More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1207 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1207  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 248 aa  497  1e-140  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000846866  hitchhiker  0.00000000000000291696 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4248  type II and III secretion system protein  41.62 
 
 		 454 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.218711 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  41.62 
 
 		 454 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.970058 
 
 
-
 
NC_003296  RS02594  outer membrane channel signal peptide protein  40.66 
 
 		 454 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  34.07 
 
 		 492 aa  115  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  36.75 
 
 		 457 aa  115  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4391  type II and III secretion system protein  38.41 
 
 		 416 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.260079  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4851  bacterial type II/III secretion system protein  38.32 
 
 		 419 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2321  type II and III secretion system protein  40.36 
 
 		 452 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0601  type II/III secretion system protein  31.36 
 
 		 439 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.570142  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0685  type II and III secretion system protein  31.36 
 
 		 423 aa  109  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0794  type II and III secretion system protein  39.52 
 
 		 622 aa  107  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  37.5 
 
 		 469 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  29.55 
 
 		 493 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  38.1 
 
 		 473 aa  106  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1732  type II and III secretion system protein  37.13 
 
 		 443 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793195  hitchhiker  0.00000430206 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  37.13 
 
 		 461 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  38.27 
 
 		 483 aa  105  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  38.82 
 
 		 460 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  38.82 
 
 		 460 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0251  fimbrial assembly protein pilQ precursor  35.37 
 
 		 699 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215469  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  32.03 
 
 		 420 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  32.03 
 
 		 420 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  33.33 
 
 		 507 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  37.65 
 
 		 460 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  31.74 
 
 		 420 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0848  type II and III secretion system protein  34.15 
 
 		 419 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  36.84 
 
 		 578 aa  102  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  35.16 
 
 		 441 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0648  type II and III secretion system protein  34.76 
 
 		 422 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  34.5 
 
 		 468 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2310  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 443 aa  101  9e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  34.62 
 
 		 441 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  34.62 
 
 		 432 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  34.62 
 
 		 441 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  34.62 
 
 		 441 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  34.62 
 
 		 432 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  34.5 
 
 		 454 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  34.62 
 
 		 432 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  34.62 
 
 		 441 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2759  type IV pilus secretin PilQ  35.88 
 
 		 694 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 484 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  29.26 
 
 		 689 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  35.47 
 
 		 443 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4871  putative type II secretion system protein  35.37 
 
 		 408 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0665602  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  35.47 
 
 		 443 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  34.13 
 
 		 444 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55920  putative type II secretion system protein  35.37 
 
 		 416 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  35.47 
 
 		 443 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0667  type II and III secretion system protein  26.48 
 
 		 478 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703933  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2134  type IV pilus biogenesis protein PilQ  33.72 
 
 		 874 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000140204  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  34.88 
 
 		 729 aa  100  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  32.73 
 
 		 477 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  35.29 
 
 		 526 aa  99.4  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0895  type II and III secretion system protein  27.35 
 
 		 475 aa  99.4  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276547  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0306  type II and III secretion system protein  28.87 
 
 		 463 aa  99.4  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1265  type II and III secretion system protein  36.42 
 
 		 1519 aa  99.4  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00244048  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  32.04 
 
 		 706 aa  99  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  29.91 
 
 		 482 aa  99  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  29.91 
 
 		 482 aa  99  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  29.91 
 
 		 482 aa  99  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  29.91 
 
 		 482 aa  99  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  35.26 
 
 		 443 aa  99  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  29.91 
 
 		 482 aa  99  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  29.91 
 
 		 482 aa  99  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  32.73 
 
 		 464 aa  99  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  33.93 
 
 		 482 aa  98.6  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  33.13 
 
 		 466 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  35.2 
 
 		 887 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  33.13 
 
 		 530 aa  97.8  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  29.91 
 
 		 492 aa  98.2  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  35.2 
 
 		 882 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  31.67 
 
 		 682 aa  97.8  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  35.2 
 
 		 887 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0645  type II and III secretion system protein  33.33 
 
 		 436 aa  97.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  31.36 
 
 		 698 aa  97.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  31.36 
 
 		 698 aa  97.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0246  type II and III secretion system protein  31.55 
 
 		 714 aa  97.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  32.6 
 
 		 479 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  33.91 
 
 		 517 aa  97.1  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2042  type II and III secretion system protein  26.98 
 
 		 474 aa  97.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5777  type 4 fimbrial biogenesis protein PilQ  32.63 
 
 		 714 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  31.67 
 
 		 547 aa  97.1  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0690  type IV pilus secretin PilQ  34.52 
 
 		 893 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66620  type 4 fimbrial biogenesis outer membrane protein PilQ precursor  32.63 
 
 		 710 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.601921  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  33.82 
 
 		 718 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  33.82 
 
 		 718 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  27.71 
 
 		 496 aa  95.9  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4118  type II and III secretion system protein  28.26 
 
 		 393 aa  95.5  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000089242 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  29.57 
 
 		 422 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0749  type II and III secretion system protein  32.75 
 
 		 436 aa  95.5  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  36.47 
 
 		 692 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  32.75 
 
 		 682 aa  95.1  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0838  type IV pilus secretin PilQ  34.5 
 
 		 711 aa  94.7  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.673072  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  31.11 
 
 		 685 aa  95.1  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  33.13 
 
 		 704 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  30.56 
 
 		 683 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2687  peptidase M41, FtsH  32.35 
 
 		 727 aa  94  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00137304  normal  0.0272245 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  30.56 
 
 		 683 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  30.56 
 
 		 684 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>