More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2235 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2235  ABC transporter related protein  100 
 
 		 334 aa  663    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4168  ABC transporter related  41.67 
 
 		 318 aa  223  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3788  ABC transporter related  42 
 
 		 318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4276  ABC transporter related protein  42.67 
 
 		 303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06880  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.18 
 
 		 307 aa  216  5.9999999999999996e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0918509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1133  ABC transporter related protein  41.16 
 
 		 304 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0977  ABC transporter related  41.42 
 
 		 328 aa  213  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0400236 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1854  ABC transporter related protein  41.3 
 
 		 303 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0626891  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0603  ABC transporter-like protein  42.19 
 
 		 317 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.858609 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4447  ABC transporter related  39.93 
 
 		 303 aa  210  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0452  ABC transporter related protein  38.59 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3975  ABC transporter related  39.56 
 
 		 312 aa  189  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.138186  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3790  ABC transporter related  49.27 
 
 		 304 aa  182  9.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.021696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4445  ABC transporter related  37.46 
 
 		 313 aa  175  9e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0605  ABC transporter-like protein  38.49 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.547486  normal  0.781825 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  38.06 
 
 		 318 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1852  ABC transporter related protein  45.54 
 
 		 304 aa  170  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0481458  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4170  ABC transporter related  46.41 
 
 		 304 aa  169  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720041  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  35.43 
 
 		 309 aa  168  9e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  41.7 
 
 		 318 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  41.7 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  36.68 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0975  ABC transporter related  45.71 
 
 		 391 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0454  ABC transporter related protein  39.73 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.815425  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  43.04 
 
 		 310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  39.27 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  43.04 
 
 		 310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1135  ABC transporter related protein  43.9 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  42.04 
 
 		 322 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06860  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.96 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1076  ABC transporter related  34.13 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  37.12 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0914  ABC transporter related  36.07 
 
 		 290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4914  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.84 
 
 		 316 aa  162  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000429083 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  29.22 
 
 		 336 aa  160  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  37.91 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  44.09 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  31.21 
 
 		 315 aa  160  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 		 317 aa  160  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  32.24 
 
 		 316 aa  160  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  41.2 
 
 		 322 aa  159  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  38.27 
 
 		 332 aa  159  6e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  30.79 
 
 		 310 aa  159  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  36.7 
 
 		 274 aa  159  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  42.31 
 
 		 284 aa  159  7e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32 
 
 		 305 aa  159  8e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  35.91 
 
 		 326 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  33.01 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0496  ABC transporter related  39.52 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.630223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  40.91 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  36.16 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  41.98 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  34.65 
 
 		 308 aa  158  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  38.43 
 
 		 328 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  44.2 
 
 		 318 aa  157  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4062  ABC transporter related  41.35 
 
 		 318 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4174  ABC transporter related  41.35 
 
 		 318 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  43.72 
 
 		 301 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  33.11 
 
 		 298 aa  157  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  35.1 
 
 		 305 aa  156  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2233  ABC transporter related protein  42.15 
 
 		 318 aa  156  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0193643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39000  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.8 
 
 		 322 aa  155  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  31.48 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  31.48 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  34.23 
 
 		 310 aa  155  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4278  ABC transporter related protein  43.54 
 
 		 356 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.786562  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3534  ABC transporter related  40.35 
 
 		 348 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  36.65 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  33.78 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0497  ABC transporter related  39.52 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  38.53 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  39.38 
 
 		 332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  39.13 
 
 		 327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  38.89 
 
 		 331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  41.31 
 
 		 253 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  32.67 
 
 		 309 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  37.08 
 
 		 299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  42.02 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  31.56 
 
 		 300 aa  153  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  33.33 
 
 		 317 aa  153  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  31.93 
 
 		 295 aa  152  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  42.25 
 
 		 299 aa  152  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  31.1 
 
 		 340 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  31.46 
 
 		 311 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  28.9 
 
 		 312 aa  152  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 		 304 aa  152  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3717  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.14 
 
 		 380 aa  152  8e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0867076  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  36.93 
 
 		 319 aa  152  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.01 
 
 		 317 aa  152  8e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 		 316 aa  152  8.999999999999999e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  41.26 
 
 		 304 aa  152  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  41.67 
 
 		 310 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  34.11 
 
 		 311 aa  152  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.06 
 
 		 312 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  34.12 
 
 		 315 aa  152  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  39.91 
 
 		 303 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 321 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  28.9 
 
 		 312 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  34.03 
 
 		 289 aa  151  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>