More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4447 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4447  ABC transporter related  100 
 
 		 303 aa  610  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4276  ABC transporter related protein  71.33 
 
 		 303 aa  435  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0452  ABC transporter related protein  67.55 
 
 		 305 aa  428  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0603  ABC transporter-like protein  69 
 
 		 317 aa  424  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.858609 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1854  ABC transporter related protein  70.43 
 
 		 303 aa  424  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0626891  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1133  ABC transporter related protein  65.23 
 
 		 304 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4168  ABC transporter related  64.86 
 
 		 318 aa  397  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3788  ABC transporter related  63.51 
 
 		 318 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0977  ABC transporter related  62.38 
 
 		 328 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0400236 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06880  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.48 
 
 		 307 aa  355  3.9999999999999996e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0918509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3975  ABC transporter related  45.57 
 
 		 312 aa  236  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.138186  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2235  ABC transporter related protein  39.93 
 
 		 334 aa  205  9e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  36.88 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1767  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  38.57 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  36.27 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  29.04 
 
 		 300 aa  155  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  38.36 
 
 		 303 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  30.72 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  39.81 
 
 		 308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  37.16 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  37.09 
 
 		 326 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  29.55 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  41.28 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  29.37 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  37.73 
 
 		 259 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1135  ABC transporter related protein  41.87 
 
 		 301 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  37.44 
 
 		 337 aa  149  7e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  29.87 
 
 		 299 aa  149  7e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  29.22 
 
 		 313 aa  148  9e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  32.56 
 
 		 457 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3790  ABC transporter related  42.5 
 
 		 304 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.021696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  36 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.33 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  33.44 
 
 		 315 aa  146  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  28.9 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1501  ABC transporter, ATP-binding protein  36.49 
 
 		 303 aa  146  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.505204  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  38.53 
 
 		 305 aa  146  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  37.79 
 
 		 250 aa  146  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  33.78 
 
 		 336 aa  145  6e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  37.73 
 
 		 259 aa  145  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  38.99 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.73 
 
 		 305 aa  145  9e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  34.88 
 
 		 318 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  36.54 
 
 		 230 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  36.87 
 
 		 318 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  30.97 
 
 		 305 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  35.92 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  31.27 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0605  ABC transporter-like protein  39.02 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.547486  normal  0.781825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  36.48 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  36.96 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  27.48 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4170  ABC transporter related  41 
 
 		 304 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720041  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  35.08 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  35.48 
 
 		 318 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  34.42 
 
 		 235 aa  143  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  35.51 
 
 		 340 aa  142  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0878  ABC transporter, ATP-binding protein  31.67 
 
 		 266 aa  142  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  33.99 
 
 		 317 aa  142  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2017  ABC transporter related  35.39 
 
 		 273 aa  143  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375544  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1955  ABC transporter, ATP-binding protein  31.78 
 
 		 282 aa  142  6e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  35.58 
 
 		 306 aa  142  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1526  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.21 
 
 		 330 aa  142  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00601366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  34.67 
 
 		 245 aa  142  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  31.82 
 
 		 315 aa  142  7e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  28.67 
 
 		 311 aa  142  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  33.11 
 
 		 301 aa  142  9e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  27.09 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0975  ABC transporter related  41.12 
 
 		 391 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  35.2 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  34.43 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  38.25 
 
 		 318 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  37.09 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  31.06 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  35.05 
 
 		 338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  36.06 
 
 		 301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  36.07 
 
 		 339 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  37.91 
 
 		 238 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.99 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  35.48 
 
 		 330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.38 
 
 		 295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3735  ABC transporter related protein  41.9 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.284021  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  35.78 
 
 		 344 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  36.79 
 
 		 741 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  33.33 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  33.18 
 
 		 303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  40.58 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  35.5 
 
 		 298 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0418  ABC transporter related  36.62 
 
 		 307 aa  139  4.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.987895 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4278  ABC transporter related protein  41.71 
 
 		 356 aa  139  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.786562  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  35.05 
 
 		 339 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.56 
 
 		 324 aa  139  7.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  33.02 
 
 		 308 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  30.16 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0276  ABC transporter related protein  41.04 
 
 		 344 aa  138  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1446  ABC transporter related  38.18 
 
 		 248 aa  138  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1062  ABC transporter-like protein protein  37.27 
 
 		 326 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.124744  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  34.07 
 
 		 311 aa  138  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  26.49 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>