274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4418 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 331 aa  683    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  74.16 
 
 		 329 aa  525  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  35.87 
 
 		 326 aa  209  6e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  36.78 
 
 		 326 aa  209  6e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  37.65 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  37.23 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  37.35 
 
 		 331 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  34.15 
 
 		 321 aa  184  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  36 
 
 		 320 aa  182  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  33.74 
 
 		 330 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  34.65 
 
 		 321 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  33.75 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  35.49 
 
 		 359 aa  177  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  33.87 
 
 		 330 aa  176  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  31.87 
 
 		 323 aa  175  9e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  34.64 
 
 		 330 aa  175  9e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2150  ectoine utilization protein EutC  36.81 
 
 		 327 aa  173  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  35.91 
 
 		 319 aa  172  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  31.85 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  33.94 
 
 		 345 aa  170  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  31.38 
 
 		 321 aa  169  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  32.31 
 
 		 330 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  33.45 
 
 		 315 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  35.04 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.56 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  34.83 
 
 		 333 aa  168  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  33.45 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2702  ornithine cyclodeaminase  34.31 
 
 		 321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.430916 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  34.12 
 
 		 319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  34.53 
 
 		 329 aa  166  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  31.69 
 
 		 329 aa  165  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  33.43 
 
 		 330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  30.89 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  35.32 
 
 		 333 aa  164  3e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  33.13 
 
 		 329 aa  162  6e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  33.54 
 
 		 338 aa  162  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  31.19 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  30.89 
 
 		 325 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  30.89 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  30.89 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  31.19 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  31.16 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6144  ectoine utilization protein EutC  35.08 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  31.6 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  32.48 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  31.75 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  31.16 
 
 		 325 aa  155  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  33 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  32.09 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  32.84 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  31.9 
 
 		 325 aa  153  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  30.89 
 
 		 332 aa  152  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  31.15 
 
 		 345 aa  152  7e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  30.56 
 
 		 325 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  30.24 
 
 		 340 aa  149  5e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  31.86 
 
 		 316 aa  149  7e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4147  ornithine cyclodeaminase  30.82 
 
 		 317 aa  149  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0007  ornithine cyclodeaminase  30.82 
 
 		 317 aa  149  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337644  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  33.23 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  32.58 
 
 		 324 aa  146  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3863  ectoine utilization protein EutC  33.55 
 
 		 333 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  32.79 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  28.35 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  32.84 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6649  ectoine utilization protein EutC  34.77 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  32.63 
 
 		 323 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5775  ectoine utilization protein EutC  35.38 
 
 		 334 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0743164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  30.03 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6019  ectoine utilization protein EutC  34.77 
 
 		 334 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  29.97 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  31.85 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4431  ectoine utilization protein EutC  30.49 
 
 		 330 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  29.97 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  31.55 
 
 		 323 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2555  ornithine cyclodeaminase  31.64 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5804  ectoine utilization protein EutC  35.06 
 
 		 334 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6168  ectoine utilization protein EutC  35.06 
 
 		 334 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.43 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  31.05 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4693  ornithine cyclodeaminase  34.96 
 
 		 349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  30.54 
 
 		 327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0057  ectoine utilization protein EutC  31.48 
 
 		 333 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181166  hitchhiker  0.00302085 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  32.22 
 
 		 336 aa  129  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  32.22 
 
 		 336 aa  129  5.0000000000000004e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3176  ectoine utilization protein EutC  31.05 
 
 		 327 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  31.61 
 
 		 326 aa  129  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_003296  RS00875  ornithine cyclodeaminase protein  28.96 
 
 		 340 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0180159  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  32.66 
 
 		 350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  32.39 
 
 		 350 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5200  ornithine cyclodeaminase  28.21 
 
 		 337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.65234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2974  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.76 
 
 		 334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0589  ornithine cyclodeaminase  27.74 
 
 		 337 aa  126  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_54222  ornithine cyclodeaminase  30.87 
 
 		 346 aa  125  8.000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  29.36 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  31.98 
 
 		 354 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  34.27 
 
 		 329 aa  123  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  27.52 
 
 		 317 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  30.92 
 
 		 365 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  33.79 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0104  ornithine cyclodeaminase  27.44 
 
 		 336 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0246437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>