96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3310 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3310  multidrug resistance efflux pump-like protein  100 
 
 		 362 aa  730    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2550  multidrug resistance efflux pump-like protein  84.4 
 
 		 373 aa  624  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3932  hypothetical protein  24.28 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3640  hypothetical protein  23.83 
 
 		 348 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0445964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  27 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2865  HlyD family secretion protein  24.4 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  24.24 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  30.81 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.56 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  24.12 
 
 		 427 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9216  HlyD family secretion protein  28.45 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2852  secretion protein HlyD  21.74 
 
 		 419 aa  54.7  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  24.41 
 
 		 375 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  27.38 
 
 		 380 aa  53.5  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  25.59 
 
 		 349 aa  52.8  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  24.75 
 
 		 385 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.1 
 
 		 462 aa  51.2  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3724  RND family efflux transporter MFP subunit  21.18 
 
 		 420 aa  50.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.376754 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3694  hypothetical protein  22.25 
 
 		 419 aa  50.4  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1515  secretion protein HlyD family protein  22.49 
 
 		 365 aa  50.1  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  24.56 
 
 		 344 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  25.73 
 
 		 471 aa  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1748  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.79 
 
 		 388 aa  49.7  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1611  secretion protein HlyD  24.79 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306933  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2118  RND family efflux transporter MFP subunit  23.59 
 
 		 418 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  24.21 
 
 		 355 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2993  RND family efflux transporter MFP subunit  22.83 
 
 		 435 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3365  RND family efflux transporter MFP subunit  20.94 
 
 		 420 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2951  secretion protein HlyD family protein  20.23 
 
 		 365 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2010  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.85 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2279  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1017  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.56 
 
 		 420 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  27.19 
 
 		 340 aa  47.8  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  27.15 
 
 		 392 aa  47.8  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  24.81 
 
 		 356 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4697  RND family efflux transporter MFP subunit  30.26 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.715091  normal  0.20048 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  24.4 
 
 		 390 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0996  RND family efflux transporter MFP subunit  23.56 
 
 		 435 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  22.79 
 
 		 394 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0628  secretion protein HlyD family protein  25.79 
 
 		 352 aa  47.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3343  RND family efflux transporter MFP subunit  23.56 
 
 		 435 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  23.3 
 
 		 366 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  26.23 
 
 		 355 aa  46.6  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  24.56 
 
 		 349 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  24.63 
 
 		 351 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0499  secretion protein HlyD family protein  25.42 
 
 		 323 aa  46.6  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4577  secretion protein HlyD  27 
 
 		 354 aa  46.6  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.231546  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0861  RND family efflux transporter MFP subunit  23.11 
 
 		 420 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  31.58 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  34.65 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  22.83 
 
 		 357 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  25.2 
 
 		 350 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  24.9 
 
 		 351 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  23.91 
 
 		 351 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0986  secretion protein HlyD  24.41 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3161  RND family efflux transporter MFP subunit  25.32 
 
 		 420 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0721  RND family efflux transporter MFP subunit  22.45 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  23.23 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  26.27 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3808  secretion protein HlyD family protein  21.27 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0541127 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  23.96 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  24.39 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  25.09 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1029  RND family efflux transporter MFP subunit  23.01 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.981321 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5206  secretion protein HlyD family protein  25.62 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  23.31 
 
 		 354 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  27.57 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  26.33 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  23.96 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0554  HlyD family secretion protein  27.78 
 
 		 321 aa  44.3  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0897  RND family efflux transporter MFP subunit  20.87 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  26.23 
 
 		 357 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  28.05 
 
 		 344 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  27.44 
 
 		 350 aa  44.3  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5114  secretion protein HlyD family protein  25.21 
 
 		 319 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.22 
 
 		 407 aa  43.5  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4288  RND family efflux transporter MFP subunit  25.39 
 
 		 349 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3262  RND family efflux transporter MFP subunit  24.89 
 
 		 420 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.933024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4074  RND family efflux transporter MFP subunit  19.59 
 
 		 420 aa  43.9  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  23.9 
 
 		 376 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2149  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.42 
 
 		 409 aa  43.5  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.111795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4720  multidrug resistance protein MdtN  22.51 
 
 		 349 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623543 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2687  HlyD family secretion protein  24.05 
 
 		 357 aa  43.5  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3647  multidrug resistance protein MdtN  22.51 
 
 		 349 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00582079  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2833  secretion protein HlyD family protein  23.98 
 
 		 383 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121026  normal  0.828234 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0478  HlyD family secretion protein  35.29 
 
 		 322 aa  43.5  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.161841 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5580  multidrug resistance protein MdtN  22.51 
 
 		 349 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541238 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  22.58 
 
 		 359 aa  43.5  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1719  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.43 
 
 		 517 aa  43.1  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0477  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  24.23 
 
 		 344 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1522  secretion protein HlyD family protein  23.98 
 
 		 378 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0105  RND family efflux transporter MFP subunit  26.29 
 
 		 348 aa  43.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  22.75 
 
 		 413 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.398677 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1823  secretion protein HlyD family protein  24.26 
 
 		 355 aa  43.1  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2304  secretion protein HlyD family protein  23.94 
 
 		 358 aa  42.7  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.396898  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5441  secretion protein HlyD  25.19 
 
 		 321 aa  42.7  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0649906 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  24.91 
 
 		 329 aa  42.7  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>