266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3998 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3998  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 		 321 aa  653    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  30.37 
 
 		 326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  32.37 
 
 		 320 aa  122  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0589  ornithine cyclodeaminase  26.51 
 
 		 337 aa  119  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  28.83 
 
 		 324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5200  ornithine cyclodeaminase  28.02 
 
 		 337 aa  116  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.65234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  27.27 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  32.34 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6949  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.49 
 
 		 336 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1163  ornithine cyclodeaminase  26.63 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2974  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.96 
 
 		 334 aa  108  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  29.87 
 
 		 319 aa  108  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  25.16 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0104  ornithine cyclodeaminase  24.71 
 
 		 336 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0246437  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0108  ornithine cyclodeaminase  24.71 
 
 		 336 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00211883  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  27.83 
 
 		 319 aa  102  6e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  25.16 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  28.43 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  28.43 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4593  ornithine cyclodeaminase  25.92 
 
 		 373 aa  99.8  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1530  ornithine cyclodeaminase  25.24 
 
 		 314 aa  97.4  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0391409  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_003296  RS00875  ornithine cyclodeaminase protein  23.49 
 
 		 340 aa  93.6  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0180159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  30.13 
 
 		 311 aa  92.8  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00361  ornithine cyclodeaminase  27.14 
 
 		 349 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  26.58 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  28.01 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  25.78 
 
 		 329 aa  90.5  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  29.13 
 
 		 326 aa  89  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  26.2 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3075  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.54 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  28.05 
 
 		 346 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  27.89 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1795  ornithine cyclodeaminase  34.07 
 
 		 366 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.419928  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3754  ornithine cyclodeaminase mu-crystallin  26.71 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00106555  normal  0.298115 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  27.1 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  25.68 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  28.92 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  26.58 
 
 		 354 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  31.06 
 
 		 302 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  26.83 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1206  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.31 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  27.17 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  28.71 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  29.76 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  26.42 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  27.24 
 
 		 358 aa  82.8  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  28.21 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  25.93 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  27.99 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  24.1 
 
 		 324 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  26.06 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.09 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.534041  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  28.46 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  25.56 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  27.36 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1116  ornithine cyclodeaminase  24.7 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00262553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  25.71 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  34.39 
 
 		 323 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0340  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.55 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.826722 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1163  ornithine cyclodeaminase  33.09 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.833995  decreased coverage  0.00431249 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  27.01 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  27.53 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  27.21 
 
 		 353 aa  79  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  24.92 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4637  ornithine cyclodeaminase  26.79 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0589367  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  33.58 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  26.41 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1864  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.38 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  24.26 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1184  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.37 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0433932  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  26.79 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0121  ornithine cyclodeaminase  32.85 
 
 		 382 aa  75.9  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.27 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1386  ornithine cyclodeaminase  31.37 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4693  ornithine cyclodeaminase  27.55 
 
 		 349 aa  75.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2754  ornithine cyclodeaminase  23.75 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  25.91 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  26.38 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  25.9 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0461  ornithine cyclodeaminase  25.48 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  25.49 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0057  ectoine utilization protein EutC  34.02 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181166  hitchhiker  0.00302085 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2542  ornithine cyclodeaminase  24.58 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  25.45 
 
 		 325 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  25 
 
 		 320 aa  72.4  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  25.76 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.67 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2960  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family/ornithine cyclodeaminase family protein  24.81 
 
 		 707 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.76325  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0300  ornithine cyclodeaminase  27.13 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5043  Ornithine cyclodeaminase  30.53 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0731505  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2310  ornithine cyclodeaminase  26.4 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3943  ornithine cyclodeaminase  24.75 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1673  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.46 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.24 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3492  ornithine cyclodeaminase  24.24 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0249147 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  25.54 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  25.54 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  27.36 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  30.23 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1900  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  25.09 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>