More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4170 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4170  ABC transporter related  100 
 
 
304 aa  590  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720041  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3790  ABC transporter related  95.39 
 
 
304 aa  548  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.021696  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0605  ABC transporter-like protein  63.64 
 
 
308 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.547486  normal  0.781825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0975  ABC transporter related  66.11 
 
 
391 aa  361  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4278  ABC transporter related protein  66.22 
 
 
356 aa  360  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.786562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1135  ABC transporter related protein  63.49 
 
 
301 aa  349  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1852  ABC transporter related protein  63.85 
 
 
304 aa  335  3.9999999999999995e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0481458  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0454  ABC transporter related protein  58.63 
 
 
316 aa  324  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.815425  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4445  ABC transporter related  57.48 
 
 
313 aa  300  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06860  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.64 
 
 
323 aa  297  1e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3977  ABC transporter related  56.28 
 
 
315 aa  209  7e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2233  ABC transporter related protein  51.58 
 
 
318 aa  204  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0193643  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  40.5 
 
 
310 aa  169  5e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  34.01 
 
 
303 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  38.13 
 
 
310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  40.81 
 
 
309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39 
 
 
316 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  33.33 
 
 
303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  35.88 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  33.67 
 
 
303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.67 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  33.67 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  40.71 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  33.67 
 
 
303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2089  ABC transporter related  40.09 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  34.01 
 
 
331 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  33.67 
 
 
303 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  41.13 
 
 
287 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  38.25 
 
 
309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  38.25 
 
 
309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.25 
 
 
309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  40.99 
 
 
318 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.55 
 
 
317 aa  162  9e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  36.79 
 
 
310 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.26 
 
 
317 aa  161  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.85 
 
 
309 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  40.87 
 
 
304 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  34.2 
 
 
266 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.85 
 
 
309 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  39.82 
 
 
309 aa  159  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  39.57 
 
 
339 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  43.06 
 
 
314 aa  159  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  39.64 
 
 
318 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03556  ABC transporter, ATP-binding protein  32.67 
 
 
310 aa  158  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.333209  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  39.72 
 
 
306 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.34 
 
 
317 aa  158  1e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  39.51 
 
 
303 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  33.99 
 
 
313 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  41.77 
 
 
305 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  39.01 
 
 
309 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  39.19 
 
 
315 aa  156  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  31.88 
 
 
307 aa  156  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  34.34 
 
 
302 aa  156  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  36.19 
 
 
319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  41.46 
 
 
331 aa  155  6e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  39.82 
 
 
309 aa  155  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0303  ABC transporter related protein  42.15 
 
 
244 aa  155  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  36.15 
 
 
292 aa  155  8e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  32.89 
 
 
309 aa  155  8e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  38.12 
 
 
319 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  40.09 
 
 
340 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 
308 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  33.2 
 
 
327 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  42.4 
 
 
310 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  37.01 
 
 
309 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2235  ABC transporter related protein  38.56 
 
 
334 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461241  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  43.66 
 
 
305 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0090  ABC transporter-like protein  34.8 
 
 
312 aa  154  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.101268 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  41.78 
 
 
316 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  35.58 
 
 
313 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  35.58 
 
 
313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  41.18 
 
 
318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  31.56 
 
 
307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3232  ABC transporter related  30.85 
 
 
311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.479641  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  39.91 
 
 
310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0007  ABC transporter related  36.52 
 
 
435 aa  153  4e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  32.77 
 
 
310 aa  152  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  41.18 
 
 
318 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.09 
 
 
320 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  41.18 
 
 
318 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  39.44 
 
 
310 aa  152  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2142  ABC-type transport system, ATPase component  39.06 
 
 
247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0133824  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3975  ABC transporter related  45.33 
 
 
312 aa  152  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.138186  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.26 
 
 
301 aa  152  7e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  39.81 
 
 
341 aa  152  7e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  41.51 
 
 
315 aa  152  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  34.14 
 
 
310 aa  152  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  39.25 
 
 
322 aa  152  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  31.54 
 
 
308 aa  152  8.999999999999999e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1501  ABC transporter, ATP-binding protein  39.64 
 
 
303 aa  151  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.505204  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
331 aa  151  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  40.38 
 
 
337 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.52 
 
 
312 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  38.24 
 
 
259 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2675  ABC transporter related  40.08 
 
 
247 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  34.38 
 
 
325 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.5 
 
 
321 aa  151  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  35.44 
 
 
260 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  35.48 
 
 
298 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1859  ABC transporter related  32.78 
 
 
307 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>