More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1854 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1854  ABC transporter related protein  100 
 
 
303 aa  613  9.999999999999999e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0626891  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4276  ABC transporter related protein  72.52 
 
 
303 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4447  ABC transporter related  70.43 
 
 
303 aa  441  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0452  ABC transporter related protein  69.97 
 
 
305 aa  435  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1133  ABC transporter related protein  68.9 
 
 
304 aa  435  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0603  ABC transporter-like protein  68.56 
 
 
317 aa  427  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.858609 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4168  ABC transporter related  64 
 
 
318 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3788  ABC transporter related  62.33 
 
 
318 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352086  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0977  ABC transporter related  62.5 
 
 
328 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0400236 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06880  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  59.87 
 
 
307 aa  369  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0918509  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3975  ABC transporter related  44.81 
 
 
312 aa  236  5.0000000000000005e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.138186  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2235  ABC transporter related protein  41.3 
 
 
334 aa  212  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461241  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  37.54 
 
 
332 aa  159  7e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  37.21 
 
 
305 aa  158  9e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  35.57 
 
 
457 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  34.74 
 
 
311 aa  155  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  35.83 
 
 
305 aa  155  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  38.64 
 
 
303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  32.12 
 
 
308 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  29.77 
 
 
300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  36.21 
 
 
308 aa  152  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1767  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  39.05 
 
 
255 aa  152  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  33.55 
 
 
299 aa  152  5e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  38.13 
 
 
330 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1135  ABC transporter related protein  41.23 
 
 
301 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.43 
 
 
368 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  36.21 
 
 
306 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  35.29 
 
 
310 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  33.45 
 
 
315 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  35 
 
 
300 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  39.45 
 
 
301 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  29.57 
 
 
312 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.1 
 
 
324 aa  149  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  30.92 
 
 
312 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  36.54 
 
 
303 aa  149  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  33.55 
 
 
312 aa  149  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  39.25 
 
 
300 aa  149  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  31.41 
 
 
310 aa  149  8e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  30.92 
 
 
312 aa  148  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  36.79 
 
 
298 aa  148  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  30.92 
 
 
312 aa  148  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  37.04 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  30.92 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  30.92 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  30.92 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0605  ABC transporter-like protein  36.47 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.547486  normal  0.781825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  37.29 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  32.09 
 
 
305 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  30.59 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4445  ABC transporter related  34.43 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4170  ABC transporter related  42.45 
 
 
304 aa  146  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720041  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  29.24 
 
 
312 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  30.59 
 
 
312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3790  ABC transporter related  42.92 
 
 
304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.021696  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  29.9 
 
 
309 aa  146  5e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  29.9 
 
 
311 aa  146  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  31.68 
 
 
303 aa  146  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  34 
 
 
317 aa  145  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  32.25 
 
 
335 aa  145  6e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.18 
 
 
295 aa  145  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  33.44 
 
 
344 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  30.35 
 
 
315 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  32.25 
 
 
315 aa  145  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  39.72 
 
 
301 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  34.11 
 
 
310 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  39.62 
 
 
303 aa  144  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  36.32 
 
 
316 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  36.68 
 
 
338 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  37.07 
 
 
316 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  37.14 
 
 
259 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  39.74 
 
 
326 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  35.47 
 
 
311 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  38.68 
 
 
308 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  39.72 
 
 
250 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  31.17 
 
 
305 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  39.29 
 
 
230 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04471  putative multidrug efflux ABC transporter  37.39 
 
 
337 aa  143  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.797798  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1501  ABC transporter, ATP-binding protein  36.16 
 
 
303 aa  142  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.505204  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  30.1 
 
 
313 aa  142  5e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  35.39 
 
 
316 aa  142  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  39.61 
 
 
253 aa  142  5e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  40.29 
 
 
318 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.22 
 
 
305 aa  142  7e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0878  ABC transporter, ATP-binding protein  32.58 
 
 
266 aa  142  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  37.39 
 
 
322 aa  142  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  38.59 
 
 
337 aa  142  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  32.78 
 
 
319 aa  142  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  33.44 
 
 
318 aa  142  9e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  33.22 
 
 
373 aa  142  9e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  37.12 
 
 
338 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  39.71 
 
 
240 aa  141  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  38.29 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  30.43 
 
 
313 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  35.97 
 
 
307 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  35.88 
 
 
300 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.88 
 
 
319 aa  141  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  35.88 
 
 
300 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1852  ABC transporter related protein  38.12 
 
 
304 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0481458  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  30.58 
 
 
295 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  35.88 
 
 
300 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>