775  diacylglycerol kinase catalytic region  30.82 
 
 		 316 aa  99.8  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1607  diacylglycerol kinase catalytic region  31.12 
 
 		 302 aa  99  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1582  diacylglycerol kinase catalytic region  31.12 
 
 		 302 aa  99  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1567  putative lipid kinase  31.06 
 
 		 309 aa  99  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1510  putative lipid kinase  28.32 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0472  diacylglycerol kinase catalytic region  27.87 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2074  putative lipid kinase  30.51 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0252  putative lipid kinase  27.61 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4938  bmrU protein  27.86 
 
 		 300 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1512  putative lipid kinase  27.05 
 
 		 337 aa  96.3  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4943  bmrU protein  27.48 
 
 		 300 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0296  bmrU protein  27.48 
 
 		 300 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1610  diacylglycerol kinase catalytic region  26.87 
 
 		 287 aa  95.5  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4713  bmrU protein  27.48 
 
 		 300 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4552  diacylglycerol kinase  27.48 
 
 		 300 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5075  diacylglycerol kinase family protein  27.48 
 
 		 300 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2682  diacylglycerol kinase catalytic region  30.27 
 
 		 287 aa  94  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1811  diacylglycerol kinase catalytic region  29.61 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4976  bmrU protein  27.1 
 
 		 300 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4959  bmrU protein  27.1 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4570  diacylglycerol kinase  27.1 
 
 		 300 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>