More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3735 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3735  ABC transporter related protein  100 
 
 		 279 aa  558  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.284021  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0418  ABC transporter related  49.83 
 
 		 307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.987895 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3121  ABC transporter related protein  50.97 
 
 		 350 aa  247  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.268925  hitchhiker  0.0000642962 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0552  ABC transporter related  50 
 
 		 320 aa  228  6e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.652365 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0276  ABC transporter related protein  57.46 
 
 		 344 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0690  ABC transporter related  43.85 
 
 		 319 aa  209  5e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02620  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.98 
 
 		 337 aa  203  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  43.05 
 
 		 306 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28400  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.51 
 
 		 375 aa  185  9e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  45.59 
 
 		 319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  38.08 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  46.38 
 
 		 311 aa  182  7e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  46.34 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  43.41 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  44.61 
 
 		 328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  42.32 
 
 		 317 aa  172  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0872  ABC transporter related  40.28 
 
 		 316 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  40.98 
 
 		 321 aa  169  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  41.46 
 
 		 244 aa  166  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  43.14 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1168  ABC transporter related  34.01 
 
 		 335 aa  163  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2963  ABC transporter-like  38.86 
 
 		 316 aa  163  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.23893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  34.22 
 
 		 308 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  39.81 
 
 		 310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0452  ABC transporter related protein  40.48 
 
 		 305 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3013  ABC transporter related protein  43.48 
 
 		 360 aa  160  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978748  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2246  ABC transporter related  37.91 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2298  ABC transporter related  37.91 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00283386  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  40.2 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  40 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3515  ABC transporter related  33.89 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1671  ABC transporter related  35.1 
 
 		 316 aa  155  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  35.75 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  38.05 
 
 		 244 aa  153  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  39.02 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  39.02 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4276  ABC transporter related protein  43.63 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  39.02 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  38.05 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  38.54 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  35.09 
 
 		 243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  38.35 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  39.02 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4447  ABC transporter related  41.9 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  39.22 
 
 		 301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  38.54 
 
 		 244 aa  152  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  38.54 
 
 		 244 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  33.98 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  38.05 
 
 		 244 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  38.57 
 
 		 326 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  38.35 
 
 		 306 aa  152  8e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06880  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.06 
 
 		 307 aa  151  8.999999999999999e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0918509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  44.88 
 
 		 238 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  34.63 
 
 		 243 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  37.56 
 
 		 244 aa  151  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  41.51 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  38.54 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  40.67 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1746  ABC transporter-related protein  39.41 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  38.1 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  38.24 
 
 		 306 aa  149  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  39.32 
 
 		 309 aa  149  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  39.32 
 
 		 337 aa  149  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  39.72 
 
 		 335 aa  149  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  37.61 
 
 		 323 aa  149  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  39.62 
 
 		 327 aa  149  7e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0603  ABC transporter-like protein  42.16 
 
 		 317 aa  148  9e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.858609 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  38.24 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0053  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.14 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1675  ABC transporter related  43.14 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  39.32 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  39.52 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2447  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  40.61 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.436893  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  33.33 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  40.49 
 
 		 318 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  37.86 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  34.47 
 
 		 305 aa  146  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  37.86 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  33 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  31.35 
 
 		 305 aa  146  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  35.96 
 
 		 315 aa  146  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  39.34 
 
 		 313 aa  146  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  32.87 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  38.46 
 
 		 310 aa  145  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  39.51 
 
 		 292 aa  145  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  38.46 
 
 		 310 aa  145  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1840  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.48 
 
 		 322 aa  145  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.76 
 
 		 322 aa  145  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  38.76 
 
 		 296 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1854  ABC transporter related protein  43.28 
 
 		 303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0626891  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0914  ABC transporter related  37.75 
 
 		 290 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  38.24 
 
 		 311 aa  145  8.000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1805  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.5 
 
 		 307 aa  145  8.000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00130612  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  41.23 
 
 		 912 aa  145  9e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  36.36 
 
 		 320 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.41 
 
 		 331 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  36.89 
 
 		 323 aa  144  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  37.68 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  39.71 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  39.57 
 
 		 326 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>