More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1642 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_1642  lipid kinase  100 
 
 
293 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.142658  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2125  lipid kinase  85.57 
 
 
295 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.382632  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3616  lipid kinase  84.88 
 
 
295 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1666  lipid kinase  84.88 
 
 
295 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.912909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3300  lipid kinase  73.88 
 
 
305 aa  434  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336089  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3527  hypothetical protein  73.54 
 
 
305 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105382  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3958  lipid kinase  73.29 
 
 
317 aa  425  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2135  lipid kinase  67.8 
 
 
302 aa  371  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24970  lipid kinase  67.35 
 
 
302 aa  368  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1562  lipid kinase  63.51 
 
 
300 aa  368  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.264045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14140  lipid kinase  62.63 
 
 
314 aa  363  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04196  lipid kinase  52 
 
 
309 aa  281  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3723  lipid kinase  50.5 
 
 
317 aa  265  5.999999999999999e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1207  lipid kinase  47.12 
 
 
296 aa  262  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3095  lipid kinase  47.12 
 
 
296 aa  262  4e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00318455  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1324  lipid kinase  47.12 
 
 
296 aa  262  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2977  lipid kinase  47.26 
 
 
299 aa  259  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3562  lipid kinase  49.32 
 
 
305 aa  256  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1303  lipid kinase  45.36 
 
 
299 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1571  diacylglycerol kinase catalytic region  46.08 
 
 
299 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1558  lipid kinase  46.08 
 
 
299 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2225  lipid kinase  46.08 
 
 
299 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02015  hypothetical protein  46.08 
 
 
299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01980  hypothetical protein  46.08 
 
 
299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0975  lipid kinase  46.08 
 
 
299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.435416 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1149  lipid kinase  46.08 
 
 
299 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.942599  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3068  lipid kinase  46.08 
 
 
299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  hitchhiker  0.00000297552 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2701  lipid kinase  45.58 
 
 
299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2377  lipid kinase  46.08 
 
 
299 aa  242  6e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2372  lipid kinase  46.42 
 
 
299 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.132584  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2283  lipid kinase  46.42 
 
 
299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2376  lipid kinase  46.42 
 
 
299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.367743 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2484  lipid kinase  46.42 
 
 
299 aa  238  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2327  lipid kinase  46.08 
 
 
299 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.317751  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2152  lipid kinase  40.96 
 
 
309 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.052393  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2507  lipid kinase  43.81 
 
 
311 aa  209  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.594101  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000301  methylglyoxal synthase  39.38 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.235944  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2079  lipid kinase  39.41 
 
 
313 aa  183  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3345  lipid kinase  40.13 
 
 
307 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.056852 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  33.79 
 
 
325 aa  142  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  34.46 
 
 
364 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1632  diacylglycerol kinase, catalytic region  33.11 
 
 
367 aa  122  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0300  putative lipid kinase  28.47 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0294  putative lipid kinase  28.47 
 
 
301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0352  putative lipid kinase  28.47 
 
 
301 aa  116  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0396  putative lipid kinase  28.47 
 
 
301 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0308  putative lipid kinase  28.47 
 
 
301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0291  putative lipid kinase  28.47 
 
 
301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4951  putative lipid kinase  28.47 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0323  putative lipid kinase  28.47 
 
 
301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0369  putative lipid kinase  28.47 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1713  hypothetical protein  32.78 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0604892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0355  putative lipid kinase  28.47 
 
 
301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0303  putative lipid kinase  28.47 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1140  diacylglycerol kinase catalytic region  32.18 
 
 
303 aa  113  5e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4941  putative lipid kinase  31.73 
 
 
305 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454886  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1023  putative lipid kinase  32.91 
 
 
291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0172  diacylglycerol kinase catalytic region  27.55 
 
 
297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1436  putative lipid kinase  27.76 
 
 
316 aa  109  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0775  diacylglycerol kinase catalytic region  31.62 
 
 
316 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0335  putative lipid kinase  26.98 
 
 
308 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000603525  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1952  putative lipid kinase  27.05 
 
 
315 aa  106  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.669604  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1986  putative lipid kinase  27.05 
 
 
315 aa  106  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.520999  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0050  diacylglycerol kinase catalytic region  29.5 
 
 
303 aa  106  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2552  putative lipid kinase  29.9 
 
 
305 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1328  putative lipid kinase  28.73 
 
 
298 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0123469  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01350  conserved protein of unknown function BmrU  30.03 
 
 
323 aa  103  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.956318  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1535  putative lipid kinase  28.73 
 
 
298 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0290428  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1510  putative lipid kinase  26.28 
 
 
302 aa  103  5e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1672  putative lipid kinase  31.28 
 
 
308 aa  102  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3759  putative lipid kinase  33.05 
 
 
299 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1811  diacylglycerol kinase catalytic region  34.33 
 
 
287 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2179  putative lipid kinase  30.42 
 
 
304 aa  100  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1512  putative lipid kinase  27.44 
 
 
337 aa  100  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3254  diacylglycerol kinase catalytic region  30.8 
 
 
300 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3848  diacylglycerol kinase catalytic region  29.91 
 
 
291 aa  99.8  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000041794  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1846  putative lipid kinase  30.42 
 
 
309 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1567  putative lipid kinase  30.42 
 
 
309 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1224  putative lipid kinase  25.99 
 
 
307 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0128  diacylglycerol kinase catalytic region  31.13 
 
 
314 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0510  hypothetical protein  31.95 
 
 
303 aa  97.4  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1562  diacylglycerol kinase catalytic region  29.93 
 
 
297 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1607  diacylglycerol kinase catalytic region  29.39 
 
 
302 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1582  diacylglycerol kinase catalytic region  29.39 
 
 
302 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4652  diacylglycerol kinase catalytic region  26.15 
 
 
300 aa  97.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0296  bmrU protein  25.48 
 
 
300 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2074  putative lipid kinase  33.76 
 
 
298 aa  96.3  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4938  bmrU protein  25.48 
 
 
300 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2518  diacylglycerol kinase, catalytic region  30.13 
 
 
304 aa  95.9  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4943  bmrU protein  25.1 
 
 
300 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3476  putative lipid kinase  29.22 
 
 
300 aa  95.1  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3480  diacylglycerol kinase catalytic region  26.14 
 
 
301 aa  94  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4976  bmrU protein  25.1 
 
 
300 aa  94  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4959  bmrU protein  25.1 
 
 
300 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0081  putative lipid kinase  28.76 
 
 
310 aa  93.2  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4570  diacylglycerol kinase  25.1 
 
 
300 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2227  diacylglycerol kinase catalytic region  32.54 
 
 
312 aa  93.2  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0473  putative lipid kinase  26.1 
 
 
342 aa  93.2  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4713  bmrU protein  26 
 
 
300 aa  92.8  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4552  diacylglycerol kinase  26 
 
 
300 aa  92.8  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>