More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3977 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3977  ABC transporter related  100 
 
 		 315 aa  602  1.0000000000000001e-171  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1135  ABC transporter related protein  56.59 
 
 		 301 aa  228  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1852  ABC transporter related protein  47.89 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0481458  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0605  ABC transporter-like protein  44.81 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.547486  normal  0.781825 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4445  ABC transporter related  44.93 
 
 		 313 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4278  ABC transporter related protein  47.5 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.786562  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06860  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.48 
 
 		 323 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0454  ABC transporter related protein  52.91 
 
 		 316 aa  213  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.815425  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3790  ABC transporter related  55.78 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.021696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0975  ABC transporter related  43.42 
 
 		 391 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4170  ABC transporter related  56.28 
 
 		 304 aa  209  6e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720041  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2233  ABC transporter related protein  52.68 
 
 		 318 aa  196  6e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0193643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  44.76 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1751  ABC transporter related  45.54 
 
 		 302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  39.91 
 
 		 303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  29.45 
 
 		 318 aa  162  7e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  41.7 
 
 		 287 aa  159  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  29.77 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  29.45 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  40.57 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  29.77 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  29.77 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  29.77 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1640  ABC transporter related  41.63 
 
 		 287 aa  156  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  30.42 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.75 
 
 		 312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  37.61 
 
 		 315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  44.44 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  38.46 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  39.35 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2089  ABC transporter related  40.72 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.02 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  40.81 
 
 		 304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  29.45 
 
 		 309 aa  153  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.42 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  31.41 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  29.13 
 
 		 309 aa  153  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  35.92 
 
 		 313 aa  153  5e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  36.33 
 
 		 313 aa  153  5e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  35.92 
 
 		 313 aa  152  7e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  41.46 
 
 		 309 aa  152  8.999999999999999e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1642  ABC transporter related  43.93 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0749423 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  36.77 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.72 
 
 		 325 aa  150  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  38 
 
 		 316 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 		 301 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.1 
 
 		 317 aa  150  4e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  38.43 
 
 		 337 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  34.76 
 
 		 236 aa  149  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  40.98 
 
 		 293 aa  149  6e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  45.33 
 
 		 318 aa  149  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  36.33 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.45 
 
 		 317 aa  149  7e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  35.38 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0303  ABC transporter related protein  43.19 
 
 		 244 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  37.5 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  41.98 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  37.5 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  37.5 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02620  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.72 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  36.19 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  34.45 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.32 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  36.9 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  39.52 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  35.21 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2940  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.38 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  29.33 
 
 		 307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  39.39 
 
 		 304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  35.89 
 
 		 305 aa  146  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  36.69 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  36.82 
 
 		 341 aa  146  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  35.38 
 
 		 316 aa  146  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1501  ABC transporter, ATP-binding protein  39.05 
 
 		 303 aa  145  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.505204  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  37.91 
 
 		 305 aa  145  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  35.41 
 
 		 302 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  35.41 
 
 		 302 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  36.29 
 
 		 312 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  40 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1706  ABC transporter related  35.1 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1124  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.78 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3975  ABC transporter related  45.22 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.138186  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4399  ABC transporter related  37.83 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104293  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  36.69 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0439  ABC transporter related  41.59 
 
 		 283 aa  144  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2348  ABC transporter related  33.33 
 
 		 306 aa  144  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  39.23 
 
 		 314 aa  143  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  34.88 
 
 		 259 aa  143  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.74 
 
 		 321 aa  143  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2142  ABC-type transport system, ATPase component  42.42 
 
 		 247 aa  142  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0133824  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  35.35 
 
 		 346 aa  143  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  31.6 
 
 		 270 aa  142  5e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2566  ABC transporter related  39.43 
 
 		 310 aa  142  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.2512  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1044  ABC transporter related  39.43 
 
 		 331 aa  142  6e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  31.8 
 
 		 305 aa  142  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  28.76 
 
 		 307 aa  142  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23580  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.44 
 
 		 324 aa  142  9e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.185553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5258  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.47 
 
 		 330 aa  141  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  38.72 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>