More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3975 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3975  ABC transporter related  100 
 
 		 312 aa  592  1e-168  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.138186  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0452  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 305 aa  240  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4447  ABC transporter related  47.4 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1854  ABC transporter related protein  45.1 
 
 		 303 aa  239  5e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0626891  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3788  ABC transporter related  46.23 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0603  ABC transporter-like protein  46.05 
 
 		 317 aa  235  8e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.858609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1133  ABC transporter related protein  44.85 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06880  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.09 
 
 		 307 aa  233  3e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0918509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4276  ABC transporter related protein  44.74 
 
 		 303 aa  232  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4168  ABC transporter related  45.57 
 
 		 318 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0977  ABC transporter related  44.04 
 
 		 328 aa  226  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0400236 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2235  ABC transporter related protein  39.87 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  44.34 
 
 		 305 aa  169  6e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  45.5 
 
 		 301 aa  169  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  37.26 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  38.54 
 
 		 310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  45.5 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  44.09 
 
 		 249 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  42.73 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.71 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  39.29 
 
 		 310 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  37.62 
 
 		 309 aa  159  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  41.13 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2644  ABC transporter related  41.91 
 
 		 334 aa  156  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3790  ABC transporter related  46.76 
 
 		 304 aa  156  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.021696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  42.35 
 
 		 297 aa  155  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  44.71 
 
 		 303 aa  155  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  42.33 
 
 		 253 aa  155  9e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  41.83 
 
 		 373 aa  154  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  40.45 
 
 		 250 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  41.47 
 
 		 318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  37.6 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  37.4 
 
 		 279 aa  153  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  36.7 
 
 		 310 aa  153  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  37.62 
 
 		 312 aa  152  5e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  37.93 
 
 		 306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  43.44 
 
 		 301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4170  ABC transporter related  45.33 
 
 		 304 aa  152  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720041  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  38.2 
 
 		 301 aa  152  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  35.65 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  41.94 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  40.99 
 
 		 303 aa  152  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  39.27 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3287  ABC transporter related protein  39.73 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  39.82 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  36.84 
 
 		 368 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  45.24 
 
 		 300 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  45.24 
 
 		 300 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  45.24 
 
 		 300 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  33.74 
 
 		 243 aa  149  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  33.66 
 
 		 313 aa  149  5e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  33.68 
 
 		 298 aa  149  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  35.29 
 
 		 302 aa  149  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  41.26 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  42.6 
 
 		 301 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  41.86 
 
 		 284 aa  149  6e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  30.48 
 
 		 336 aa  149  6e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  40.27 
 
 		 310 aa  149  6e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  39.82 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  33.66 
 
 		 313 aa  149  7e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  38.97 
 
 		 316 aa  148  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  33.66 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1021  ABC transporter related  40.54 
 
 		 237 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00128788 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  41.33 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  39.07 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1044  ABC transporter related  40.93 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  35.13 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  35.14 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  33.12 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  42.92 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0454  ABC transporter related protein  40.85 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.815425  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  42.79 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  38.01 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1135  ABC transporter related protein  42.33 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  37.38 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  39.37 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  38.74 
 
 		 282 aa  147  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  42.2 
 
 		 299 aa  146  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0605  ABC transporter-like protein  43.33 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.547486  normal  0.781825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  32.69 
 
 		 315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  40.65 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0089  ABC transporter related  38.67 
 
 		 237 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  43.14 
 
 		 316 aa  146  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2142  ABC-type transport system, ATPase component  41.2 
 
 		 247 aa  146  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0133824  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  39.13 
 
 		 308 aa  146  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  37.01 
 
 		 346 aa  146  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  40.65 
 
 		 250 aa  146  5e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  36.69 
 
 		 306 aa  146  5e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1642  ABC transporter related protein  37.7 
 
 		 323 aa  146  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  38.89 
 
 		 318 aa  145  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  33.92 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  39.53 
 
 		 308 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  40.91 
 
 		 332 aa  145  8.000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  36.28 
 
 		 307 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1767  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  36.28 
 
 		 255 aa  145  9e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  38.3 
 
 		 300 aa  145  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  41.03 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0737  ABC transporter related  34.73 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0135458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>