More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4168 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4168  ABC transporter related  100 
 
 		 318 aa  632  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3788  ABC transporter related  94.34 
 
 		 318 aa  601  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0603  ABC transporter-like protein  69.02 
 
 		 317 aa  422  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.858609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1133  ABC transporter related protein  67.33 
 
 		 304 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0977  ABC transporter related  68.12 
 
 		 328 aa  418  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0400236 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4276  ABC transporter related protein  65.78 
 
 		 303 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4447  ABC transporter related  64.86 
 
 		 303 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0452  ABC transporter related protein  63.16 
 
 		 305 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1854  ABC transporter related protein  64 
 
 		 303 aa  386  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0626891  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06880  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  60.26 
 
 		 307 aa  365  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0918509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3975  ABC transporter related  45.28 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.138186  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2235  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 334 aa  217  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  37.75 
 
 		 311 aa  161  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  31.35 
 
 		 327 aa  158  9e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  43.58 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  34.46 
 
 		 335 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  36.18 
 
 		 457 aa  155  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  41.63 
 
 		 303 aa  155  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  39.42 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  35.37 
 
 		 312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  40.76 
 
 		 339 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.21 
 
 		 339 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3790  ABC transporter related  43.78 
 
 		 304 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.021696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  38.44 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  38.53 
 
 		 282 aa  151  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  38.54 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  33.86 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  43 
 
 		 741 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  40.09 
 
 		 250 aa  150  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  34.2 
 
 		 332 aa  149  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  30.43 
 
 		 300 aa  149  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.69 
 
 		 333 aa  149  5e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.29 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  33.66 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.54 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4170  ABC transporter related  37.5 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720041  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  35.88 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  39.91 
 
 		 337 aa  148  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  36.36 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  38.2 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.49 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  30.32 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  37.74 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  34.64 
 
 		 307 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  32.01 
 
 		 313 aa  146  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  41.15 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0605  ABC transporter-like protein  40.09 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.547486  normal  0.781825 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  40.67 
 
 		 253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  34.58 
 
 		 319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  37.04 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  30.32 
 
 		 309 aa  146  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  35.71 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  34.93 
 
 		 306 aa  146  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  35.71 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  35.71 
 
 		 300 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  31.35 
 
 		 313 aa  146  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  29.08 
 
 		 309 aa  146  5e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  35.42 
 
 		 326 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  41.55 
 
 		 308 aa  145  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  42.72 
 
 		 340 aa  145  6e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  30.79 
 
 		 310 aa  145  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  36.92 
 
 		 303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.64 
 
 		 368 aa  145  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  41.28 
 
 		 303 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  39.62 
 
 		 339 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  39.62 
 
 		 339 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06860  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.82 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  27.97 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  35.75 
 
 		 316 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  34.86 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  38.43 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  31.02 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.01 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.53 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  37.56 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  36.97 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  33.22 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  39.81 
 
 		 300 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  35.13 
 
 		 311 aa  143  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  27.6 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  40.38 
 
 		 368 aa  142  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  30.58 
 
 		 305 aa  142  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3735  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.09 
 
 		 446 aa  142  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  33 
 
 		 309 aa  142  7e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  29.14 
 
 		 312 aa  142  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  39.53 
 
 		 316 aa  142  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  31.07 
 
 		 309 aa  142  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  36.99 
 
 		 300 aa  142  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.18 
 
 		 329 aa  142  8e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2963  ABC transporter-like  30.87 
 
 		 316 aa  142  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.23893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.44 
 
 		 339 aa  142  9e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  31.37 
 
 		 315 aa  142  9e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  40.29 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  30.67 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  29.7 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  31.1 
 
 		 308 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  40.78 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  39.05 
 
 		 240 aa  141  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  33.77 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>