More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3345 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3345  lipid kinase  100 
 
 		 307 aa  626  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.056852 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000301  methylglyoxal synthase  54.21 
 
 		 300 aa  317  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.235944  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2079  lipid kinase  48.71 
 
 		 313 aa  286  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2152  lipid kinase  47.64 
 
 		 309 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.052393  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2507  lipid kinase  43.34 
 
 		 311 aa  225  7e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.594101  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2701  lipid kinase  43.1 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1207  lipid kinase  41.2 
 
 		 296 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1324  lipid kinase  41.2 
 
 		 296 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3095  lipid kinase  41.2 
 
 		 296 aa  202  6e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00318455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04196  lipid kinase  40.07 
 
 		 309 aa  198  7.999999999999999e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3723  lipid kinase  39.2 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2372  lipid kinase  40.74 
 
 		 299 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.132584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2977  lipid kinase  41.2 
 
 		 299 aa  196  5.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2376  lipid kinase  40.74 
 
 		 299 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.367743 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2283  lipid kinase  40.74 
 
 		 299 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2327  lipid kinase  40.74 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.317751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2484  lipid kinase  40.4 
 
 		 299 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3562  lipid kinase  43.19 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1149  lipid kinase  39.8 
 
 		 299 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.942599  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0975  lipid kinase  39.8 
 
 		 299 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.435416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3068  lipid kinase  39.8 
 
 		 299 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  hitchhiker  0.00000297552 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02015  hypothetical protein  39.8 
 
 		 299 aa  189  7e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01980  hypothetical protein  39.8 
 
 		 299 aa  189  7e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2377  lipid kinase  39.8 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3300  lipid kinase  40.73 
 
 		 305 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336089  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1571  diacylglycerol kinase catalytic region  39.46 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1558  lipid kinase  39.46 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2225  lipid kinase  39.46 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3527  hypothetical protein  40.8 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105382  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1303  lipid kinase  40.2 
 
 		 299 aa  186  6e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2125  lipid kinase  40.47 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.382632  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3958  lipid kinase  39.16 
 
 		 317 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1666  lipid kinase  40.46 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.912909 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3616  lipid kinase  40.13 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1642  lipid kinase  40.8 
 
 		 293 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.142658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24970  lipid kinase  39.19 
 
 		 302 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14140  lipid kinase  39.33 
 
 		 314 aa  176  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1562  lipid kinase  39.53 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.264045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2135  lipid kinase  38.46 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0294  putative lipid kinase  33.78 
 
 		 301 aa  149  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0352  putative lipid kinase  33.78 
 
 		 301 aa  149  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0396  putative lipid kinase  33.78 
 
 		 301 aa  149  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0308  putative lipid kinase  33.78 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0291  putative lipid kinase  33.78 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4951  putative lipid kinase  33.78 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0323  putative lipid kinase  33.78 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0369  putative lipid kinase  33.78 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0355  putative lipid kinase  33.78 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0303  putative lipid kinase  33.78 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0300  putative lipid kinase  33.56 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1713  hypothetical protein  32.78 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0604892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0335  putative lipid kinase  31.41 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000603525  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1224  putative lipid kinase  31.41 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  30.1 
 
 		 325 aa  123  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1986  putative lipid kinase  30.07 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.520999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1952  putative lipid kinase  30.07 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.669604  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2392  diacylglycerol kinase catalytic region  27.59 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1811  diacylglycerol kinase catalytic region  34.19 
 
 		 287 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3700  diacylglycerol kinase catalytic region  31.37 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128182 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0128  diacylglycerol kinase catalytic region  32.55 
 
 		 314 aa  115  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1436  putative lipid kinase  28.62 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  29.83 
 
 		 364 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0081  putative lipid kinase  29.6 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0050  diacylglycerol kinase catalytic region  28.68 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1610  diacylglycerol kinase catalytic region  29.47 
 
 		 287 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0967  hypothetical protein  32.41 
 
 		 321 aa  105  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.273578  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3421  diacylglycerol kinase catalytic region  29.2 
 
 		 311 aa  104  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.561701  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1439  putative lipid kinase  28.28 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2518  diacylglycerol kinase, catalytic region  28.79 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2943  putative lipid kinase  29.92 
 
 		 319 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1607  diacylglycerol kinase catalytic region  28.22 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3759  putative lipid kinase  29.25 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1582  diacylglycerol kinase catalytic region  28.22 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1632  diacylglycerol kinase, catalytic region  27.8 
 
 		 367 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5358  putative lipid kinase  28.67 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593577  hitchhiker  0.00311469 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2891  diacylglycerol kinase catalytic region  31.05 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0715  diacylglycerol kinase catalytic region  27.76 
 
 		 336 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1328  putative lipid kinase  30.94 
 
 		 298 aa  99.4  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0123469  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2791  putative lipid kinase  30.49 
 
 		 326 aa  99.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0686435  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1535  putative lipid kinase  31.48 
 
 		 298 aa  99  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0290428  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1023  putative lipid kinase  30.33 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3848  diacylglycerol kinase catalytic region  30.38 
 
 		 291 aa  99  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000041794  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0413  sphingosine kinase and DAGKc-like kinase  30.99 
 
 		 296 aa  98.2  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417163  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2179  putative lipid kinase  29.33 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2227  diacylglycerol kinase catalytic region  29.88 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4093  diacylglycerol kinase catalytic region  27.53 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0252  putative lipid kinase  29.92 
 
 		 293 aa  97.4  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2760  diacylglycerol kinase catalytic region  28.36 
 
 		 304 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0246521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1672  putative lipid kinase  26.46 
 
 		 308 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0172  diacylglycerol kinase catalytic region  27.57 
 
 		 297 aa  95.9  7e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1943  putative lipid kinase  33.2 
 
 		 313 aa  95.9  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282737  normal  0.0158542 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1510  putative lipid kinase  28.94 
 
 		 302 aa  95.5  9e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1512  putative lipid kinase  30.25 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0227  putative lipid kinase  30.43 
 
 		 328 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535184 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1578  putative lipid kinase  31.47 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1140  diacylglycerol kinase catalytic region  30.3 
 
 		 303 aa  93.6  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4941  putative lipid kinase  28.85 
 
 		 305 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454886  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2141  diacylglycerol kinase catalytic region  27.34 
 
 		 311 aa  93.2  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241813  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0390  bmrU protein  24.24 
 
 		 307 aa  92.8  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2074  putative lipid kinase  30.04 
 
 		 298 aa  92.8  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>