More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_06860 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_06860  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 
323 aa  648    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1852  ABC transporter related protein  56.91 
 
 
304 aa  335  5.999999999999999e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0481458  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4445  ABC transporter related  57.33 
 
 
313 aa  318  7.999999999999999e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0454  ABC transporter related protein  53.21 
 
 
316 aa  315  5e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.815425  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0605  ABC transporter-like protein  56.21 
 
 
308 aa  311  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.547486  normal  0.781825 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3790  ABC transporter related  54.15 
 
 
304 aa  310  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.021696  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1135  ABC transporter related protein  54.87 
 
 
301 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4170  ABC transporter related  54.49 
 
 
304 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720041  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4278  ABC transporter related protein  56.83 
 
 
356 aa  305  7e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.786562  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0975  ABC transporter related  51.66 
 
 
391 aa  280  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3977  ABC transporter related  43.48 
 
 
315 aa  230  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2233  ABC transporter related protein  41.04 
 
 
318 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0193643  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  36.66 
 
 
313 aa  185  8e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  36.66 
 
 
313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  36.98 
 
 
313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  35.88 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  35.71 
 
 
303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.13 
 
 
317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  35.37 
 
 
303 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  35.93 
 
 
303 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  39.8 
 
 
310 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  40.64 
 
 
315 aa  177  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  36.42 
 
 
310 aa  176  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.67 
 
 
331 aa  176  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  34.67 
 
 
303 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  34.67 
 
 
331 aa  176  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  34.67 
 
 
303 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  37.46 
 
 
314 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  31.35 
 
 
327 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  41.18 
 
 
309 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  34.33 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  40.38 
 
 
304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.71 
 
 
317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  40.95 
 
 
309 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  40.95 
 
 
309 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  40.95 
 
 
309 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.43 
 
 
317 aa  172  5e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  38.41 
 
 
300 aa  172  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  40.95 
 
 
309 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 
318 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 
309 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  40.57 
 
 
303 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  40 
 
 
318 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  34.11 
 
 
311 aa  170  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.86 
 
 
338 aa  169  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  39.55 
 
 
316 aa  169  7e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  38.21 
 
 
310 aa  169  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  40.09 
 
 
340 aa  168  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  42.4 
 
 
261 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  33.01 
 
 
331 aa  168  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.82 
 
 
309 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2235  ABC transporter related protein  35.96 
 
 
334 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461241  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1438  ABC transporter, ATPase subunit  35.22 
 
 
310 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  39.66 
 
 
309 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  39.22 
 
 
309 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.43 
 
 
333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18350  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  32.09 
 
 
313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  39.09 
 
 
337 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3123  ABC transporter related  36.51 
 
 
313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.84 
 
 
312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  29.71 
 
 
336 aa  166  4e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  32.04 
 
 
307 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  42.49 
 
 
309 aa  166  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.12 
 
 
316 aa  166  4e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  29.81 
 
 
325 aa  165  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0633  ABC transporter related  37.31 
 
 
314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3948  ABC transporter related  41.25 
 
 
294 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  39.39 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0090  ABC transporter-like protein  31.68 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.101268 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  38.66 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4276  ABC transporter related protein  36.27 
 
 
303 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  36.04 
 
 
304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  40.91 
 
 
305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4168  ABC transporter related  38.82 
 
 
318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2643  ABC transporter related  39.46 
 
 
304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  32.23 
 
 
307 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.53 
 
 
305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  38.89 
 
 
305 aa  162  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  38.49 
 
 
305 aa  162  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  38.56 
 
 
320 aa  162  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  35.16 
 
 
293 aa  162  7e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.33 
 
 
325 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.97 
 
 
345 aa  162  8.000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4151  ABC transporter-like  36.44 
 
 
275 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000107642  normal  0.126355 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.09 
 
 
339 aa  161  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0303  ABC transporter related protein  38.03 
 
 
244 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  40.09 
 
 
311 aa  161  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  32.89 
 
 
305 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1475  ABC transporter, ATP-binding protein  33.66 
 
 
300 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  39.32 
 
 
305 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  39.15 
 
 
310 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  39.74 
 
 
305 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  28.71 
 
 
324 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4734  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.69 
 
 
334 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  44.09 
 
 
332 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  37.55 
 
 
307 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  35.91 
 
 
305 aa  160  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  39.84 
 
 
319 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  32.23 
 
 
295 aa  160  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  39.35 
 
 
301 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>