More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0452 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0452  ABC transporter related protein  100 
 
 
305 aa  621  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4447  ABC transporter related  67.55 
 
 
303 aa  428  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4276  ABC transporter related protein  67 
 
 
303 aa  425  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0603  ABC transporter-like protein  68.44 
 
 
317 aa  422  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.858609 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1854  ABC transporter related protein  69.97 
 
 
303 aa  420  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0626891  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1133  ABC transporter related protein  66.33 
 
 
304 aa  420  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4168  ABC transporter related  63.16 
 
 
318 aa  387  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3788  ABC transporter related  63.82 
 
 
318 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352086  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06880  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  59.87 
 
 
307 aa  370  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0918509  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0977  ABC transporter related  60.73 
 
 
328 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0400236 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3975  ABC transporter related  44.81 
 
 
312 aa  229  6e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.138186  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2235  ABC transporter related protein  38.59 
 
 
334 aa  199  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461241  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  35.67 
 
 
303 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  41.12 
 
 
741 aa  159  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0605  ABC transporter-like protein  35.55 
 
 
308 aa  158  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.547486  normal  0.781825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  38.81 
 
 
259 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.89 
 
 
305 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  36.39 
 
 
308 aa  155  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  36.7 
 
 
311 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  38.86 
 
 
326 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  33.22 
 
 
314 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  33.56 
 
 
319 aa  153  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  34.94 
 
 
305 aa  152  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0607  ABC transporter related  40.53 
 
 
347 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000713126 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  33.01 
 
 
311 aa  152  7e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  30.52 
 
 
313 aa  152  8e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1767  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  38.1 
 
 
255 aa  151  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  30.19 
 
 
313 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  37.67 
 
 
300 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1955  ABC transporter, ATP-binding protein  35.85 
 
 
282 aa  150  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.94 
 
 
305 aa  151  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3735  ABC transporter related protein  40.48 
 
 
279 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.284021  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  38.71 
 
 
301 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  30.19 
 
 
313 aa  150  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  35.29 
 
 
303 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  38.79 
 
 
303 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  39.81 
 
 
230 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  33.12 
 
 
317 aa  149  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  36.97 
 
 
316 aa  149  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  34.88 
 
 
305 aa  149  6e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  32.89 
 
 
310 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  29.32 
 
 
309 aa  149  7e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  34.24 
 
 
335 aa  149  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  36.44 
 
 
305 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  40.37 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  35.6 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  34.09 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  30.48 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  43.78 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1135  ABC transporter related protein  38.39 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  32.57 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  36.53 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  36.06 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  31.89 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.64 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0454  ABC transporter related protein  38.21 
 
 
316 aa  146  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.815425  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  31.99 
 
 
346 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  36.71 
 
 
299 aa  146  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.5 
 
 
368 aa  146  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  29.37 
 
 
300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  35.84 
 
 
314 aa  146  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  39.82 
 
 
332 aa  146  5e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  36.33 
 
 
300 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  36.33 
 
 
300 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  36.33 
 
 
300 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  33.01 
 
 
303 aa  146  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  32.79 
 
 
300 aa  145  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  39.81 
 
 
318 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  36.73 
 
 
457 aa  145  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  38.68 
 
 
253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  35.87 
 
 
282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  41.01 
 
 
318 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  39.44 
 
 
250 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  37.61 
 
 
303 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  31.53 
 
 
315 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.79 
 
 
295 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3790  ABC transporter related  40.09 
 
 
304 aa  144  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.021696  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  38.03 
 
 
307 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  35.74 
 
 
309 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  41.28 
 
 
318 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.85 
 
 
307 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0386  ABC transporter related  38.4 
 
 
322 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  37.25 
 
 
298 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  41.23 
 
 
303 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  30.29 
 
 
312 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  35.02 
 
 
311 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  38.65 
 
 
300 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0121  ABC transporter related  37.44 
 
 
270 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.85 
 
 
324 aa  143  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  37.38 
 
 
326 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  38.6 
 
 
339 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  33.33 
 
 
315 aa  144  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  30.56 
 
 
310 aa  143  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  29.97 
 
 
312 aa  143  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  29.77 
 
 
312 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  29.77 
 
 
312 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  32.89 
 
 
319 aa  143  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  29.97 
 
 
312 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  30.08 
 
 
315 aa  143  4e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  33.45 
 
 
313 aa  143  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>