More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3168 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_3168  putative lipid kinase  100 
 
 
292 aa  588  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3476  putative lipid kinase  47.77 
 
 
300 aa  289  4e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1535  putative lipid kinase  38.83 
 
 
298 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0290428  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1328  putative lipid kinase  39.38 
 
 
298 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0123469  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3693  diacylglycerol kinase catalytic region  38.26 
 
 
299 aa  169  7e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0369  putative lipid kinase  32.42 
 
 
301 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4951  putative lipid kinase  32.42 
 
 
301 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0294  putative lipid kinase  31.85 
 
 
301 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0300  putative lipid kinase  32.42 
 
 
301 aa  163  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0352  putative lipid kinase  31.51 
 
 
301 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0308  putative lipid kinase  32.42 
 
 
301 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0291  putative lipid kinase  32.42 
 
 
301 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0323  putative lipid kinase  32.42 
 
 
301 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0355  putative lipid kinase  32.42 
 
 
301 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0396  putative lipid kinase  31.51 
 
 
301 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0335  putative lipid kinase  31.88 
 
 
308 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000603525  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0303  putative lipid kinase  32.08 
 
 
301 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3421  diacylglycerol kinase catalytic region  34.89 
 
 
311 aa  155  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.561701  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1224  putative lipid kinase  31.65 
 
 
307 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1436  putative lipid kinase  31.03 
 
 
316 aa  149  5e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1986  putative lipid kinase  30.74 
 
 
315 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.520999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1952  putative lipid kinase  30.74 
 
 
315 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.669604  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2392  diacylglycerol kinase catalytic region  28.57 
 
 
293 aa  143  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0473  putative lipid kinase  30.9 
 
 
342 aa  139  7e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0430  diacylglycerol kinase catalytic region  33.45 
 
 
298 aa  136  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1512  putative lipid kinase  29.05 
 
 
337 aa  132  6e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0851  putative lipid kinase  29.53 
 
 
339 aa  124  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0172  diacylglycerol kinase catalytic region  28.19 
 
 
297 aa  123  4e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1510  putative lipid kinase  25.17 
 
 
302 aa  123  4e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1207  lipid kinase  33.33 
 
 
296 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1439  putative lipid kinase  25.25 
 
 
337 aa  116  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3095  lipid kinase  33.33 
 
 
296 aa  117  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00318455  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1324  lipid kinase  33.33 
 
 
296 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2701  lipid kinase  31.6 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1713  hypothetical protein  29.87 
 
 
312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0604892  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3562  lipid kinase  32.74 
 
 
305 aa  112  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2327  lipid kinase  28.45 
 
 
299 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.317751  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0252  putative lipid kinase  28.62 
 
 
293 aa  112  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2484  lipid kinase  28.45 
 
 
299 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1675  putative lipid kinase  26.82 
 
 
345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2376  lipid kinase  28.45 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.367743 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2283  lipid kinase  28.45 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3480  diacylglycerol kinase catalytic region  29.9 
 
 
301 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000301  methylglyoxal synthase  31.28 
 
 
300 aa  109  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.235944  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2179  putative lipid kinase  28.84 
 
 
304 aa  108  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2372  lipid kinase  28.45 
 
 
299 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.132584  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2791  putative lipid kinase  30.13 
 
 
326 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0686435  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2977  lipid kinase  29.77 
 
 
299 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1320  hypothetical protein  27.76 
 
 
304 aa  108  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1619  putative lipid kinase  27.89 
 
 
322 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742984 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2152  lipid kinase  29.61 
 
 
309 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.052393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3068  lipid kinase  28.45 
 
 
299 aa  106  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  hitchhiker  0.00000297552 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1149  lipid kinase  28.45 
 
 
299 aa  106  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.942599  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0975  lipid kinase  28.45 
 
 
299 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.435416 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1303  lipid kinase  29.3 
 
 
299 aa  106  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2377  lipid kinase  28.45 
 
 
299 aa  106  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2518  diacylglycerol kinase, catalytic region  30.9 
 
 
304 aa  105  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3848  diacylglycerol kinase catalytic region  27.96 
 
 
291 aa  106  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000041794  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1562  lipid kinase  30 
 
 
300 aa  105  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.264045 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02015  hypothetical protein  28.02 
 
 
299 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01980  hypothetical protein  28.02 
 
 
299 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14140  lipid kinase  31.49 
 
 
314 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4652  diacylglycerol kinase catalytic region  25.86 
 
 
300 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1571  diacylglycerol kinase catalytic region  28.1 
 
 
299 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1558  lipid kinase  28.02 
 
 
299 aa  104  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1672  putative lipid kinase  27.73 
 
 
308 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2225  lipid kinase  28.02 
 
 
299 aa  104  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1023  putative lipid kinase  26.61 
 
 
291 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0128  diacylglycerol kinase catalytic region  29 
 
 
314 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1642  lipid kinase  30.09 
 
 
293 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.142658  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3628  putative lipid kinase  26.69 
 
 
349 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.619357  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1607  diacylglycerol kinase catalytic region  27.47 
 
 
302 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1582  diacylglycerol kinase catalytic region  27.47 
 
 
302 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3300  lipid kinase  30.53 
 
 
305 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336089  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4772  putative lipid kinase  28.81 
 
 
323 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3759  putative lipid kinase  26.44 
 
 
299 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1666  lipid kinase  28.39 
 
 
295 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.912909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2760  diacylglycerol kinase catalytic region  30.21 
 
 
304 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0246521  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5358  putative lipid kinase  28.45 
 
 
317 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593577  hitchhiker  0.00311469 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4713  bmrU protein  25.52 
 
 
300 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4552  diacylglycerol kinase  25.52 
 
 
300 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5075  diacylglycerol kinase family protein  25.52 
 
 
300 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3527  hypothetical protein  29.29 
 
 
305 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105382  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1567  putative lipid kinase  27.85 
 
 
309 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4570  diacylglycerol kinase  25.52 
 
 
300 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1486  putative lipid kinase  29.06 
 
 
302 aa  99  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4938  bmrU protein  25.61 
 
 
300 aa  99  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1811  diacylglycerol kinase catalytic region  27.41 
 
 
287 aa  99  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4943  bmrU protein  25.61 
 
 
300 aa  99  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2125  lipid kinase  28.39 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.382632  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3958  lipid kinase  29.74 
 
 
317 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2141  diacylglycerol kinase catalytic region  27.74 
 
 
311 aa  98.6  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241813  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  26.46 
 
 
364 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0296  bmrU protein  25.61 
 
 
300 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4959  bmrU protein  25.52 
 
 
300 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4976  bmrU protein  25.52 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1846  putative lipid kinase  27.85 
 
 
309 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3616  lipid kinase  28.39 
 
 
295 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3723  lipid kinase  27.04 
 
 
317 aa  97.1  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1348  hypothetical protein  25.85 
 
 
293 aa  96.7  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>