248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0300 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0300  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 288 aa  578  1e-164  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1433  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  72.32 
 
 		 289 aa  410  1e-114  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0971138  hitchhiker  0.00877932 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1900  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  68.17 
 
 		 289 aa  412  1e-114  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1192  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  74.39 
 
 		 289 aa  403  1e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  37.96 
 
 		 302 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0244  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.18 
 
 		 304 aa  115  7.999999999999999e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0626622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  30.45 
 
 		 319 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1799  ornithine cyclodeaminase  32.06 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  30 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  33.83 
 
 		 333 aa  102  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  29.11 
 
 		 320 aa  96.7  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  31.43 
 
 		 328 aa  96.3  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  31.4 
 
 		 338 aa  96.3  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  29.96 
 
 		 324 aa  95.1  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  32.54 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  29.08 
 
 		 326 aa  92.8  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  29.69 
 
 		 326 aa  90.9  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3534  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.82 
 
 		 328 aa  89.4  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.492943  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  30.04 
 
 		 326 aa  89  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  27.11 
 
 		 326 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.57 
 
 		 313 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  27.78 
 
 		 318 aa  85.9  8e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  29.14 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.19 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  35.48 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  30.69 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  28.78 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  29.13 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  31.33 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.04 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.51 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  32.73 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  30.45 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3998  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.13 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  31.56 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1731  ornithine cyclodeaminase  28.62 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.734503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1566  ornithine cyclodeaminase  27.36 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  30.61 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  27.64 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3121  ornithine cyclodeaminase  29.29 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135549 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  28.73 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  32.87 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  31.02 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.47 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  29.32 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  28 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  29.29 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  29.29 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  25.99 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3343  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  36.48 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0515229 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  27.64 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34775  predicted protein  27.74 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1386  ornithine cyclodeaminase  30.2 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.17 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  30.77 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1371  ornithine cyclodeaminase  38.36 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  28.67 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1291  ornithine cyclodeaminase  38.99 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  30.61 
 
 		 308 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  29.64 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  26.48 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  27.68 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  27.66 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2543  ornithine cyclodeaminase  39.1 
 
 		 370 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0739347  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  33.2 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4650  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.49 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1715  ornithine cyclodeaminase  31.19 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  28.38 
 
 		 345 aa  72.4  0.000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  27.33 
 
 		 329 aa  72  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  27.64 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  27.64 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  26.45 
 
 		 325 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  28.75 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1457  ornithine cyclodeaminase  35.22 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4344  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.19 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2316  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.11 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3634  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.59 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  28.78 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  27.11 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1031  ornithine cyclodeaminase  38.99 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1290  ornithine cyclodeaminase  38.99 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  27.8 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2173  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.47 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0536  ornithine cyclodeaminase  38.99 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3400  ornithine cyclodeaminase  33.75 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375473 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0266  ornithine cyclodeaminase  38.99 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3126  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.4 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5043  Ornithine cyclodeaminase  30.96 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0731505  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  28.33 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798228  normal  0.736679 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0899  ornithine cyclodeaminase  27.72 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  25.66 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3962  ornithine cyclodeaminase  28.21 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  25.95 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  26.6 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  26.69 
 
 		 316 aa  67  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  25.34 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  28.33 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3083  ornithine cyclodeaminase  25.97 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  24.51 
 
 		 324 aa  67  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1185  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.05 
 
 		 316 aa  67  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>