261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0104 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0104  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 
336 aa  701    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0246437  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0108  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 
336 aa  701    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00211883  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00875  ornithine cyclodeaminase protein  58.61 
 
 
340 aa  420  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0180159  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0589  ornithine cyclodeaminase  56.25 
 
 
337 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6949  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  53.01 
 
 
336 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1116  ornithine cyclodeaminase  54.52 
 
 
355 aa  361  9e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00262553  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  30.27 
 
 
326 aa  151  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  30.38 
 
 
320 aa  149  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3763  ornithine cyclodeaminase  27.37 
 
 
383 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249055  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4593  ornithine cyclodeaminase  27.45 
 
 
373 aa  146  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  30.03 
 
 
330 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  29.81 
 
 
326 aa  142  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  27.85 
 
 
329 aa  142  8e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  29.64 
 
 
324 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1590  ornithine cyclodeaminase  26.36 
 
 
379 aa  139  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  27.8 
 
 
338 aa  139  8.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3168  ornithine cyclodeaminase  27.42 
 
 
411 aa  136  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  30.69 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3516  ornithine cyclodeaminase  27.56 
 
 
379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.283604 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  30.88 
 
 
325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2974  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.97 
 
 
334 aa  133  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1840  ornithine cyclodeaminase  26.15 
 
 
379 aa  132  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  26.11 
 
 
331 aa  132  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0461  ornithine cyclodeaminase  26.27 
 
 
382 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  31.77 
 
 
319 aa  129  6e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  30.51 
 
 
325 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  30.1 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2960  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family/ornithine cyclodeaminase family protein  30.46 
 
 
707 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.76325  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  30.54 
 
 
319 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  30.77 
 
 
329 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  29.45 
 
 
325 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2745  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit:ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.16 
 
 
685 aa  125  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278132  normal  0.0380808 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  30.45 
 
 
325 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  29.78 
 
 
325 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  30.61 
 
 
325 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  30.61 
 
 
325 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1206  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.1 
 
 
341 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  26.5 
 
 
329 aa  123  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  27.15 
 
 
316 aa  123  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1864  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.97 
 
 
332 aa  122  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  28.9 
 
 
325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  27.44 
 
 
331 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  28.16 
 
 
325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0367  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.63 
 
 
333 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0432436 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  28.03 
 
 
302 aa  119  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0340  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.68 
 
 
344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1163  ornithine cyclodeaminase  26.39 
 
 
341 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371691  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  24.79 
 
 
351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1673  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.04 
 
 
337 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5200  ornithine cyclodeaminase  27.99 
 
 
337 aa  113  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.65234  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1184  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  22.38 
 
 
334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0433932  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  27.76 
 
 
340 aa  110  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  27.24 
 
 
359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  24.44 
 
 
345 aa  107  4e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  29.24 
 
 
316 aa  106  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3876  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.91 
 
 
335 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0804038  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3075  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.73 
 
 
344 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  24.84 
 
 
329 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  23.65 
 
 
328 aa  102  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  26.32 
 
 
318 aa  102  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3998  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.34 
 
 
321 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  24.93 
 
 
332 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  24.24 
 
 
328 aa  100  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  25.91 
 
 
323 aa  97.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  27.56 
 
 
350 aa  97.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  25 
 
 
342 aa  96.7  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1883  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.44 
 
 
341 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.224909  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4262  ornithine cyclodeaminase  26.94 
 
 
335 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  24.32 
 
 
328 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  24.53 
 
 
326 aa  94  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  25.3 
 
 
323 aa  93.2  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1795  ornithine cyclodeaminase  27.41 
 
 
366 aa  93.6  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.419928  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  26.34 
 
 
324 aa  93.2  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  25.49 
 
 
333 aa  93.2  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1386  ornithine cyclodeaminase  28.33 
 
 
320 aa  92.8  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.41 
 
 
328 aa  92.8  8e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  26.21 
 
 
338 aa  92.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  23.2 
 
 
324 aa  92  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  26.44 
 
 
353 aa  91.3  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  26.47 
 
 
315 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3083  ornithine cyclodeaminase  24.18 
 
 
344 aa  89.7  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  26.23 
 
 
315 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00361  ornithine cyclodeaminase  25.19 
 
 
349 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336374  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  24.62 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  25.45 
 
 
341 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  24.38 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  27.53 
 
 
365 aa  88.2  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  28.42 
 
 
340 aa  87.4  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  25 
 
 
318 aa  87.4  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  26.06 
 
 
318 aa  87.4  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  24.66 
 
 
336 aa  87  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  24.66 
 
 
336 aa  87  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  23.57 
 
 
313 aa  86.3  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  23.92 
 
 
314 aa  86.3  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  24.52 
 
 
348 aa  85.5  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  24.1 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  27.73 
 
 
330 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  23.57 
 
 
358 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  23.85 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  22.4 
 
 
320 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>