More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0603 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0603  ABC transporter-like protein  100 
 
 
317 aa  640    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.858609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1133  ABC transporter related protein  79.47 
 
 
304 aa  498  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4276  ABC transporter related protein  72.76 
 
 
303 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4447  ABC transporter related  69 
 
 
303 aa  425  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0452  ABC transporter related protein  68.44 
 
 
305 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4168  ABC transporter related  69.02 
 
 
318 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3788  ABC transporter related  66.88 
 
 
318 aa  422  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352086  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1854  ABC transporter related protein  68.56 
 
 
303 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0626891  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0977  ABC transporter related  64.26 
 
 
328 aa  392  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0400236 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06880  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.42 
 
 
307 aa  352  5e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0918509  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3975  ABC transporter related  46.05 
 
 
312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.138186  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2235  ABC transporter related protein  41 
 
 
334 aa  205  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461241  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  39.34 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  38.1 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  33.86 
 
 
315 aa  163  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  33.77 
 
 
299 aa  163  4.0000000000000004e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.25 
 
 
305 aa  162  6e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  35.95 
 
 
457 aa  162  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  34.09 
 
 
335 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  35.6 
 
 
308 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  31.56 
 
 
300 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  40.18 
 
 
303 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  37.09 
 
 
310 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  34.49 
 
 
317 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.48 
 
 
368 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  32.14 
 
 
313 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  35.29 
 
 
311 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  39.46 
 
 
741 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  31.05 
 
 
313 aa  157  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  36.07 
 
 
318 aa  157  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  33.77 
 
 
305 aa  156  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  31.05 
 
 
313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1767  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 
255 aa  155  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  30.29 
 
 
311 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  33.88 
 
 
314 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  38.81 
 
 
308 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  37.44 
 
 
282 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  36.42 
 
 
300 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  41.74 
 
 
253 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  38.18 
 
 
300 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.66 
 
 
317 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  36.18 
 
 
373 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  36.42 
 
 
298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  29.22 
 
 
312 aa  153  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  32.45 
 
 
305 aa  153  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  38.46 
 
 
300 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  31.39 
 
 
300 aa  153  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  33.54 
 
 
307 aa  153  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  31.29 
 
 
308 aa  152  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  33.77 
 
 
302 aa  153  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  34.53 
 
 
256 aa  152  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3790  ABC transporter related  44.28 
 
 
304 aa  153  5e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.021696  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  43.12 
 
 
332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.27 
 
 
305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  38.39 
 
 
230 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  35.53 
 
 
306 aa  152  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  41.2 
 
 
250 aa  152  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  29.22 
 
 
312 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  29.22 
 
 
312 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  29.22 
 
 
312 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  34.55 
 
 
305 aa  151  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  29.22 
 
 
312 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  29.22 
 
 
312 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  29.22 
 
 
312 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  29.22 
 
 
312 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4068  ABC transporter related  36.17 
 
 
325 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  29.22 
 
 
312 aa  151  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  30.03 
 
 
327 aa  151  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  38.18 
 
 
259 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  35.08 
 
 
316 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  37.78 
 
 
303 aa  151  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  33.63 
 
 
310 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  34.65 
 
 
309 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  28.99 
 
 
312 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  35.88 
 
 
304 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  39.69 
 
 
326 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  33.02 
 
 
311 aa  150  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  34.32 
 
 
318 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.61 
 
 
339 aa  150  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  38.5 
 
 
305 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  32.89 
 
 
319 aa  150  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  34.23 
 
 
258 aa  150  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  32.91 
 
 
316 aa  149  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  33.23 
 
 
311 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  34.41 
 
 
315 aa  149  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.66 
 
 
324 aa  149  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  38.81 
 
 
314 aa  149  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  35.62 
 
 
235 aa  149  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.44 
 
 
307 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  31.95 
 
 
309 aa  149  6e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  31.66 
 
 
330 aa  149  7e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  32.48 
 
 
309 aa  149  7e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1135  ABC transporter related protein  40.28 
 
 
301 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.75 
 
 
331 aa  149  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4170  ABC transporter related  42.79 
 
 
304 aa  149  8e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720041  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  31.75 
 
 
331 aa  149  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  31.75 
 
 
303 aa  148  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  39.44 
 
 
318 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0418  ABC transporter related  38.86 
 
 
307 aa  148  9e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.987895 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  36.49 
 
 
242 aa  148  9e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>