More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000301 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000301  methylglyoxal synthase  100 
 
 
300 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.235944  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2152  lipid kinase  53.04 
 
 
309 aa  347  2e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.052393  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3345  lipid kinase  54.21 
 
 
307 aa  301  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.056852 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2079  lipid kinase  48.53 
 
 
313 aa  296  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2507  lipid kinase  43.49 
 
 
311 aa  245  6e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.594101  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2701  lipid kinase  44.03 
 
 
299 aa  242  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3095  lipid kinase  42.47 
 
 
296 aa  236  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00318455  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1207  lipid kinase  42.47 
 
 
296 aa  236  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1324  lipid kinase  42.47 
 
 
296 aa  236  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2977  lipid kinase  43.15 
 
 
299 aa  233  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2372  lipid kinase  41.16 
 
 
299 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.132584  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2283  lipid kinase  41.16 
 
 
299 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2376  lipid kinase  41.16 
 
 
299 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.367743 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2484  lipid kinase  41.16 
 
 
299 aa  228  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1149  lipid kinase  40.96 
 
 
299 aa  228  7e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.942599  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02015  hypothetical protein  40.96 
 
 
299 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0975  lipid kinase  40.96 
 
 
299 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.435416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3068  lipid kinase  40.96 
 
 
299 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  hitchhiker  0.00000297552 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01980  hypothetical protein  40.96 
 
 
299 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2327  lipid kinase  40.82 
 
 
299 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.317751  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2225  lipid kinase  40.61 
 
 
299 aa  226  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1558  lipid kinase  40.61 
 
 
299 aa  226  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1303  lipid kinase  41.44 
 
 
299 aa  226  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1571  diacylglycerol kinase catalytic region  40.61 
 
 
299 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2377  lipid kinase  40.61 
 
 
299 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3723  lipid kinase  41 
 
 
317 aa  224  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3562  lipid kinase  43.15 
 
 
305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04196  lipid kinase  41.06 
 
 
309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14140  lipid kinase  39.8 
 
 
314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1642  lipid kinase  39.38 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.142658  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1666  lipid kinase  40.14 
 
 
295 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.912909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2125  lipid kinase  38.83 
 
 
295 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.382632  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3616  lipid kinase  39.04 
 
 
295 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1562  lipid kinase  38.57 
 
 
300 aa  190  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.264045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3300  lipid kinase  38.51 
 
 
305 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336089  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2135  lipid kinase  38.49 
 
 
302 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24970  lipid kinase  37.79 
 
 
302 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3527  hypothetical protein  37.58 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105382  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3958  lipid kinase  35.84 
 
 
317 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0300  putative lipid kinase  33.44 
 
 
301 aa  153  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0352  putative lipid kinase  33.44 
 
 
301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0308  putative lipid kinase  33.44 
 
 
301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0291  putative lipid kinase  33.44 
 
 
301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0294  putative lipid kinase  33.44 
 
 
301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0323  putative lipid kinase  33.44 
 
 
301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0355  putative lipid kinase  33.44 
 
 
301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0396  putative lipid kinase  33.44 
 
 
301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0369  putative lipid kinase  33.44 
 
 
301 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4951  putative lipid kinase  33.44 
 
 
301 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0303  putative lipid kinase  33.11 
 
 
301 aa  149  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0335  putative lipid kinase  32.62 
 
 
308 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000603525  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1952  putative lipid kinase  32.67 
 
 
315 aa  142  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.669604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1986  putative lipid kinase  32.67 
 
 
315 aa  142  7e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.520999  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1224  putative lipid kinase  31.27 
 
 
307 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2392  diacylglycerol kinase catalytic region  29.93 
 
 
293 aa  132  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1436  putative lipid kinase  30.36 
 
 
316 aa  132  6e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  29.02 
 
 
325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  28.81 
 
 
364 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1713  hypothetical protein  29.45 
 
 
312 aa  119  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0604892  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1632  diacylglycerol kinase, catalytic region  28.86 
 
 
367 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1510  putative lipid kinase  29.72 
 
 
302 aa  112  7.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0172  diacylglycerol kinase catalytic region  29.96 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2518  diacylglycerol kinase, catalytic region  29.24 
 
 
304 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3421  diacylglycerol kinase catalytic region  29.63 
 
 
311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.561701  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1535  putative lipid kinase  30.55 
 
 
298 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0290428  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3700  diacylglycerol kinase catalytic region  28.92 
 
 
304 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128182 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3848  diacylglycerol kinase catalytic region  26.95 
 
 
291 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000041794  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1328  putative lipid kinase  30.18 
 
 
298 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0123469  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0050  diacylglycerol kinase catalytic region  28 
 
 
303 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5358  putative lipid kinase  27.09 
 
 
317 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593577  hitchhiker  0.00311469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1562  diacylglycerol kinase catalytic region  28.57 
 
 
297 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4093  diacylglycerol kinase catalytic region  26.42 
 
 
296 aa  106  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1512  putative lipid kinase  31.6 
 
 
337 aa  106  4e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2179  putative lipid kinase  26.96 
 
 
304 aa  106  6e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1582  diacylglycerol kinase catalytic region  24.75 
 
 
302 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1607  diacylglycerol kinase catalytic region  24.75 
 
 
302 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0715  diacylglycerol kinase catalytic region  29.13 
 
 
336 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0081  putative lipid kinase  24.91 
 
 
310 aa  103  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1811  diacylglycerol kinase catalytic region  31.56 
 
 
287 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3480  diacylglycerol kinase catalytic region  28.41 
 
 
301 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2760  diacylglycerol kinase catalytic region  29.61 
 
 
304 aa  102  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0246521  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2791  putative lipid kinase  27.8 
 
 
326 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0686435  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1439  putative lipid kinase  30.57 
 
 
337 aa  101  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1672  putative lipid kinase  27.85 
 
 
308 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4652  diacylglycerol kinase catalytic region  28.98 
 
 
300 aa  98.6  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3759  putative lipid kinase  24.57 
 
 
299 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0473  putative lipid kinase  29.02 
 
 
342 aa  98.2  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3476  putative lipid kinase  30.07 
 
 
300 aa  98.2  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2227  diacylglycerol kinase catalytic region  28.4 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2943  putative lipid kinase  27.27 
 
 
319 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0128  diacylglycerol kinase catalytic region  30.94 
 
 
314 aa  97.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0252  putative lipid kinase  30.31 
 
 
293 aa  96.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2682  diacylglycerol kinase catalytic region  29.72 
 
 
287 aa  96.7  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2400  diacylglycerol kinase, catalytic region  28.42 
 
 
290 aa  96.3  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0851  putative lipid kinase  33.48 
 
 
339 aa  96.3  6e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1610  diacylglycerol kinase catalytic region  27.31 
 
 
287 aa  95.9  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1023  putative lipid kinase  25 
 
 
291 aa  95.9  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1140  diacylglycerol kinase catalytic region  30.98 
 
 
303 aa  95.9  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1486  putative lipid kinase  27.62 
 
 
302 aa  95.9  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4713  bmrU protein  28.98 
 
 
300 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>