More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4445 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4445  ABC transporter related  100 
 
 
313 aa  608  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0605  ABC transporter-like protein  65.33 
 
 
308 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.547486  normal  0.781825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1135  ABC transporter related protein  65.89 
 
 
301 aa  363  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1852  ABC transporter related protein  64.82 
 
 
304 aa  362  4e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0481458  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4278  ABC transporter related protein  66.67 
 
 
356 aa  353  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.786562  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0454  ABC transporter related protein  60.98 
 
 
316 aa  345  6e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.815425  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0975  ABC transporter related  56.91 
 
 
391 aa  306  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06860  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.33 
 
 
323 aa  301  1e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4170  ABC transporter related  56.48 
 
 
304 aa  296  3e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720041  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3790  ABC transporter related  54.64 
 
 
304 aa  293  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.021696  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3977  ABC transporter related  44.93 
 
 
315 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2233  ABC transporter related protein  52.91 
 
 
318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0193643  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  37.28 
 
 
309 aa  166  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  30.98 
 
 
305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2235  ABC transporter related protein  37.46 
 
 
334 aa  162  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461241  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  31.44 
 
 
310 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  29.43 
 
 
298 aa  159  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  31.27 
 
 
311 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.22 
 
 
317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.100021 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.84 
 
 
333 aa  155  8e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.26 
 
 
316 aa  155  8e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.24 
 
 
317 aa  155  1e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  37.7 
 
 
310 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  35.59 
 
 
318 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  44.39 
 
 
310 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  33.66 
 
 
340 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.61 
 
 
301 aa  154  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.43 
 
 
317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  35.98 
 
 
313 aa  153  4e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2675  ABC transporter related  39.91 
 
 
247 aa  153  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1202  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.08 
 
 
315 aa  153  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798744  normal  0.0328977 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  33.86 
 
 
314 aa  153  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  31.25 
 
 
305 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.45 
 
 
345 aa  152  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  35.16 
 
 
308 aa  152  7e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.42 
 
 
334 aa  152  8e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  34.44 
 
 
304 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1170  ribosomal protein S16  32.12 
 
 
318 aa  152  8.999999999999999e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.36106  hitchhiker  0.000000135751 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  38 
 
 
301 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  37.07 
 
 
309 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.07 
 
 
309 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  29.43 
 
 
307 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 
309 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  37.07 
 
 
309 aa  152  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  37.44 
 
 
329 aa  151  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.07 
 
 
309 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  28.71 
 
 
308 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.96 
 
 
279 aa  151  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  37.05 
 
 
301 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.84 
 
 
299 aa  150  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  35.93 
 
 
236 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  35.56 
 
 
313 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  35.56 
 
 
313 aa  150  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  36.04 
 
 
328 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  31.7 
 
 
308 aa  150  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  39.39 
 
 
341 aa  149  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  31.05 
 
 
331 aa  149  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  33 
 
 
315 aa  149  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  32.91 
 
 
320 aa  149  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.05 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  31.44 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  30.72 
 
 
331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4276  ABC transporter related protein  40.54 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  37.79 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  31.49 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  35.85 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  31.15 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  32.15 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  29.1 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  33.93 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.95 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18350  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.91 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  39.75 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  39.09 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.17 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  31.15 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  37.73 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  28.8 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  31.02 
 
 
303 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  34.08 
 
 
308 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4062  ABC transporter related  36.72 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2089  ABC transporter related  33.44 
 
 
288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4174  ABC transporter related  36.72 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0603  ABC transporter-like protein  34.29 
 
 
317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.858609 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  35.87 
 
 
321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  28.53 
 
 
369 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4734  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.55 
 
 
334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  35.59 
 
 
309 aa  146  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4151  ABC transporter-like  32.1 
 
 
275 aa  146  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000107642  normal  0.126355 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4914  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.62 
 
 
316 aa  146  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000429083 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2107  ABC transporter related protein  29.58 
 
 
287 aa  146  5e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.67 
 
 
308 aa  146  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  36.33 
 
 
302 aa  145  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  38.21 
 
 
316 aa  146  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  41.6 
 
 
1171 aa  146  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  37.79 
 
 
318 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  39.81 
 
 
310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  39.81 
 
 
310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3987  amino acid adenylation domain protein  33.77 
 
 
3786 aa  145  9e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  38.63 
 
 
304 aa  145  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>