More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2135 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2135  lipid kinase  100 
 
 
302 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24970  lipid kinase  95.03 
 
 
302 aa  511  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3958  lipid kinase  70.33 
 
 
317 aa  419  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3527  hypothetical protein  68.56 
 
 
305 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105382  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3300  lipid kinase  69 
 
 
305 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336089  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1642  lipid kinase  67.8 
 
 
293 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.142658  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2125  lipid kinase  67.45 
 
 
295 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.382632  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1666  lipid kinase  66.44 
 
 
295 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.912909 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3616  lipid kinase  67.11 
 
 
295 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14140  lipid kinase  68.33 
 
 
314 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1562  lipid kinase  65.54 
 
 
300 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.264045 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04196  lipid kinase  52.33 
 
 
309 aa  292  4e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3723  lipid kinase  52.46 
 
 
317 aa  290  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3095  lipid kinase  46.44 
 
 
296 aa  256  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00318455  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1324  lipid kinase  46.44 
 
 
296 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1207  lipid kinase  46.44 
 
 
296 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3562  lipid kinase  49.32 
 
 
305 aa  255  7e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2977  lipid kinase  45.24 
 
 
299 aa  244  9e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2701  lipid kinase  46.64 
 
 
299 aa  242  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2327  lipid kinase  46.62 
 
 
299 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.317751  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2372  lipid kinase  46.28 
 
 
299 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.132584  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2283  lipid kinase  46.28 
 
 
299 aa  238  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2376  lipid kinase  46.28 
 
 
299 aa  238  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.367743 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1303  lipid kinase  43.54 
 
 
299 aa  238  8e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02015  hypothetical protein  45.48 
 
 
299 aa  238  9e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01980  hypothetical protein  45.48 
 
 
299 aa  238  9e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1149  lipid kinase  45.48 
 
 
299 aa  238  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.942599  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3068  lipid kinase  45.48 
 
 
299 aa  238  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  hitchhiker  0.00000297552 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2484  lipid kinase  46.28 
 
 
299 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0975  lipid kinase  45.48 
 
 
299 aa  238  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.435416 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1571  diacylglycerol kinase catalytic region  45.36 
 
 
299 aa  236  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2377  lipid kinase  45.48 
 
 
299 aa  237  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1558  lipid kinase  45.36 
 
 
299 aa  236  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.560166  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2225  lipid kinase  45.36 
 
 
299 aa  236  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2507  lipid kinase  42.86 
 
 
311 aa  203  4e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.594101  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000301  methylglyoxal synthase  39.59 
 
 
300 aa  200  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.235944  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2079  lipid kinase  40.13 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2152  lipid kinase  37.33 
 
 
309 aa  192  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.052393  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3345  lipid kinase  39.86 
 
 
307 aa  175  8e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.056852 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  33.33 
 
 
325 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  33.77 
 
 
364 aa  122  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1986  putative lipid kinase  29.01 
 
 
315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.520999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1952  putative lipid kinase  29.01 
 
 
315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.669604  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1713  hypothetical protein  34.11 
 
 
312 aa  119  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0604892  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1436  putative lipid kinase  29.01 
 
 
316 aa  119  7e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0294  putative lipid kinase  32.42 
 
 
301 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0300  putative lipid kinase  30.77 
 
 
301 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0352  putative lipid kinase  32.42 
 
 
301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0396  putative lipid kinase  32.42 
 
 
301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0303  putative lipid kinase  32.42 
 
 
301 aa  116  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2552  putative lipid kinase  33.22 
 
 
305 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0308  putative lipid kinase  32.42 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0291  putative lipid kinase  32.42 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0323  putative lipid kinase  32.42 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0355  putative lipid kinase  32.42 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0369  putative lipid kinase  32.42 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4951  putative lipid kinase  32.42 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1140  diacylglycerol kinase catalytic region  32.87 
 
 
303 aa  114  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1632  diacylglycerol kinase, catalytic region  33 
 
 
367 aa  112  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4941  putative lipid kinase  36.24 
 
 
305 aa  112  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454886  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0335  putative lipid kinase  28.03 
 
 
308 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000603525  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1510  putative lipid kinase  29.71 
 
 
302 aa  108  8.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3254  diacylglycerol kinase catalytic region  31 
 
 
300 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1023  putative lipid kinase  34.19 
 
 
291 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0081  putative lipid kinase  28.81 
 
 
310 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0172  diacylglycerol kinase catalytic region  30.04 
 
 
297 aa  106  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0775  diacylglycerol kinase catalytic region  32.84 
 
 
316 aa  105  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2178  diacylglycerol kinase, catalytic region  33.05 
 
 
297 aa  105  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4943  bmrU protein  27.92 
 
 
300 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4938  bmrU protein  27.92 
 
 
300 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0252  putative lipid kinase  32.91 
 
 
293 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1672  putative lipid kinase  31.65 
 
 
308 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4713  bmrU protein  28.93 
 
 
300 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4552  diacylglycerol kinase  28.93 
 
 
300 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5075  diacylglycerol kinase family protein  28.93 
 
 
300 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2179  putative lipid kinase  28.52 
 
 
304 aa  103  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0050  diacylglycerol kinase catalytic region  29.06 
 
 
303 aa  102  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1582  diacylglycerol kinase catalytic region  30.3 
 
 
302 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1607  diacylglycerol kinase catalytic region  30.3 
 
 
302 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0296  bmrU protein  27.55 
 
 
300 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4976  bmrU protein  28.51 
 
 
300 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4652  diacylglycerol kinase catalytic region  28.93 
 
 
300 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4959  bmrU protein  28.51 
 
 
300 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4570  diacylglycerol kinase  28.51 
 
 
300 aa  102  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5358  putative lipid kinase  30.92 
 
 
317 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593577  hitchhiker  0.00311469 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3759  putative lipid kinase  31.72 
 
 
299 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2187  diacylglycerol kinase catalytic region  32.93 
 
 
305 aa  101  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.670383  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1486  putative lipid kinase  32.64 
 
 
302 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2791  putative lipid kinase  29.51 
 
 
326 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0686435  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2891  diacylglycerol kinase catalytic region  35.94 
 
 
310 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1224  putative lipid kinase  31.82 
 
 
307 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1846  putative lipid kinase  30.27 
 
 
309 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0128  diacylglycerol kinase catalytic region  32.17 
 
 
314 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3848  diacylglycerol kinase catalytic region  30.95 
 
 
291 aa  100  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000041794  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01350  conserved protein of unknown function BmrU  29.04 
 
 
323 aa  100  4e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.956318  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1439  putative lipid kinase  27.81 
 
 
337 aa  99.8  5e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1567  putative lipid kinase  30.27 
 
 
309 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2227  diacylglycerol kinase catalytic region  34.63 
 
 
312 aa  99.8  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1610  diacylglycerol kinase catalytic region  29.05 
 
 
287 aa  99  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1943  putative lipid kinase  35 
 
 
313 aa  99  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282737  normal  0.0158542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>