More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3660 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  100 
 
 
331 aa  662    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  71.75 
 
 
359 aa  503  1e-141  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  72.16 
 
 
351 aa  493  9.999999999999999e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  68.81 
 
 
329 aa  472  1e-132  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  69.42 
 
 
330 aa  455  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  63.77 
 
 
338 aa  413  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  55.91 
 
 
329 aa  328  6e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  49.54 
 
 
320 aa  289  5.0000000000000004e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  47.55 
 
 
319 aa  288  6e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  47.24 
 
 
319 aa  288  7e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  48.78 
 
 
326 aa  288  8e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  47.37 
 
 
326 aa  281  9e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  46.08 
 
 
324 aa  259  3e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  44.01 
 
 
324 aa  229  4e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  44.19 
 
 
313 aa  229  6e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  43.31 
 
 
311 aa  204  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  37.01 
 
 
329 aa  200  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  37.35 
 
 
331 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  37.46 
 
 
302 aa  172  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  34.48 
 
 
332 aa  166  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  33.84 
 
 
328 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  32.32 
 
 
323 aa  162  7e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  32.01 
 
 
323 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 
316 aa  160  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  36.07 
 
 
323 aa  159  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  31.19 
 
 
326 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  32.31 
 
 
325 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  30.65 
 
 
325 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  31.89 
 
 
325 aa  153  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  31.09 
 
 
340 aa  153  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  33.03 
 
 
328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  31.58 
 
 
325 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  30.21 
 
 
325 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  30.65 
 
 
325 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  33.73 
 
 
342 aa  149  6e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  32.92 
 
 
325 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  32.92 
 
 
325 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  29.97 
 
 
326 aa  146  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  30.67 
 
 
325 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  30.51 
 
 
325 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  32.05 
 
 
317 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  34.47 
 
 
345 aa  143  3e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  29.91 
 
 
327 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  31.21 
 
 
328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  32.02 
 
 
317 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0108  ornithine cyclodeaminase  26.11 
 
 
336 aa  132  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00211883  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0104  ornithine cyclodeaminase  26.11 
 
 
336 aa  132  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0246437  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  34.07 
 
 
346 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  33.02 
 
 
358 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0007  ornithine cyclodeaminase  33.77 
 
 
317 aa  129  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337644  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4147  ornithine cyclodeaminase  33.77 
 
 
317 aa  129  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  32.34 
 
 
333 aa  129  7.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  32.73 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4431  ectoine utilization protein EutC  31.71 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  30.16 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  30.16 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  29.97 
 
 
316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  27.73 
 
 
314 aa  127  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  33.82 
 
 
358 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  31.86 
 
 
319 aa  126  6e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  33.66 
 
 
338 aa  125  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.38 
 
 
332 aa  126  7e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  30.85 
 
 
316 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  30.49 
 
 
329 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  31.61 
 
 
323 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  33.96 
 
 
325 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  31.91 
 
 
323 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  34.25 
 
 
323 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  33.88 
 
 
320 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  32.92 
 
 
357 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 
323 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  31.75 
 
 
321 aa  123  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.43 
 
 
323 aa  123  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  33.46 
 
 
358 aa  123  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  32.7 
 
 
333 aa  123  5e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  33.08 
 
 
345 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  31.5 
 
 
318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  31.21 
 
 
329 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  29.33 
 
 
365 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6949  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.21 
 
 
336 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  33.09 
 
 
358 aa  119  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  32.54 
 
 
330 aa  119  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0589  ornithine cyclodeaminase  27.24 
 
 
337 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  35.15 
 
 
330 aa  119  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_54222  ornithine cyclodeaminase  30.63 
 
 
346 aa  118  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00875  ornithine cyclodeaminase protein  27.22 
 
 
340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0180159  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2150  ectoine utilization protein EutC  32.35 
 
 
327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553131  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  31.75 
 
 
336 aa  117  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  32.13 
 
 
323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  31.97 
 
 
321 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  30.48 
 
 
351 aa  116  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  27.84 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  31.44 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6144  ectoine utilization protein EutC  34.08 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  30.77 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.44 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3863  ectoine utilization protein EutC  32.76 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  30.63 
 
 
326 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  31.27 
 
 
350 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  25.47 
 
 
316 aa  113  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>