110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2550 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2550  multidrug resistance efflux pump-like protein  100 
 
 		 373 aa  755    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3310  multidrug resistance efflux pump-like protein  84.4 
 
 		 362 aa  624  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3932  hypothetical protein  22.96 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  26.97 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3640  hypothetical protein  22.96 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0445964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  27.35 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  25.96 
 
 		 356 aa  62.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  26.74 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  25.08 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  26.64 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2865  HlyD family secretion protein  24.35 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.59 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.53 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  24.17 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  24.9 
 
 		 365 aa  55.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  25.96 
 
 		 380 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  28.68 
 
 		 350 aa  54.3  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3343  RND family efflux transporter MFP subunit  23.86 
 
 		 435 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  26.03 
 
 		 344 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  26.01 
 
 		 349 aa  53.9  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  33.67 
 
 		 320 aa  54.3  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1017  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.86 
 
 		 420 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0996  RND family efflux transporter MFP subunit  23.51 
 
 		 435 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  25.58 
 
 		 407 aa  53.1  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  23.81 
 
 		 376 aa  53.1  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  27.82 
 
 		 356 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  25.68 
 
 		 355 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1029  RND family efflux transporter MFP subunit  24.06 
 
 		 435 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.981321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  23.19 
 
 		 375 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2010  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.77 
 
 		 412 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2279  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3694  hypothetical protein  23.18 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2993  RND family efflux transporter MFP subunit  22.65 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3724  RND family efflux transporter MFP subunit  24.54 
 
 		 420 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.376754 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  26.45 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.71 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  24.79 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.398677 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4697  RND family efflux transporter MFP subunit  30.26 
 
 		 319 aa  50.8  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.715091  normal  0.20048 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1515  secretion protein HlyD family protein  25.44 
 
 		 365 aa  51.2  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  27.63 
 
 		 379 aa  50.8  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.97 
 
 		 462 aa  50.8  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0499  secretion protein HlyD family protein  27.53 
 
 		 323 aa  50.4  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  25.7 
 
 		 329 aa  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2373  secretion protein HlyD family protein  27.32 
 
 		 395 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2238  RND family efflux transporter MFP subunit  25.89 
 
 		 421 aa  49.7  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.811605  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  23.38 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2149  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.9 
 
 		 409 aa  48.9  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.111795  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  25.72 
 
 		 329 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  24.58 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2852  secretion protein HlyD  22.47 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0861  RND family efflux transporter MFP subunit  26.27 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  24.73 
 
 		 393 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3161  RND family efflux transporter MFP subunit  26.27 
 
 		 420 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2078  secretion protein HlyD family protein  35.44 
 
 		 397 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2222  secretion protein HlyD family protein  22.8 
 
 		 364 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827157  normal  0.0630551 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  25 
 
 		 357 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  22.42 
 
 		 315 aa  47.4  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3365  RND family efflux transporter MFP subunit  22.59 
 
 		 420 aa  47.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  23.47 
 
 		 406 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  28.86 
 
 		 344 aa  47  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0897  RND family efflux transporter MFP subunit  22.88 
 
 		 419 aa  47  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  27.6 
 
 		 392 aa  47  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0721  RND family efflux transporter MFP subunit  25.33 
 
 		 420 aa  47  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1272  secretion protein HlyD family protein  24.17 
 
 		 367 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.529481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1513  secretion protein HlyD family protein  24.02 
 
 		 384 aa  46.2  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  23.88 
 
 		 390 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1184  secretion protein HlyD  25.4 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  32.46 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3262  RND family efflux transporter MFP subunit  25.85 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.933024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1522  secretion protein HlyD family protein  24.02 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  21.09 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  24.66 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3549  secretion protein HlyD family protein  25.85 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  23.72 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  25.62 
 
 		 352 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2225  secretion protein HlyD family protein  25.85 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.818643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5419  secretion protein HlyD family protein  27.34 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1703  secretion protein HlyD family protein  27.56 
 
 		 358 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2833  secretion protein HlyD family protein  24.02 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121026  normal  0.828234 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8250  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.28 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.673804  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  23.02 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0986  secretion protein HlyD  24.67 
 
 		 328 aa  44.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1082  putative ABC transport system, lipoprotein  20.38 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  23.83 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2082  secretion protein HlyD  24.32 
 
 		 371 aa  44.7  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  24.54 
 
 		 348 aa  44.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  24.08 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  33.06 
 
 		 371 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  24.04 
 
 		 366 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  24.77 
 
 		 350 aa  44.3  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4577  secretion protein HlyD  25.09 
 
 		 354 aa  44.3  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.231546  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4453  secretion protein HlyD family protein  21.72 
 
 		 367 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0217211  normal  0.353022 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  24.23 
 
 		 405 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  24.73 
 
 		 368 aa  44.3  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  26.01 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0653  secretion protein HlyD family protein  23.04 
 
 		 357 aa  43.5  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  25.28 
 
 		 357 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  22.98 
 
 		 358 aa  43.9  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1611  secretion protein HlyD  21.01 
 
 		 341 aa  43.5  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306933  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  22.71 
 
 		 411 aa  43.1  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  24.15 
 
 		 363 aa  43.1  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>