More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3562 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3562  lipid kinase  100 
 
 
305 aa  617  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1207  lipid kinase  77.05 
 
 
296 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3095  lipid kinase  77.05 
 
 
296 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00318455  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1324  lipid kinase  77.05 
 
 
296 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1303  lipid kinase  68.38 
 
 
299 aa  421  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2977  lipid kinase  67.7 
 
 
299 aa  418  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2701  lipid kinase  69.18 
 
 
299 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2377  lipid kinase  68.49 
 
 
299 aa  414  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3068  lipid kinase  68.49 
 
 
299 aa  414  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  hitchhiker  0.00000297552 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0975  lipid kinase  68.49 
 
 
299 aa  414  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.435416 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02015  hypothetical protein  68.15 
 
 
299 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1149  lipid kinase  68.15 
 
 
299 aa  413  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.942599  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01980  hypothetical protein  68.15 
 
 
299 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1558  lipid kinase  67.81 
 
 
299 aa  410  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2225  lipid kinase  67.81 
 
 
299 aa  410  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1571  diacylglycerol kinase catalytic region  67.47 
 
 
299 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2283  lipid kinase  67.47 
 
 
299 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2327  lipid kinase  67.47 
 
 
299 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.317751  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2376  lipid kinase  67.47 
 
 
299 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.367743 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2484  lipid kinase  67.47 
 
 
299 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2372  lipid kinase  67.12 
 
 
299 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.132584  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1642  lipid kinase  49.66 
 
 
293 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.142658  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04196  lipid kinase  46.25 
 
 
309 aa  259  4e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1666  lipid kinase  49.49 
 
 
295 aa  258  6e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.912909 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14140  lipid kinase  47.49 
 
 
314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2125  lipid kinase  47.6 
 
 
295 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.382632  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3958  lipid kinase  47.99 
 
 
317 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1562  lipid kinase  46.96 
 
 
300 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.264045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3616  lipid kinase  47.26 
 
 
295 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3723  lipid kinase  46.49 
 
 
317 aa  249  4e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3527  hypothetical protein  48.66 
 
 
305 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105382  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3300  lipid kinase  48.99 
 
 
305 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336089  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24970  lipid kinase  50.17 
 
 
302 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2135  lipid kinase  50 
 
 
302 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000301  methylglyoxal synthase  43.15 
 
 
300 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.235944  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2152  lipid kinase  42.86 
 
 
309 aa  224  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.052393  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2507  lipid kinase  42.91 
 
 
311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.594101  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2079  lipid kinase  43.87 
 
 
313 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3345  lipid kinase  43.19 
 
 
307 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.056852 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0335  putative lipid kinase  36.13 
 
 
308 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000603525  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0294  putative lipid kinase  32.61 
 
 
301 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0352  putative lipid kinase  32.61 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0303  putative lipid kinase  32.61 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0300  putative lipid kinase  32.61 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0396  putative lipid kinase  32.61 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1436  putative lipid kinase  33.73 
 
 
316 aa  134  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0308  putative lipid kinase  32.61 
 
 
301 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0291  putative lipid kinase  32.61 
 
 
301 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0323  putative lipid kinase  32.61 
 
 
301 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0355  putative lipid kinase  32.61 
 
 
301 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4951  putative lipid kinase  32.61 
 
 
301 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0369  putative lipid kinase  32.61 
 
 
301 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1952  putative lipid kinase  32.95 
 
 
315 aa  132  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.669604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1986  putative lipid kinase  32.95 
 
 
315 aa  132  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.520999  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1224  putative lipid kinase  34.47 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0473  putative lipid kinase  33.74 
 
 
342 aa  116  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0851  putative lipid kinase  32.39 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3480  diacylglycerol kinase catalytic region  30.63 
 
 
301 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1512  putative lipid kinase  31.06 
 
 
337 aa  113  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4652  diacylglycerol kinase catalytic region  29.59 
 
 
300 aa  110  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4938  bmrU protein  29.93 
 
 
300 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4976  bmrU protein  30.04 
 
 
300 aa  109  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4943  bmrU protein  29.58 
 
 
300 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0296  bmrU protein  29.58 
 
 
300 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4959  bmrU protein  29.68 
 
 
300 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4713  bmrU protein  29.68 
 
 
300 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4552  diacylglycerol kinase  29.68 
 
 
300 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5075  diacylglycerol kinase family protein  29.68 
 
 
300 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4570  diacylglycerol kinase  29.33 
 
 
300 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2392  diacylglycerol kinase catalytic region  34.32 
 
 
293 aa  105  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1439  putative lipid kinase  30.43 
 
 
337 aa  103  4e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0128  diacylglycerol kinase catalytic region  31.64 
 
 
314 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1578  putative lipid kinase  29.52 
 
 
328 aa  100  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1610  diacylglycerol kinase catalytic region  31.9 
 
 
287 aa  100  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3759  putative lipid kinase  32.35 
 
 
299 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  31.58 
 
 
364 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0775  diacylglycerol kinase catalytic region  30.74 
 
 
316 aa  97.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1140  diacylglycerol kinase catalytic region  31.5 
 
 
303 aa  97.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1023  putative lipid kinase  30.74 
 
 
291 aa  97.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1510  putative lipid kinase  31.75 
 
 
302 aa  97.4  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1713  hypothetical protein  29.39 
 
 
312 aa  96.3  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0604892  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1632  diacylglycerol kinase, catalytic region  28.52 
 
 
367 aa  95.9  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3848  diacylglycerol kinase catalytic region  32.8 
 
 
291 aa  95.5  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000041794  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3254  diacylglycerol kinase catalytic region  33.2 
 
 
300 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0050  diacylglycerol kinase catalytic region  26.53 
 
 
303 aa  95.5  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2791  putative lipid kinase  28.86 
 
 
326 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0686435  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2179  putative lipid kinase  30.99 
 
 
304 aa  94.4  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3476  putative lipid kinase  29.07 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  28.52 
 
 
325 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3168  putative lipid kinase  32.17 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1675  putative lipid kinase  26.3 
 
 
345 aa  93.6  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0601  diacylglycerol kinase catalytic region  29.19 
 
 
309 aa  93.6  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.902429  normal  0.638771 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1672  putative lipid kinase  30.03 
 
 
308 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4941  putative lipid kinase  33.33 
 
 
305 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454886  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0172  diacylglycerol kinase catalytic region  25.77 
 
 
297 aa  92.4  9e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2178  diacylglycerol kinase, catalytic region  31.2 
 
 
297 aa  92.4  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0418  diacylglycerol kinase catalytic region  27.81 
 
 
318 aa  92  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3421  diacylglycerol kinase catalytic region  27.9 
 
 
311 aa  91.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.561701  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0081  putative lipid kinase  27.76 
 
 
310 aa  90.1  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0510  hypothetical protein  30.48 
 
 
303 aa  90.1  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>