More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3788 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3788  ABC transporter related  100 
 
 		 318 aa  634    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4168  ABC transporter related  94.34 
 
 		 318 aa  601  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0603  ABC transporter-like protein  69.02 
 
 		 317 aa  421  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.858609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1133  ABC transporter related protein  67.33 
 
 		 304 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0977  ABC transporter related  68.12 
 
 		 328 aa  415  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0400236 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4276  ABC transporter related protein  65.78 
 
 		 303 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0452  ABC transporter related protein  63.82 
 
 		 305 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4447  ABC transporter related  63.51 
 
 		 303 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1854  ABC transporter related protein  62.33 
 
 		 303 aa  375  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0626891  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06880  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.28 
 
 		 307 aa  353  2.9999999999999997e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0918509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3975  ABC transporter related  46.23 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.138186  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2235  ABC transporter related protein  42 
 
 		 334 aa  215  9e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  35.6 
 
 		 310 aa  159  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  31.02 
 
 		 327 aa  159  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  43.89 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  36.45 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  36.88 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  34.59 
 
 		 335 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  40.67 
 
 		 303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  30.1 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  36.99 
 
 		 303 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  34 
 
 		 299 aa  151  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.79 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  32.01 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  36.48 
 
 		 297 aa  150  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  36.33 
 
 		 741 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  31.68 
 
 		 313 aa  149  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  35.31 
 
 		 457 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  34.54 
 
 		 307 aa  149  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  35.29 
 
 		 308 aa  149  9e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  35.41 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  34.11 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  31.35 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.98 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.55 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  41.06 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3790  ABC transporter related  43.28 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.021696  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  39.17 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  28.76 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  38.05 
 
 		 230 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  41.44 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  37.76 
 
 		 317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  35.69 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  35.69 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  31.58 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  35.69 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  39.07 
 
 		 250 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  38.44 
 
 		 330 aa  146  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  34.86 
 
 		 235 aa  145  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  35.38 
 
 		 316 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  39.81 
 
 		 339 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  30.99 
 
 		 336 aa  144  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  37.56 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  35.78 
 
 		 305 aa  145  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  40.28 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.43 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  32.03 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  30.46 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  32.9 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  34.85 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  35.74 
 
 		 306 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0605  ABC transporter-like protein  36.99 
 
 		 308 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.547486  normal  0.781825 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4170  ABC transporter related  41.79 
 
 		 304 aa  143  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720041  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  32.89 
 
 		 332 aa  144  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  37.16 
 
 		 282 aa  144  3e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  33.97 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  28.62 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.07 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  35.6 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  33 
 
 		 319 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  33.94 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  40.1 
 
 		 308 aa  143  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  38.76 
 
 		 284 aa  142  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  37.74 
 
 		 318 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  38.14 
 
 		 306 aa  142  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.98 
 
 		 368 aa  142  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  36.48 
 
 		 311 aa  142  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  30.23 
 
 		 309 aa  142  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  30.23 
 
 		 309 aa  142  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  33.55 
 
 		 300 aa  142  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0975  ABC transporter related  40.65 
 
 		 391 aa  142  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  27.6 
 
 		 308 aa  142  9e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  38.1 
 
 		 314 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  37.99 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06860  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.13 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  36.82 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.38 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  37.4 
 
 		 337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  40.38 
 
 		 368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  39.34 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  34.32 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  30.79 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  32.73 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  39.91 
 
 		 318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  38.57 
 
 		 240 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  35.06 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.29 
 
 		 247 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  40.78 
 
 		 242 aa  140  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.16 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  36.02 
 
 		 303 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>