168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1673 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1673  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 		 337 aa  691    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0340  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  52.96 
 
 		 344 aa  345  8.999999999999999e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1206  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  46.73 
 
 		 341 aa  299  5e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2960  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family/ornithine cyclodeaminase family protein  48.01 
 
 		 707 aa  288  9e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.76325  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2745  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit:ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  46.59 
 
 		 685 aa  285  7e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278132  normal  0.0380808 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1883  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  47.9 
 
 		 341 aa  278  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.224909  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3075  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  45.05 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1864  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  40.58 
 
 		 332 aa  199  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0367  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.3 
 
 		 333 aa  192  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0432436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3876  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  38.05 
 
 		 335 aa  170  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1858  ornithine cyclodeaminase  49.58 
 
 		 394 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.161292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0589  ornithine cyclodeaminase  30.21 
 
 		 337 aa  116  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0104  ornithine cyclodeaminase  30.04 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0246437  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0108  ornithine cyclodeaminase  30.04 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00211883  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6949  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.04 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00875  ornithine cyclodeaminase protein  27.44 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0180159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  28.73 
 
 		 325 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  28.42 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  29.62 
 
 		 325 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  28.07 
 
 		 325 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  27.27 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4593  ornithine cyclodeaminase  25.42 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  28 
 
 		 325 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  27.06 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1116  ornithine cyclodeaminase  27.38 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00262553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  26.63 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  27.05 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  25.16 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  27.43 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  27.43 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  34.71 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  23.53 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3998  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.46 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  25.5 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  28.9 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  25.55 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1826  ornithine cyclodeaminase  32.95 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0818246  normal  0.659466 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  26.54 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3168  ornithine cyclodeaminase  27.84 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  33.81 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3763  ornithine cyclodeaminase  36.28 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  24.53 
 
 		 326 aa  67  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  28.72 
 
 		 358 aa  67  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1840  ornithine cyclodeaminase  25.84 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  26.15 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1216  ornithine cyclodeaminase  35.25 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1184  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.05 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0433932  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  28.21 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  25.19 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3083  ornithine cyclodeaminase  28.3 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  25.1 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.17 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  23.95 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0461  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3516  ornithine cyclodeaminase  37.07 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.283604 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  33.57 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  24.71 
 
 		 333 aa  62.4  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5200  ornithine cyclodeaminase  25.18 
 
 		 337 aa  62  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.65234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  24.71 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  22.22 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  41.56 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  29.46 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2310  ornithine cyclodeaminase  31.65 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  24.33 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4262  ornithine cyclodeaminase  28.63 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  26.12 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  26.52 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00361  ornithine cyclodeaminase  28.95 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4333  ornithine cyclodeaminase  31.82 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  25.16 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  21.94 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  31.21 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  29.59 
 
 		 346 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  28.15 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1795  ornithine cyclodeaminase  30.82 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.419928  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1590  ornithine cyclodeaminase  32.38 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.84 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.5 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  24.32 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  23.57 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  30.94 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0244  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.89 
 
 		 304 aa  55.8  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0626622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  30.26 
 
 		 354 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.43 
 
 		 323 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  24.26 
 
 		 365 aa  53.5  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  24.75 
 
 		 318 aa  53.1  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  23.19 
 
 		 323 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1243  hypothetical protein  27.24 
 
 		 315 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  22.3 
 
 		 318 aa  53.1  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.36 
 
 		 346 aa  52.8  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3754  ornithine cyclodeaminase mu-crystallin  24.21 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00106555  normal  0.298115 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  21.24 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  30.18 
 
 		 348 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  24.35 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  24.03 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0976  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  22.03 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.888301  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  23.05 
 
 		 323 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  37.84 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3431  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.54 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.893267 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  30.22 
 
 		 350 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>